Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0003400

Sequence Length

514 nt

GC Content

0.4261

CUAAACCAGGUGGACAGGUGAAAUGUCAGUAUAUCUCUGCUGUGGAUAAAGUUAUAUUUGUGGAUGAUUAUGCAGUAGGGUGUAGGAAGGACCUUAAUGGAAUCUUGUUGUUAGACACUGCUCUGCAAACUCCAGUUUCAAAGCAGGAUGAUGUGGUUCAGCUUGAAUUACCCGUUACAGAGGCACAGCAGCUCUUAUCAGCAUGUUUAGAAAAGGUAGAUAUUUCUAGUACAGAGGGUUAUGAUUUGUUCAUCACACAGCUCAAAGAUGGUUUAAAAAAUACAUCUCAUGAGACUGCAGCAAACCACAAAGUUGCUAAGUGGGCCACAGUUACAUUUCAUCUUCCUCAUCAUGUGUUGAAGUCCAUUGCCAGUGCCAUUGUAAAUGAACUCAAGAAAAUAAAUCAAAAUGUUGCUGCCUUACCUGUGGCGUCCUCAGUGAUGGACAGAUUGUCUUACCUCUUACCUAGUGCACGUCCAGAACUCGGAGUGGGGCCAGGCCGUUCUGUAGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-125.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -135.5

Frequency: 0.0000

Diversity: 161.76

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(...........((((.......))))...........)((((..............((.((((((....((((.(((((((((((((..(((((....((((..(((((..(((..(((((.(((....(((.(((....))).)))....((((((((...))))))))...........))).))))).)))...))))).))))....))))).....)))))).)))(((((...((((((((((((((((.(((((((.(((((..((....))..)))))..)))).))).......((((...........))))(((((((...........((((..(((...)))..))))........(((((.((((...........................)))).)))))......))))))).......))))))))))))))))....)))))..)))).)))))))))).))((((((((((.......)))))))).))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(.......,.,,((((.......))))....,,.,,..)((((.,,,,.........|(.((((((....((((.(((({{({((({(,,((({{....{({{,.(((((.,{{|..(((((.(({,{{{,,,.|||}}}.}))})||{,..((((((({...}))))))).,|||{,,{.{|||,}||||.},}...|}}}|,||}|,,,.|}}}}.....)))))).}}){((((,..(((({{((({{{((((.(((((((.(((((..((....))..)))))..)))).))).((({,,(......}))))).,||{|{{{{{{{..|||..,,,,,,||,,|,,...}))||))}|,.,,|||,{{{{|.||||},.},}}.,,,,,,.............,,}),}}}}||,....}}))))),|||...}}))}))))))))))),,,.)))))..)))).)))))))))).)}({((((({((.......))}))))).})))))