Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ANKS1A_0001000

Sequence Length

1813 nt

GC Content

0.5549

CAUGUGGAGAGGGCCAAAUGUGAACUGUGUUGACAGCACUGGCUACACACCCCUGCACCAUGCUGCUUUGAAUGGCCAUAAGGAUGUGGUCGAGGUUCUUCUGAGGAACGAUGCGCUGACCAACGUGGCUGACUCAAAAGGCUGCUACCCUCUGCAUUUGGCAGCCUGGAAAGGAGAUGCCCAGAUAGUGCGGUUGCUCAUCCAUCAAGGGCCUUCACACACCAGAGUCAAUGAACAGAACAAUGACAACGAGACAGCCCUGCAUUGUGCAGCGCAGUAUGGCCACACAGAGGUGGUGAAGGUGCUCUUAGAGGAGCUGACGGACCCCACCAUGCGCAACAACAAAUUCGAGACCCCUUUGGACCUGGCAGCACUGUACGGGCGACUGGAGGUGGUGAAAAUGCUCCUUAAUGCACACCCCAACCUCCUGAGCUGCAACACUAAGAAGCACACCCCUCUGCACUUGGCAGCAAGGAAUGGCCACAAAGCCGUGGUCCAGGUCCUCCUCGAUGCUGGCAUGGACAGCAACUACCAGACGGAGAUGGGCAGUGCUUUGCAUGAGGCUGCUUUGUUUGGCAAGACCGAUGUGGUGCAAAUCCUGCUGGCUGCAGGAACUGACGUCAACAUAAAAGAUAACCAUGGACUGACUGCCCUAGACACUGUUCGGGAACUGCCUUCUCAAAAGAGCCAGCAAAUAGCAGCAUUAAUUGAAGAUCACAUGACUGGAAAAAGAAGUACAAAAGAAGUAGAUAAAACCCCCCCACCCCAGCCACCUCUCAUCUCCAGUAUGGACUCCAUAUCACAGAAGUCUCAGGGUGACGUGGAGAAAGCAGUGACUGAACUGAUUAUAGAUUUUGAUGCAAAUGCUGAAGAAGAGGGUCCCUACGAAGCUCUGUAUAAUGCCAUCUCCUGCCAUUCGUUGGACAGCAUGGCCAGCGGGCGAUCAUCUGACCAAGACUCCACGAACAAGGAGGCUGAGGCAGCAGGAGUGAAACCUGCUGGAGUGAGGCCUAGGGAACGUCCACCACCUCCAGCAAAGCCACCGCCCGAUGAAGAGGAAGAAGACCACAUAGAUAAGAAGUAUUUUCCCUUGACAGCUUCUGAGGUUCUGUCCAUGAGACCUAGGAUUCAUGGGAGUGCAGCCCGGGAAGAAGACGAACACCCUUAUGAACUGUUGUUAACAGCAGAGACAAAGAAAGUGGUGUUGGUGGAUGGAAAAACAAAAGACCACAGGCGGAGCAGCAGCAGCCGGAGCCAGGACUCUGCGGAGGGGCAGGACGGGCAGGUCCCAGAGCAGUUCUCAGGCCUCCUCCACGGCUCCUCCCCGGUGUGCGAGGUGGGGCAGGACCCUUUCCAGCUGCUCUGUACCGCUGGCCAGAGCCAUCCAGACGGGUCCCCCCAGCAGGGCGCCUGCCACAAGGCCAGCAUGCAGCUGGAGGAGACGGGUGUGCAUGCUCCUGGAGCCUCCCAGCCCAGUGCCCUGGACCAGAGCAAGAGAGUGGGCUACCUCACAGGCCUGCCCACCACCAACAGCCGCUCGCACCCUGAAACUUUGACUCACACAGCAUCUCCGCACCCUGGUGGUGCUGAGGAAGGAGACCGGAGUGGGGCCAGGAGCCGAGCGCCUCCCACUAGCAAACCCAAAGCUGAACUCAAACUCAGCCGCAGCUUGUCCAAGUCUGACUCUGAUCUCCUGACCUGCUCACCCACAGAGGACGCUACCAUGGGGAGUCGGAGUGAGUCCUUAUCCAACUGCAGCAUUGGGAAGAAAAGGCUAGAGAAGUCACCCUCCUUCGCCUCGGAGUGGGAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-628.04 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -657.44

Frequency: 0.0000

Diversity: 472.64

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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