Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0004100

Sequence Length

2697 nt

GC Content

0.4197

CUAAACCAGGUGGACAGGUGAAAUGUCAGUAUAUCUCUGCUGUGGAUAAAGUUAUAUUUGUGGAUGAUUAUGCAGUAGGGUGUAGGAAGGACCUUAAUGGAAUCUUGUUGUUAGACACUGCUCUGCAAACUCCAGUUUCAAAGCAGGAUGAUGUGGUUCAGCUUGAAUUACCCGUUACAGAGGCACAGCAGCUCUUAUCAGCAUGUUUAGAAAAGGUAGAUAUUUCUAGUACAGAGGGUUAUGAUUUGUUCAUCACACAGCUCAAAGAUGGUUUAAAAAAUACAUCUCAUGAGACUGCAGCAAACCACAAAGUUGCUAAGUGGGCCACAGUUACAUUUCAUCUUCCUCAUCAUGUGUUGAAGUCCAUUGCCAGUGCCAUUGUAAAUGAACUCAAGAAAAUAAAUCAAAAUGUUGCUGCCUUACCUGUGGCGUCCUCAGUGAUGGACAGAUUGUCUUACCUCUUACCUAGUGCACGUCCAGAACUCGGAGUGGGGCCAGGCCGUUCUGUAGACAGAUCACUGAUGUAUAGUGAAGCUAACAGACGGGAGACAUUUACCUCAUGGCCUCAUGUAGGCUAUAGGUGGGCACAACCAGAUCCCAUGGCUCAAGCUGGAUUUUAUCAUCAGCCUGCCUCAUCUGGAGAUGAUAGAGCCAUGUGUUUUACUUGUAGUGUAUGCCUCGUUUGUUGGGAACCUACUGAUGAACCUUGGUCUGAACACGAAAGACAUUCCCCAAACUGCCCAUUUGUGAAAGGUGAGCACACACAGAAUGUGCCAUUGUCAGUCACUCUUGCAACAAGUCCUGCACAGUUUCCUUGUACGGAUGGAACUGACAGAAUAUCUUGCUUUGGGUCGGGGAGCUGCCCUCAUUUUCUAGCUGCUGCAACUAAACGAGGAAAGAUCUGCAUAUGGGAUGUUUCCAAACUUAUGAAGGUGCACUUAAAGUUUGAAAUUAAUGCCUAUGAUCCAGCAAUUGUACAACAGCUUAUUCUAUCAGGAGACCCAAGCUCAGGAGUUGAUUCAAGGAGACCAACUUUGGCGUGGCUGGAGGACUCCUCUAGUUGCUCAGAUAUACCAAAAUUGGAAGGAGAUAGUGAUGAUUUACUGGAGGAUUCAGACAGUGAAGAGCAUUCCAGAUCAGAUUCUGUGACAGGGCAUACAUCACAGAAGGAAGCCAUGGAAGUAAGCCUUGAUAUAACAGCACUCAGCAUUCUCCAACAGCCAGAAAAACUUCAGUGGGAGAUUGUUGCAAAUGUGCUUGAAGAUACUGUUAAGGAUCUUGAAGAACUUGGGGCAAAUCCUUGUUUAACAAACUCUAAGAGUGAAAAGACAAAGGAAAAGCACCAGGAGCAACACAACAUUCCUUUUCCAUGUUUAUUAGCUGGAGGUUUAUUAACAUAUAAAUCUCCUGCUACCUCACCCAUUAGUAGUAAUUCUCACAGGUCACUGGAUGGUUUAAGCAGAACUCAGGGUGAAAGUAUAUCAGAACAAGGGUCAACUGACAAUGAAUCCUGCACUAAUUCAGAACUAAAUUCUCCUCUGGUAAGGAGGACUUUACCGGUUUUGCUUCUUUAUAGCAUCAAGGAAUCUGAUGAGAAAGCAGGAAAGAUCUUUUCACAGAUGAACAAUAUUAUGAGUAAAAGUUUGCAUGAUGAUGGUUUUACUGUUCCACAGAUUAUUGAAAUGGAGCUGGAUAGUCAGGAGCAGUUGUUAUUGCAGGAUCCUCCUGUGACUUACAUUCAGCAAUUUGCAGAUGCAGCAGCCAACCUUACCUCUCCGGAUUCUGAGAAGUGGAACUCUGUGUUUCCCAAGCCUGGGACUUUGGUUCAGUGCUUGAGGCUGCCAAAGUUUGCAGAGGAGGAGAAUCUUUGUAUAGACUCAAUAACUCCUUGUGCUGACGGAAUUCAUUUGUUGGUAGGACUGCGGACAUGCCCUGUUGAAUCCUUGAGUGCAAUAAAUCAAGUAGAGGCCUUGAAUAAUUUAAAUAAAUUAAACUCUGCACUAUGUAAUAGACGGAAAGGUGAGCUGGAAUCAAAUCUUGCUGUAGUGAAUGGUGCAAAUAUUAGUGUAAUCCAACAUGAAUCACCAGCAGAUGUACAGACUCCUUUAAUAAUUCAGCCUGAGCAGAGGAAUGUUAGUGGUGGAUAUUUAGUGCUUUAUAAAAUGAAUUAUGCCACUCGGAUAGUGACUUUAGAAGAGGAGCCAAUAAAAAUACAACAUAUCAAAGAUCCCCAGGACACAAUUACCUCGCUCAUUUUGCUUCCACCCGAUAUAUUGGAUAAUCGAGAGGAUGACUGUGAGGAACCUAUUGAGGACAUGCAGUUAACCUCAAAGAAUGGUUUUGAGAGAGAAAAAACGUCUGACAUUUCUACUCUUGGACACCUGGUAAUAACCACUCAGGGAGGAUAUGUAAAAAUACUAGAUCUUUCAAACUUUGAAAUUUUGGCCAAAGUGGAGCCUCCCAAAAAGGAGGGCACUGAGGAACAGGACACAUUUGUUUCUGUGAUUUACUGUUCUGGCACAGACAGGCUGUGUGCAUGCACCAAAGGUGGUGAGCUUCAUUUUCUCCAAAUUGGAGGAACCUGUGAUGAUAUUGAUGAAGCUGAUAUACUAGUGGAUGGAUCUCUUUCUAAAGGAAUAGAACCAUCUUCAGAAGGUUCCAAACCUUUAUCAAAUCCUUCAAGUCCUGGCAUUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-769.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -822.24

