Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0011400

Sequence Length

2227 nt

GC Content

0.4243

UGGGCCACAGUUACAUUUCAUCUUCCUCAUCAUGUGUUGAAGUCCAUUGCCAGUGCCAUUGUAAAUGAACUCAAGAAAAUAAAUCAAAAUGUUGCUGCCUUACCUGUGGCGUCCUCAGUGAUGGACAGAUUGUCUUACCUCUUACCUAGUGCACGUCCAGAACUCGGAGUGGGGCCAGGCCGUUCUGUAGACAGAUCACUGAUGUAUAGUGAAGCUAACAGACGGGAGACAUUUACCUCAUGGCCUCAUGUAGGCUAUAGGUGGGCACAACCAGAUCCCAUGGCUCAAGCUGGAUUUUAUCAUCAGCCUGCCUCAUCUGGAGAUGAUAGAGCCAUGUGUUUUACUUGUAGUGUAUGCCUCGUUUGUUGGGAACCUACUGAUGAACCUUGGUCUGAACACGAAAGACAUUCCCCAAACUGCCCAUUUGUGAAAGGUGAGCACACACAGAAUGUGCCAUUGUCAGUCACUCUUGCAACAAGUCCUGCACAGUUUCCUUGUACGGAUGGAACUGACAGAAUAUCUUGCUUUGGGUCGGGGAGCUGCCCUCAUUUUCUAGCUGCUGCAACUAAACGAGGAAAGAUCUGCAUAUGGGAUGUUUCCAAACUUAUGAAGGUGCACUUAAAGUUUGAAAUUAAUGCCUAUGAUCCAGCAAUUGUACAACAGCUUAUUCUAUCAGGAGACCCAAGCUCAGGAGUUGAUUCAAGGAGACCAACUUUGGCGUGGCUGGAGGACUCCUCUAGUUGCUCAGAUAUACCAAAAUUGGAAGGAGAUAGUGAUGAUUUACUGGAGGAUUCAGACAGUGAAGAGCAUUCCAGAUCAGAUUCUGUGACAGGGCAUACAUCACAGAAGGAAGCCAUGGAAGUAAGCCUUGAUAUAACAGCACUCAGCAUUCUCCAACAGCCAGAAAAACUUCAGUGGGAGAUUGUUGCAAAUGUGCUUGAAGAUACUGUUAAGGAUCUUGAAGAACUUGGGGCAAAUCCUUGUUUAACAAACUCUAAGAGUGAAAAGACAAAGGAAAAGCACCAGGAGCAACACAACAUUCCUUUUCCAUGUUUAUUAGCUGGAGGUUUAUUAACAUAUAAAUCUCCUGCUACCUCACCCAUUAGUAGUAAUUCUCACAGGUCACUGGAUGGUUUAAGCAGAACUCAGGGUGAAAGUAUAUCAGAACAAGGGUCAACUGACAAUGAAUCCUGCACUAAUUCAGAACUAAAUUCUCCUCUGGUAAGGAGGACUUUACCGGUUUUGCUUCUUUAUAGCAUCAAGGAAUCUGAUGAGAAAGCAGGAAAGAUCUUUUCACAGAUGAACAAUAUUAUGAGUAAAAGUUUGCAUGAUGAUGGUUUUACUGUUCCACAGAUUAUUGAAAUGGAGCUGGAUAGUCAGGAGCAGUUGUUAUUGCAGGAUCCUCCUGUGACUUACAUUCAGCAAUUUGCAGAUGCAGCAGCCAACCUUACCUCUCCGGAUUCUGAGAAGUGGAACUCUGUGUUUCCCAAGCCUGGGACUUUGGUUCAGUGCUUGAGGCUGCCAAAGUUUGCAGAGGAGGAGAAUCUUUGUAUAGACUCAAUAACUCCUUGUGCUGACGGAAUUCAUUUGUUGGUAGGACUGCGGACAUGCCCUGUUGAAUCCUUGAGUGCAAUAAAUCAAGUAGAGGCCUUGAAUAAUUUAAAUAAAUUAAACUCUGCACUAUGUAAUAGACGGAAAGGUGAGCUGGAAUCAAAUCUUGCUGUAGUGAAUGGUGCAAAUAUUAGUGUAAUCCAACAUGAAUCACCAGCAGAUGUACAGACUCCUUUAAUAAUUCAGCCUGAGCAGAGGAAUGUUAGUGGUGGAUAUUUAGUGCUUUAUAAAAUGAAUUAUGCCACUCGGAUAGUGACUUUAGAAGAGGAGCCAAUAAAAAUACAACAUAUCAAAGAUCCCCAGGACACAAUUACCUCGCUCAUUUUGCUUCCACCCGAUAUAUUGGAUAAUCGAGAGGAUGACUGUGAGGAACCUAUUGAGGACAUGCAGUUAACCUCAAAGAAUGGUUUUGAGAGAGAAAAAACGUCUGACAUUUCUACUCUUGGACACCUGGUAAUAACCACUCAGGGAGGAUAUGUAAAAAUACUAGAUCUUUCAAACUUUGAAAUUUUGGCCAAAGUGGAGCCUCCCAAAAAGGAGGGCACUGAGGAACAGGACACAUUUGUUUCUGUGAUUUACUGUUCUGGCACAGACAGGCUGUGUGCAUGCACCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-619.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -664.06

