Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ATXN10_0003400
Sequence Length
339 nt
GC Content
0.4041
GAACUUGGAUACGAUUGGUGUUGCUGUUGAUUUGAUUCUUCUGUUUCGUGAACUGCGAGUGGAACAGGAAUCUCUGUUGACAGCUUUUCGCUGUGGCCUGCAGUUUUUAGGCAACAUUGCCUCACGGAAUGAAGAUUCCCAGUCUAUUGUUUGGGUGCAUGCUUUCCCAGAACUGUUUUUGUCUUGCUUAAAUCAUCCGGACAAAAAAAUUGUUGCCUACUCUUCAAUGAUUUUGUUUACAUCCCUUAAUCAUGAAAGAAUGAAAGAACUGGAGGAGAACCUCAAUAUUGCAAUUGAUGUCAUAGAUGCUUACCAAAAACAUCCUGAAUCAGAAUGGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-75.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -83.93
Frequency: 0.0000
Diversity: 95.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((....)))))(((...(((((((((..(((((..(((((((((........).)))))))))))))...)))))))))......(((((.(((.((((((((((((((((.........(((((....)))))((((......((((((..........))))))))))(((((((((..............)))))))))...))))))))..((((..((((((..(.........)..))))))..))))....)))))))).)))...((.(((((......))))).)))))))..............(((.(((...))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,..,,({,,.|,,,|{({|,.(((((((((..(((((,,(((((((((.....,},},}))))))))))))...)))))))))....,}||||{{(({.((((((((((((((((.........(((((....))))){{{{.....,((((((.,........))}}}}}}}}{{(((((({.|.......,,.},))))))))}...))))))))}.((((..((((((..{.........}..))))))..))))....,))))))),|||....|,||{{{......}}|||,}|||..{{{{.,{......,.}))),|}}})))}...}))}
Back