Frequency: 0.0000

Diversity: 701.65

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((...((....))..)).(((((((((((((((((.(((((((.(((....((((....))))...)))..))))))))))))).((((((...((((((((((((.(.((.((((((.((((((((..((((((.......(((((((((((.((((((((((((........((((((((((.((((((((......))).))).......((((((((.((((......(((((...((((((((((((((((.(((((((.(((((..((....))..)))))..)))).))).......((((...........))))(((((((...........((((..(((...)))..))))........(((((.((((...........................)))).)))))......))))))).......))))))))))))))))....)))))..(((.((.(((.(((.......))))))..)).)))((((.((((((.(...((((((.....)))))).))).)))))))))))).))))))))..))))))).)))))(((((.(((((......)))...)).))))))))))))))))).))))))...))))).....)))))).)).))))))...)))))).))...((((((((((((((((...((.((((.((((.((((.(((((((((((.........((((((.......(((.(((((.....))))).)))......))))))((((..((..(((.(.((((...(((.(((((....(((((((.(((.((((((..(((.....(((..(((((..((((((.(((.((..((((.(((....((....))....))).))))..)).))).)..(((((..(((((.((((((...(((.....))).))))))))))).....))))))))))))))).)))....))).))))))))).))))))).......))))).)))...))))).)))..))..))))(((((((((((...)))))))))))))))))...(((....))).((((((((((..(((.(((.((.(((((((((((((((..((((((((((((......)))).))((((((.(((.((.((...((...)).)))).))).)))))).............(((((.(((((.((................)).))))).))))).....)))))).....)))))))(((((..(((..(..(((((.((...(((((((((.....((((...))))....)))).)))))...)).)))))..)....)))...)))))..((.(((((..((((.((((((((((......)))))))))).))))..((((((...(((.((((((.((.(((....))))).))))...))...)))..))))))..........))))).))(((....)))..)))))))).)).))).)))..))))...))))))(((((((((....)))))))))...((((.......)))).))))).(((((.((((((.............)))))))))))........)))).))))...)))).)).))))).)))...((((((((...(((((((.(........).))))))).))))))))(((..((((((((...))))))))...)))....(((...)))..(((((((((((....((((.((((.(....).)))).))))...(((((((((((((....))))).......(((((((((((((((((((((((((.(((((...((((((((..((((.....((....(((((((((((((((((.....))))))))))(((..((((.......))))....)))((((((.(((((.(((..((.(((((......((((((....))))))...((((..((((...)))).))))(((((((((.(((((....((((((((((.....(((((.....(((.((((......)))).)))))))).......))))).(((((((.((((((((....(((((...(((((((.......)))))))..))))).......))))))))..((((.....))))........)))))))..............................)))))....))).))..)))))))))))))).))..))).))))).))..))))((((.((((((((.(...(((....))).).)))))))).)))).......((((((((((((((((............))))).)))))))).)))((((....))))..)))))))....)).....)))).)))).))))...)))))))))))))))........))))))((.....)).)))))))))(((((((..((((........)))).....)))))))))))))))..)))))).))))).(((((....)))))((((((((((((((((...)))))))...............))))))))).))))))))(.((((((.(((.((((....)))).))).)))))).)).))))))))).....))).....)))))).....))))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