Frequency: 0.0000

Diversity: 594.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(..(((((((((((((...((((((((..(((.....))).(((.(((((.(((((((((...)))).(((((((((((((.........((((.(((((.(((((((((.(((..(((..(((((....(((((............)).))).)))))..))).)))(((((((((..((((.((((((.(...((((((.....)))))).))).))))))))(((........))).)))))))))....)))))))))))))))))).......((((((((..((((...........)))).....(((((....)))))..)))))))))))))).)))).)))....((((((((((((((.......)))))))))....((((((.........((((((.......(((.(((((.....))))).)))......))))))((((..((..(((.(.((((...(((.(((((....(((((((.(((.((((((..(((.....(((..(((((..((((((.(((.((..((((.(((....((....))....))).))))..)).))).)..(((((..(((((.((((((...(((.....))).))))))))))).....))))))))))))))).)))....))).))))))))).))))))).......))))).)))...))))).)))..))..))))(((((((((((...)))))))))))))))))...(((....))).((((((((((..(((.(((.((.(((((((((((((((..((((((((((((......)))).))((((((.(((.((.((...((...)).)))).))).)))))).............(((((.(((((.((................)).))))).))))).....)))))).....)))))))(((((..(((..(..(((((.((...(((((((((.....((((...))))....)))).)))))...)).)))))..)....)))...)))))..((.(((((..((((.((((((((((......)))))))))).))))..((((((...(((.((((((.((.(((....))))).))))...))...)))..))))))..........))))).))(((....)))..)))))))).)).))).)))..))))...))))))(((((((((....)))))))))...(((((.(((((.(((((((((((((((.((((((.............)))))))))))((((..((((((.(((((....)))).).)))))))))).((((((((...(((((((.(........).))))))).))))))))(((..((((((((...))))))))...)))(((((((.(((((((((...((((((......((.((((.(....).)))).))(((((.....))))).(((((((((.((....)))))).))))).))))))....)))))))))((((..((.(((......))).)).....))))((.((((((((((.....)))))))))).))..(((....)))..)))))))))))))).))).)))))..))))))))))......((((((....))))))......)))))..))))).)))((((((((((((.(((((....((((((((((.....(((((.....(((.((((......)))).)))))))).......))))).(((((((.((((((((....(((((...(((((((.......)))))))..))))).......))))))))..((((.....))))........)))))))..............................)))))....))).))..))))))))...))))..((((....))))........((((.((((((((.(...(((....))).).)))))))).)))).......((((((((((((((((............))))).)))))))).)))((((....))))....)))))))))))))......(((((..((((((...)))))).)))))((..((((...(((((......))))).))))..)).((((((.((....))))))))......((((.(((...))))))))))))).))..)(......)

Thermodynamic Ensemble Prediction

({.(((((((({,{{{.,,,,,,,(((((((((((,{(({{((.((((..((((...})))..)))).)))))}................((((.((((,,(((((((((.(((..(((..(((((.,..{({{{,..........,}|,}|},)))))..))).))}{((((((((..((({{((((((.{...((((((.....)))))).})),})))))))(((........))).}))))))))..,.)))))))))))))))))).......((((((((..(((({,,....,,,})))).....(((((....)))))..)))))))).}{((((((((((((((.,{,.,,(({(({{{({,,,,..,.},,,......}||||.,...,,..,}||,|||,,,,...,{,.((((((((((((({{{(({.,,,.....}}}((((..((..(((.{,((((.{,(((.(((((..,.(((((((.{{{.{(((({,,(((...,.,,,..((((,.{((((((.(((.((..((((.(((....((....))....))).))))..)).))).)..(((((,,((((,{((((((...(((.....))).)))))))))))...,.))))))))))))))).}))....))).})})))))).)))))))....},.))))).))).},))))).)))..))..))))|{{((((((((...)))))))))))))}......(((....))).((((((((((..(((.(((.((.((((((((,.(((({{.,,{{.{(((({{.....,||||,||{{(({{.{{|.||,||},,,....,,.)))),))}.}|||||,,,,...{{(((,(((((.(((((.{(....,{,....,}.,.)).))))).))))).....))}||(.(((({.((....)).})))).},|..(((((.((...(((((((((.....((((...))))....))))}}})))...)).)))))..}......,..,..}},.,|,.}}}},..((((.((((((((((......)))))))))).))))..((((((.,.{{{.{{{{,{,((.(((....))))).))|},..,,.,,))}..))))))...,,,,}},,,,,,.})|}|.}))).,..)))))))).)).))).)))..))))...))))))(((((((((....))))))))){((((((({(,,...,(((({,{....})))))}}}}})}))}}.....)))))))))))))..},))))))))))))))}...,))))))))).)}....((((((((...(((((((.(........).))))))).)))))))){((..{(((((((...)))))))}...}}},((((((.,{(((((((...((((((......((.((((.{....}.)))).)}(((((.....)))))}((((((({({((....)))))).))))).))))))....)))))))||(((({{(,.({{..,...}}).}).....)))))|.||||||{(({.,,,,}}||||}|||,|,,,||{|,,.,}}}|}}}}}}}|||{|{{{|||,,,,.,{{||{|,|{{||,,|||.{{{(({....,}}))}..,|||||,{(({...|}}},|||}{(((,(({({(....,..{{{||{(((,.{{{{.{,{{(,,...,,...||},......))).}.)))))))))))),..))).})))}}}.....,,|||,.(((((.((((((((({..(((.((((.{({,{({.,,{,{,,..,,.,|||||{|,||,,,,||{|..,{||,...)))..))................,...,,,.))))))).}},),.,)).)))))))))..,,}}}||,.,{{||,.,,}))},...,|..((((.((((((((.(...(((....))).).)))))))).))))...,...((((((((((((((((........,...))))).)))))))).))){(((....)))),}},)))}}))}}})))......(((((..(((((,...}))))).)))))((..{{{{...(((((......))))).)))).,)).(((((({{,...}))}})))),.....((({,(((...))))))))))))).))..}|,,....)