Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0009800

Sequence Length

970 nt

GC Content

0.4433

GCACAGCAGCUCUUAUCAGCAUGUUUAGAAAAGGUAGAUAUUUCUAGUACAGAGGGUUAUGAUUUGUUCAUCACACAGCUCAAAGAUGGUUUAAAAAAUACAUCUCAUGAGACUGCAGCAAACCACAAAGUUGCUAAGUGGGCCACAGUUACAUUUCAUCUUCCUCAUCAUGUGUUGAAGUCCAUUGCCAGUGCCAUUGUAAAUGAACUCAAGAAAAUAAAUCAAAAUGUUGCUGCCUUACCUGUGGCGUCCUCAGUGAUGGACAGAUUGUCUUACCUCUUACCUAGUGCACGUCCAGAACUCGGAGUGGGGCCAGGCCGUUCUGUAGACAGAUCACUGAUGUAUAGUGAAGCUAACAGACGGGAGACAUUUACCUCAUGGCCUCAUGUAGGCUAUAGGUGGGCACAACCAGAUCCCAUGGCUCAAGCUGGAUUUUAUCAUCAGCCUGCCUCAUCUGGAGAUGAUAGAGCCAUGUGUUUUACUUGUAGUGUAUGCCUCGUUUGUUGGGAACCUACUGAUGAACCUUGGUCUGAACACGAAAGACAUUCCCCAAACUGCCCAUUUGUGAAAGGUGAGCACACACAGAAUGUGCCAUUGUCAGUCACUCUUGCAACAAGUCCUGCACAGUUUCCUUGUACGGAUGGAACUGACAGAAUAUCUUGCUUUGGGUCGGGGAGCUGCCCUCAUUUUCUAGCUGCUGCAACUAAACGAGGAAAGAUCUGCAUAUGGGAUGUUUCCAAACUUAUGAAGGUGCACUUAAAGUUUGAAAUUAAUGCCUAUGAUCCAGCAAUUGUACAACAGCUUAUUCUAUCAGGAGACCCAAGCUCAGGAGUUGAUUCAAGGAGACCAACUUUGGCGUGGCUGGAGGACUCCUCUAGUUGCUCAGAUAUACCAAAAUUGGAAGGAGAUAGUGAUGAUUUACUGGAGGAUUCAGACAGUGAAGAGCAUUCCAGAUCAGAUUCUGUGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-269.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -286.87

Frequency: 0.0000

Diversity: 211.61

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((......))).))))((((((.........))))))(((.(((((...((((((((((((((((.(((((((.(((((..((....))..)))))..)))).))).......((((...........))))(((((((...........((((..(((...)))..))))........(((((.((((...........................)))).)))))......))))))).......))))))))))))))))....))))))))...))))..(((((((((((((((((.(((...)))..((((....))))((((((.....))))))..((((((((((((.(.(((((((((.(((((((.....)))))))))))))((((.((.((..(.((((((((..((((...........)))).....(((((....)))))..)))))))).).....)).)).)))))))))))))))))))).....(((((.((((((((.((((((.........((((((.......(((.(((((.....))))).)))......))))))((((..((..(((.(.((((...(((.(((((....(((((((.(((.((((((..(((.....(((..(((((..((((((.(((.((..((((.(((....((....))....))).))))..)).))).)..(((((..(((((.((((((...(((.....))).))))))))))).....))))))))))))))).)))....))).))))))))).))))))).......))))).)))...))))).)))..))..))))(((((((((((...)))))))))))))))))...(((....))).......((((((....)))))))))).))))..))))).....)))))).))...).))))).)))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((......))).)))}{((({,.,.,,,...}}))))(((.(((((...((((((((((((((((.(((((((.(((((..((....))..)))))..)))).))).((({{,(......}))))).,{.(|(((((((..,,,......{{{{..{{,...}}).,)}}|,.,{,{,.((((,.{|||,..,,}}.,,,,,..............}))).,}}}}......))))))).,,},..))))))))))))))))....))))))))...))))..((((((((,({({{{(({((({,,|||,,(((({{{.|,,,((((((.....))))))..((((((((((((.{.{{,,{((((.(((((((.....)))))))))))}|((((.{{.{{,..,((((((((..(((({,,....,,,})))).....{((((....)))))..)))))))).).,,,.}),)).))})}}}})}))))))))))....,|{|{|,||||||{{,||{{{{...,.....((((((.......(((.(((((.....))))).)))......))))))((((..((..(((.{,((((.{,(((.(((((..,.(((((((.{{{.{(((({,,(((...,.,,,..((((,.{((((((.(((.((..((((.(((....((....))....))).))))..)).))).)..(((((,,((((,{((((((...(((.....))).)))))))))))...,.))))))))))))))).}))....))).))})))))).)))))))....},.))))).))).},))))).)))..))..))))(((((((((((...)))))))))))}}}}}}...(({....))).......,{((({...,|||||||}}}.}}}}..)))))}}...)})))),},,,,}.))))).)))..