((...((....))..)).((((((((((((((({(,(((((((,.{{...,((((....,,,,}},}}}.}))))))))))))).((((((...,,,{{{{{{({{.,.({.((((((.(((((({{..((((((.......(((((,(((((.((((((((((((......{{((((((.(((((.((((......(((((((({,{{{{{,.{.,,,,,.}})))),....(((((..((((..(((...,,,,.(((((((.(((((..((....))..)))))..)))).))).((({,,(......})))))..|||},,.,}|,,.}))..)))}..}))))...,,))))))),}....})))..))))).))))}},}}.......................{(((.((((,,(((((((((.{{(..{{{..{||||.|,.{{{,{.........,,|,|,,||,}|||}..}}}.)))|{{{{{{{|,,(((,{((((((.{...((((((.....)))))).})),})))))))|||........))}.})))))))),.,.))))))))))))))))})||.......})).)))))))))))}.}},)))),.))))).....)))))).)}.))))))...)))))}.||,,.,,((((((((.,,(({(((((({,.,,..|||||},,,...|||{{,|.,,,....,{|{{{{.......(((.(((((.....))))).))).,,,,,|}}|||((((..((..(((.{,((((.{,(((.(((((..,.(((((((.{{{.{((({{,,{((...{.,{{..((((,.{((((((.(((.((..((((.(((....((....))....))).))))..)).})).)..(((((,,((((,{((((((...(((.....))).)))))))))))...,.))))))))))))))}.}}}....))).}}}))))}}.)))))))....},.))))).))).},))))).)))..))..))))(((((((((((...)))))))))))}}}},....(({....})).((((((((((..(((.(((.((.((((((((,.((((({.,,{{.,(((({{.....,||||,||{{(({{.{{|.||,||},,,....,,.)))),))}.}|||||,,,,...{{(((,(((((.(((((.{(....,{,....,}.,.)).))))).))))).....))}||(.(((({.((....)).})))).},|..(((((.((...(((((((((.....((((...))))....))))}}})))...)).)))))..}.....,,.....},,.,|,.}}}|,..((((.((((((((((......)))))))))).))))..((((((.,.{{{.{{{{,{,((.(((....))))).))|},..,,.,,))}..))))))...,,,,,,,,,,,,.})|}|.,))).,..)))))))).)).))).)))..))))...)))))){{(((((((....)))))))||{(((((((.(((((.((((((((({{((({.{{{{{,,{,,{{...,.||})))))))))){({(,.((((((,{({{,....})})}),)))})}}}},.((((((((...(((((((.(........).))))))).)))))))){((..{(((((((...))))))))...})},((((((.,{(((((((...((((((......((.((((.{....}.)))).)}(((((.....)))))}((((((({({((....)))))).))))).))))))....)))))))||(((({{(,.(((......})).}).....)))))|.|||||{{{{{..,,,))))))))})}},,,{|{,...}})}})))))),))))))),))).)))))..)))))))}}}}.,||.{{{(({....,}}))}...,,(({{((((...||..{{{{.{((({{{,,,,...,}..}}})},)))}.||,.}}}|||}}...||,,||||..,,.|||||{{{||||,|||||||{{.,,,.||||||,.....,,|{|,.(((((.((((((((({..(((.((((.{({,(((.,,{,{,,.....,|||||{|,||,,,,||{|..,,||,...)))..))................,...,,,.))))))).}},),.,)).))))))))).,,{||,{{{.,{({{....,}}},...}}..((((.((((((((.(...(((....))).).)))))))).)))).......((((((((((((((((........,...))))).)))))))).)))((((....)))).,,,}||||||,..|||,...,,|{{{|,,|{{({,...|)))}}.}}}}}{|,,||||,.,(((((......))))),)}))}})},,|||},,|}}}))))}..,)))}))}},}}}},}}||||||,....))))))))}}}|||{,..|||}||,((((((((((((((({...}))))))...............})))))))).)).}})}.{.((((((.(((.{(((....)))).))).)))))).),,|||||}}}}.,,,,)),.....)))))).....))))))))))).