Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0011200

Sequence Length

389 nt

GC Content

0.4653

UGGGCCACAGUUACAUUUCAUCUUCCUCAUCAUGUGUUGAAGUCCAUUGCCAGUGCCAUUGUAAAUGAACUCAAGAAAAUAAAUCAAAAUGUUGCUGCCUUACCUGUGGCGUCCUCAGUGAUGGACAGAUUGUCUUACCUCUUACCUAGUGCACGUCCAGAACUCGGAGUGGGGCCAGGCCGUUCUGUAGACAGAUCACUGAUGUAUAGUGAAGCUAACAGACGGGAGACAUUUACCUCAUGGCCUCAUGUAGGCUAUAGGUGGGCACAACCAGAUCCCAUGGCUCAAGCUGGAUUUUAUCAUCAGCCUGCCUCAUCUGGAGAUGAUAGAGCCAUGUGUUUUACUUGUAGUGUAUGCCUCGUUUGUUGGGAACCUACUGAUGAACCUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-100.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -108.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 105.05

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((..((((((..........((((..(((...)))..))))..((((..((((...))))..)))).(((((((((((((.........((((.(((((.(((((((((.(((..(((..(((((....(((((............)).))).)))))..))).)))(((((((((..((((.((((((.(...((((((.....)))))).))).))))))))(((........))).)))))))))....)))))))))))))))))).......((((((((..((((...........)))).....(((((....)))))..)))))))))))))).)))).)))......((((.....)))).....)))).))..))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

,((,,,{({{{||{{.,,{,.({{{..{{,...}}}.,|}}|{.((((,.{(({...}}}}..}})).||||||{{,,,,,.........((((.(((({,(((((((((.(((..(((..(((((.,..{(({{,..........,}},,}},)))))..))).))}{((((((({..(((,{((((((.{...((((((.....)))))).})),})))))))(((........))).}))))))))....))))))))))))))))))..,,...((((((((..(((({,,....,,,})))).....(((((....)))))..)))))))),)}})}.}}})})))}}..,||},|{{||,|||,,....})))}))}}),..,