Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_APP_0006500
Sequence Length
368 nt
GC Content
0.5326
UUCCUACAACAGCAGCCAGUACCCCUGAUGCCGUUGACAAGUAUCUCGAGACACCUGGGGAUGAGAAUGAACAUGCCCAUUUCCAGAAAGCCAAAGAGAGGCUUGAGGCCAAGCACCGAGAGAGAAUGUCCCAGGUCAUGAGAGAAUGGGAAGAGGCAGAACGUCAAGCAAAGAACUUGCCUAAAGCUGAUAAGAAGGCAGUUAUCCAGCAUUUCCAGGAGAAAGUGGAAUCUUUGGAACAGGAAGCAGCCAACGAGAGACAGCAGCUGGUGGAGACACACAUGGCCAGAGUGGAAGCCAUGCUCAAUGACCGCCGCCGCCUGGCCCUGGAGAACUACAUCACCGCUCUGCAGGCUGUUCCUCCUCGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-104.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -112.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 71.4
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((.((((.(((..(((.....))).))).))))...))...(.((((....(((((((((..............)))))))))....((((((((..(((((....)))))..)...........(((((..((....))...)))))..((((((....((.......))..))))))...((((((((........)))).))))..(((((........))))))))))))...(((((.(((((.........(((.(((.(((((((.....((.((((((.((((..(((((.....)))...))..)))))))))).)).....))...)))))))))))..)))))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..,,.((((.(((..(((.....))).))).)))).{{{{{.((((..,....(((((((((.{.......,,.}.)))))))))....,,...)))).}))}|..,....}})(((((.{,.....(((((..((....}},,.)))))..((((((....{{.......}}..))))))...((((((((........))))||)))..(((((,,,,,...,,,,,}}}))))),.,(({{((((((....,,,{.{{(.{(,{((((,,(.....((.((((((.((((..(((((.....)))...))..)))))))))).)).....},.},))))})))))),.))))))))))})))))
Back