Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0018900

Sequence Length

1991 nt

GC Content

0.4159

GUGCACUUAAAGUUUGAAAUUAAUGCCUAUGAUCCAGCAAUUGUACAACAGCUUAUUCUAUCAGGAGACCCAAGCUCAGGAGUUGAUUCAAGGAGACCAACUUUGGCGUGGCUGGAGGACUCCUCUAGUUGCUCAGAUAUACCAAAAUUGGAAGGAGAUAGUGAUGAUUUACUGGAGGAUUCAGACAGUGAAGAGCAUUCCAGAUCAGAUUCUGUGACAGGGCAUACAUCACAGAAGGAAGCCAUGGAAGUAAGCCUUGAUAUAACAGCACUCAGCAUUCUCCAACAGCCAGAAAAACUUCAGUGGGAGAUUGUUGCAAAUGUGCUUGAAGAUACUGUUAAGGAUCUUGAAGAACUUGGGGCAAAUCCUUGUUUAACAAACUCUAAGAGUGAAAAGACAAAGGAAAAGCACCAGGAGCAACACAACAUUCCUUUUCCAUGUUUAUUAGCUGGAGGUUUAUUAACAUAUAAAUCUCCUGCUACCUCACCCAUUAGUAGUAAUUCUCACAGGUCACUGGAUGGUUUAAGCAGAACUCAGGGUGAAAGUAUAUCAGAACAAGGGUCAACUGACAAUGAAUCCUGCACUAAUUCAGAACUAAAUUCUCCUCUGGUAAGGAGGACUUUACCGGUUUUGCUUCUUUAUAGCAUCAAGGAAUCUGAUGAGAAAGCAGGAAAGAUCUUUUCACAGAUGAACAAUAUUAUGAGUAAAAGUUUGCAUGAUGAUGGUUUUACUGUUCCACAGAUUAUUGAAAUGGAGCUGGAUAGUCAGGAGCAGUUGUUAUUGCAGGAUCCUCCUGUGACUUACAUUCAGCAAUUUGCAGAUGCAGCAGCCAACCUUACCUCUCCGGAUUCUGAGAAGUGGAACUCUGUGUUUCCCAAGCCUGGGACUUUGGUUCAGUGCUUGAGGCUGCCAAAGUUUGCAGAGGAGGAGAAUCUUUGUAUAGACUCAAUAACUCCUUGUGCUGACGGAAUUCAUUUGUUGGUAGGACUGCGGACAUGCCCUGUUGAAUCCUUGAGUGCAAUAAAUCAAGUAGAGGCCUUGAAUAAUUUAAAUAAAUUAAACUCUGCACUAUGUAAUAGACGGAAAGGUGAGCUGGAAUCAAAUCUUGCUGUAGUGAAUGGUGCAAAUAUUAGUGUAAUCCAACAUGAAUCACCAGCAGAUGUACAGACUCCUUUAAUAAUUCAGCCUGAGCAGAGGAAUGUUAGUGGUGGAUAUUUAGUGCUUUAUAAAAUGAAUUAUGCCACUCGGAUAGUGACUUUAGAAGAGGAGCCAAUAAAAAUACAACAUAUCAAAGAUCCCCAGGACACAAUUACCUCGCUCAUUUUGCUUCCACCCGAUAUAUUGGAUAAUCGAGAGGAUGACUGUGAGGAACCUAUUGAGGACAUGCAGUUAACCUCAAAGAAUGGUUUUGAGAGAGAAAAAACGUCUGACAUUUCUACUCUUGGACACCUGGUAAUAACCACUCAGGGAGGAUAUGUAAAAAUACUAGAUCUUUCAAACUUUGAAAUUUUGGCCAAAGUGGAGCCUCCCAAAAAGGAGGGCACUGAGGAACAGGACACAUUUGUUUCUGUGAUUUACUGUUCUGGCACAGACAGGCUGUGUGCAUGCACCAAAGGUGGUGAGCUUCAUUUUCUCCAAAUUGGAGGAACCUGUGAUGAUAUUGAUGAAGCUGAUAUACUAGUGGAUGGAUCUCUUUCUAAAGGAAUAGAACCAUCUUCAGAAGGUUCCAAACCUUUAUCAAAUCCUUCAAGUCCUGGCAUUUCAGGAGUUGAUUUAUUGGUGGACCAGCCAUUCACCCUUGAAAUCUUGACAUCCCUAGUGGAGCUAACCCGCUUUGAGACUUUGACUCCAAGGUUUUCAGCGACUGUUCCUCCAUGCUGGGUAGAAGUUCAACAAGAACAGCAGCAAAGGAGGCAUCCUCAACAUUUGCAUCAGCAACACCAUGGUGAUGCUGCUCAGCAUACUCGAACUUGGAAACUACAGACCGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-559.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -599.11

