Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0013800

Sequence Length

579 nt

GC Content

0.4525

AUCACUGAUGUAUAGUGAAGCUAACAGACGGGAGACAUUUACCUCAUGGCCUCAUGUAGGCUAUAGGUGGGCACAACCAGAUCCCAUGGCUCAAGCUGGAUUUUAUCAUCAGCCUGCCUCAUCUGGAGAUGAUAGAGCCAUGUGUUUUACUUGUAGUGUAUGCCUCGUUUGUUGGGAACCUACUGAUGAACCUUGGUCUGAACACGAAAGACAUUCCCCAAACUGCCCAUUUGUGAAAGGUGAGCACACACAGAAUGUGCCAUUGUCAGUCACUCUUGCAACAAGUCCUGCACAGUUUCCUUGUACGGAUGGAACUGACAGAAUAUCUUGCUUUGGGUCGGGGAGCUGCCCUCAUUUUCUAGCUGCUGCAACUAAACGAGGAAAGAUCUGCAUAUGGGAUGUUUCCAAACUUAUGAAGGUGCACUUAAAGUUUGAAAUUAAUGCCUAUGAUCCAGCAAUUGUACAACAGCUUAUUCUAUCAGGAGACCCAAGCUCAGGAGUUGAUUCAAGGAGACCAACUUUGGCGUGGCUGGAGGACUCCUCUAGUUGCUCAGAUAUACCAAAAUUGGAAGGAGAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-162.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -171.69

Frequency: 0.0000

Diversity: 73.78

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((.....))))))..((((((((((((.(.(((((((((.(((((((.....)))))))))))))((((.((.((..(.((((((((..((((...........)))).....(((((....)))))..)))))))).).....)).)).))))))))))))))))))))...(((.(((((........((((((.........((((((.......(((.(((((.....))))).)))......))))))((((..((..(((.(.((((...(((.(((((....(((((((.(((.((((((..(((.....(((..(((((..((((((.(((.((..((((.(((....((....))....))).))))..)).))).)..(((((..(((((.((((((...(((.....))).))))))))))).....))))))))))))))).)))....))).))))))))).))))))).......))))).)))...))))).)))..))..))))(((((((((((...)))))))))))))))))........))))).)))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((((.....))))))..((((((((((((.{.(({{(((((.(((((((.....))))))))))))}((((.((.(({.,.((((((((..(((({,,....,,.})))).....(((((....)))))..)))))))).)..,,.}).)).))))}}})))))))))))))...(((.(((((........((((((.........((((((.......(((.(((((.....))))).)))......))))))((((..((..(((.{,((((.{,(((.(((((..,.(((((((.{{{.{(((({,,(((...,.,,,..((((,.{((((((.(((.((..((((.(((....((....))....))).))))..)).))).)..(((((,,((((,{((((((...(((.....))).)))))))))))...,.))))))))))))))).}))....))).))})))))).)))))))....},.))))).))).},))))).)))..))..))))(((((((((((...)))))))))))))))))........))))).)))......