Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0003900

Sequence Length

1152 nt

GC Content

0.4392

CUAAACCAGGUGGACAGGUGAAAUGUCAGUAUAUCUCUGCUGUGGAUAAAGUUAUAUUUGUGGAUGAUUAUGCAGUAGGGUGUAGGAAGGACCUUAAUGGAAUCUUGUUGUUAGACACUGCUCUGCAAACUCCAGUUUCAAAGCAGGAUGAUGUGGUUCAGCUUGAAUUACCCGUUACAGAGGCACAGCAGCUCUUAUCAGCAUGUUUAGAAAAGGUAGAUAUUUCUAGUACAGAGGGUUAUGAUUUGUUCAUCACACAGCUCAAAGAUGGUUUAAAAAAUACAUCUCAUGAGACUGCAGCAAACCACAAAGUUGCUAAGUGGGCCACAGUUACAUUUCAUCUUCCUCAUCAUGUGUUGAAGUCCAUUGCCAGUGCCAUUGUAAAUGAACUCAAGAAAAUAAAUCAAAAUGUUGCUGCCUUACCUGUGGCGUCCUCAGUGAUGGACAGAUUGUCUUACCUCUUACCUAGUGCACGUCCAGAACUCGGAGUGGGGCCAGGCCGUUCUGUAGACAGAUCACUGAUGUAUAGUGAAGCUAACAGACGGGAGACAUUUACCUCAUGGCCUCAUGUAGGCUAUAGGUGGGCACAACCAGAUCCCAUGGCUCAAGCUGGAUUUUAUCAUCAGCCUGCCUCAUCUGGAGAUGAUAGAGCCAUGUGUUUUACUUGUAGUGUAUGCCUCGUUUGUUGGGAACCUACUGAUGAACCUUGGUCUGAACACGAAAGACAUUCCCCAAACUGCCCAUUUGUGAAAGGUGAGCACACACAGAAUGUGCCAUUGUCAGUCACUCUUGCAACAAGUCCUGCACAGUUUCCUUGUACGGAUGGAACUGACAGAAUAUCUUGCUUUGGGUCGGGGAGCUGCCCUCAUUUUCUAGCUGCUGCAACUAAACGAGGAAAGAUCUGCAUAUGGGAUGUUUCCAAACUUAUGAAGGUGCACUUAAAGUUUGAAAUUAAUGCCUAUGAUCCAGCAAUUGUACAACAGCUUAUUCUAUCAGGAGACCCAAGCUCAGGAGUUGAUUCAAGGAGACCAACUUUGGCGUGGCUGGAGGACUCCUCUAGUUGCUCAGAUAUACCAAAAUUGGAAGGAGAUAGUGAUGAUUUACUGGAGGAUUCAGACAGUGAAGAGCAUUCCAGAUCAGAUUCUGUGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-322.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -346.94

Frequency: 0.0000

Diversity: 235.24

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((..(((((((((.(((.((.((((((..((((((.(((((((.(((....((((....))))...)))..)))))))))))))...((((((.....))..))))...((.((((((.((((((((..((((((.......(((((((((((.((((((((((((........((((((((((.((((((((......))).))).......((((((((.((((......(((((...((((((((((((((((.(((((((.(((((..((....))..)))))..)))).))).......((((...........))))(((((((...........((((..(((...)))..))))........(((((.((((...........................)))).)))))......))))))).......))))))))))))))))....)))))..(((.((.(((.(((.......))))))..)).)))((((.((((((.(...((((((.....)))))).))).)))))))))))).))))))))..))))))).)))))(((((.(((((......)))...)).))))))))))))))))).))))))...))))).....)))))).)).))))))...)))))).)).....((((..(((..(((((((((.......)))))))))...)))....))))....))))))...))..))).))))))......))).))(...((((((((.(((((..((..(((.(.((((...(((.(((((....(((((((.(((.((((((..(((.....(((..(((((..((((((.(((.((..((((.(((....((....))....))).))))..)).))).)..(((((..(((((.((((((...(((.....))).))))))))))).....))))))))))))))).)))....))).))))))))).))))))).......))))).)))...))))).)))..))..))))(((((((((((...))))))))))).........(((....)))..(((....(((.(..(((((((...........)))))))..))))))).....).))))))))...)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((..(((((((((.(((.{(.((((((..(((({(,(((((((,.{{...,((((....,,,,}},})}.}))))))))))))),.{(((.((.....))..)))).,.((.((((((.(((((({{..((((((.......(((((,(((((.((((((((((((......{{((((((.(((((.((((......(((((((({,{{{{{,.{.,,,,,.}})))),....(((((..((((..(((...,,,,.(((((((.(((((..((....))..)))))..)))).))).((({,,(......})))))..|||},,..}|,,.}))..)))}..)))))...,,))))))),}....})))..))))).))))}},}}.......................{(((.((((,,(((((((((.{{(..{{{..{||||.|,.{{{,{.........,,|,|,,||,}|||}..}}}.)))|{{{{{{{|,,(((,{((((((.{...((((((.....)))))).})),})))))))|||........))}.})))))))),.,.))))))))))))))))))||.......})).)))))))))))}.}},)))),.))))).....)))))).)}.))))))...)))))).)),{{{.((,{..(((..(((((((((.......)))))))))...))).,..))))},..))))))...)}..))).)))))),.....))).))(...((((((((.{((((..((..(((.{,((((.{,(((.(((((..,.(((((((.{{{.{(((({,,(((...,.,,,..((((,.{((((((.(((.((..((((.(((....((....))....))).))))..)).))).)..(((((,,((((,{((((((...(((.....))).)))))))))))...,.))))))))))))))).}))....))).))})))))).)))))))....},.))))).))).},))))).)))..))..))))(((((((((((...))))))))))).........(({....}))..{{,....{{{.,,.({{{(((,,,..,,{,..}}}))))...},)))),,,,,).))))))))...)