Frequency: 0.0000

Diversity: 437.37

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.......((((((((.....((((.....((((((((..((((((.((((((..(((.((..(((.......)))..))....((((((((...((((.(((((.(((((((((((...))))))))))).........))))).)))).((((((((((..(((.(((.((.(((((((((((((((..((((((((((((......)))).))((((((.(((.((.((...((...)).)))).))).)))))).............(((((.(((((.((................)).))))).))))).....)))))).....)))))))(((((..(((..(..(((((.((...(((((((((.....((((...))))....)))).)))))...)).)))))..)....)))...)))))..((.(((((..((((.((((((((((......)))))))))).))))..((((((...(((.((((((.((.(((....))))).))))...))...)))..))))))..........))))).))(((....)))..)))))))).)).))).)))..))))...))))))(((((((((....)))))))))((((((((.(((((.(((((((((((((((.((((((.............)))))))))))((((..((((((.(((((....)))).).)))))))))).((((((((...(((((((.(........).))))))).))))))))(((..((((((((...))))))))...)))(((((((.(((((((((...((((((......((.((((.(....).)))).))(((((.....))))).(((((((((.((....)))))).))))).))))))....)))))))))((((..((.(((......))).)).....))))((.((((((((((.....)))))))))).))..(((....)))..)))))))))))))).))).)))))..)))))))).))))))))....................((((((((...((..((((.(((((.............))))).)))).))..)))))))).......((((.....((((((((((((.(((((((((.....(((((((.((((((((....(((((...(((((((.......)))))))..))))).......))))))))..((((.....))))........)))))))..............(((((((.....((((..((.....((((((..((.......))......((((....))))........((((.((((((((.(...(((....))).).)))))))).)))).......((((((((((((((((............))))).)))))))).))).)))))).....))..)))).))))))).......(((((..((((((...)))))).)))))((..((((...(((((......))))).))))..))........)))))))))...)))))))).))))...))))))).))))))))))))..(((((....)))))((((((((((((((((...)))))))...............))))))))).....(((((.(((((((......))((((((....(((((.((....)).)))))....)))))).........((((.(((((......))))).))))((((..((((((.......))))))..)))).......))))))))))(((((.....((((..(((((((((....))))))))).))))...)))))....))))))))....((((.....)))).((((.....((((...)))).....))))..(((((.(((....))).)))))....))))..))))))))...........))(....)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.......((((((((.....,(((.....{{((((({..(((((,,((((((..(({.,{.,(((.,....,}}}..||{{{,{(((((((...((({.{((((.(((((((((((...))))))))))).,,,.....|||,,.,))).((((((((((..(((.(((.((.((((((((,.((((({.,,{{.,(((({{.....,||||,||{{(({{.{{|.||,||},,,....,,.)))),))}.}|||||,,,,...{{(((,(((((.(((((.{(....,{,....,}.,.)).))))).))))).....))}||(.(((({.((....)).})))).},|..(((((.((...(((((((((.....((((...))))....))))}}})))...)).)))))..}.....,,.....},,.,|,.}}}|,..((((.((((((((((......)))))))))).))))..((((((.,.{{{.{{{{,{,((.(((....))))).))|},..,,.,,))}..))))))...,,,,,,,,,,,,.})|}|.,))).,..)))))))).)).))).)))..))))...))))))(((((((((....))))))))){(((((((.(((((.(((((((((({((((.((({{,,{,,,,...,.||}))))}))))}((((,.((((((,{({{,....})}),)})))})},}},.((((((((...(((((((.(........).))))))).)))))))){((..((((((((...))))))))...})},((((((.,{(((((((...((((((......((.((((.{....}.)))).)}(((((.....))))),((((((({((((....)))))).))))).))))))....)))))))||(((({{(,.(((......))).)).....)))))|.||||||{{{{..,,,)))))))))),},,}||{....}))},)))))),))))))).))).)))))..)))))))}.)))))))}|||{{.....,,}},,..,.((((((((...{{..((((.,(((({{.......}},.})))}.)))).}}..)))))))).......((({.....{(((((((((((.(((((((((.....,(((({.......,,{,,.(((((.((((((((({..(((.((((.{({,(({.,,{,{,...,..,|||||{|,||,,,,||{|..,,||,...)))..))................,.,.,,,.))))))).}},),.,)).))))))))).,{{||,{{{.,(({{....,}}}....,|..((((.((((((((.(...(((....))).).)))))))).)))).......((((((((((((((((............))))).)))))))).)))((((....)))).,,.)))|}|},..}}|,,....{{{{{..{((((,...}))))}.}}}}}{{,.{|||,..(((((......))))).)}))}})}...}}},.)))))))))...)))))))).)))}.,,)}})})).))))))))))))..(((({..,,))||}((((((((((((((({...})))))),..............})))))))).,,..(((((.((((({,.....,||((((((....(((((.((....)).)))))....)))))).........((((.(((((,....,))))).)))),{{{..((((((.......))))))..)))).......))))))))))((((,.,{,.((((..(((((((((....))))))))).))))...))),)}}},||||))||,,..((((.....)))).{{{({,.,,(({{...)))}.....,|||{{((,({.,,,..}},))}))))))),,))))..))))))))...........))(....)