Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0020100
Sequence Length
2526 nt
GC Content
0.4113
UGAUGAUUUACUGGAGGAUUCAGACAGUGAAGAGCAUUCCAGAUCAGAUUCUGUGACAGGGCAUACAUCACAGAAGGAAGCCAUGGAAGUAAGCCUUGAUAUAACAGCACUCAGCAUUCUCCAACAGCCAGAAAAACUUCAGUGGGAGAUUGUUGCAAAUGUGCUUGAAGAUACUGUUAAGGAUCUUGAAGAACUUGGGGCAAAUCCUUGUUUAACAAACUCUAAGAGUGAAAAGACAAAGGAAAAGCACCAGGAGCAACACAACAUUCCUUUUCCAUGUUUAUUAGCUGGAGGUUUAUUAACAUAUAAAUCUCCUGCUACCUCACCCAUUAGUAGUAAUUCUCACAGGUCACUGGAUGGUUUAAGCAGAACUCAGGGUGAAAGUAUAUCAGAACAAGGGUCAACUGACAAUGAAUCCUGCACUAAUUCAGAACUAAAUUCUCCUCUGGUAAGGAGGACUUUACCGGUUUUGCUUCUUUAUAGCAUCAAGGAAUCUGAUGAGAAAGCAGGAAAGAUCUUUUCACAGAUGAACAAUAUUAUGAGUAAAAGUUUGCAUGAUGAUGGUUUUACUGUUCCACAGAUUAUUGAAAUGGAGCUGGAUAGUCAGGAGCAGUUGUUAUUGCAGGAUCCUCCUGUGACUUACAUUCAGCAAUUUGCAGAUGCAGCAGCCAACCUUACCUCUCCGGAUUCUGAGAAGUGGAACUCUGUGUUUCCCAAGCCUGGGACUUUGGUUCAGUGCUUGAGGCUGCCAAAGUUUGCAGAGGAGGAGAAUCUUUGUAUAGACUCAAUAACUCCUUGUGCUGACGGAAUUCAUUUGUUGGUAGGACUGCGGACAUGCCCUGUUGAAUCCUUGAGUGCAAUAAAUCAAGUAGAGGCCUUGAAUAAUUUAAAUAAAUUAAACUCUGCACUAUGUAAUAGACGGAAAGGUGAGCUGGAAUCAAAUCUUGCUGUAGUGAAUGGUGCAAAUAUUAGUGUAAUCCAACAUGAAUCACCAGCAGAUGUACAGACUCCUUUAAUAAUUCAGCCUGAGCAGAGGAAUGUUAGUGGUGGAUAUUUAGUGCUUUAUAAAAUGAAUUAUGCCACUCGGAUAGUGACUUUAGAAGAGGAGCCAAUAAAAAUACAACAUAUCAAAGAUCCCCAGGACACAAUUACCUCGCUCAUUUUGCUUCCACCCGAUAUAUUGGAUAAUCGAGAGGAUGACUGUGAGGAACCUAUUGAGGACAUGCAGUUAACCUCAAAGAAUGGUUUUGAGAGAGAAAAAACGUCUGACAUUUCUACUCUUGGACACCUGGUAAUAACCACUCAGGGAGGAUAUGUAAAAAUACUAGAUCUUUCAAACUUUGAAAUUUUGGCCAAAGUGGAGCCUCCCAAAAAGGAGGGCACUGAGGAACAGGACACAUUUGUUUCUGUGAUUUACUGUUCUGGCACAGACAGGCUGUGUGCAUGCACCAAAGGUGGUGAGCUUCAUUUUCUCCAAAUUGGAGGAACCUGUGAUGAUAUUGAUGAAGCUGAUAUACUAGUGGAUGGAUCUCUUUCUAAAGGAAUAGAACCAUCUUCAGAAGGUUCCAAACCUUUAUCAAAUCCUUCAAGUCCUGGCAUUUCAGGAGUUGAUUUAUUGGUGGACCAGCCAUUCACCCUUGAAAUCUUGACAUCCCUAGUGGAGCUAACCCGCUUUGAGACUUUGACUCCAAGGUUUUCAGCGACUGUUCCUCCAUGCUGGGUAGAAGUUCAACAAGAACAGCAGCAAAGGAGGCAUCCUCAACAUUUGCAUCAGCAACACCAUGGUGAUGCUGCUCAGCAUACUCGAACUUGGAAACUACAGACCGACAGCAACAGCUGGGAUGAACAUGUAUUUGAAUUAGUACUACCUAAAGCUUGUAUGGUUGGACAUGUGGACUUCAAAUUCGUUUUGAACUCAAACAUCACCAAUAUUCCACAGAUACAAGUGACACUGCUGAAAAAUAAAGCUCCAGGAUUAGGGAAAGUCAAUGCUCUUAACAUUGAAGUGGAACAAAAUGGGAAACCGUCCCUGGUUGAUUUGAAUGAAGAAAUGCAGCACAUGGAUGUAGAGGAAUCACAGUGUCUUAGAUUAUGUCCAUUUUUGGAGGAUCAUAAAGAAGACAUUCUAUGUGGGCCAGUAUGGCUUGCUAGUGGCCUUGAUCUAUCAGGGCAUGCUGGAAUGUUGACGUUAACAAGCCCCAAACUUGUUAAAGGUAUGGCAGGAGGAAAAUAUCGUUCGUUUUUAAUCCAUGUCAAGGCAGUGAAUGAAAGAGGAACAGAAGAGAUUUGUAAUGGUGGUAUGCGUCCUGUAGUAAGGCUUCCAUCCCUAAAACACCAGAGUAACAAGGGUUAUUCACUUGCUUCACUUUUGGCUAAAGUUGCAGCAGGCAAGGAAAAAUCAUCUAAUGUUAAGAAUGAAAAUACAAGUGGCACCCGUAAAUCUGAAAACCUCCGGGGCUGUGAUUUACUUCAAGAGGUCUCAGUCACCAUUCGAAGAUUUAAGAAAACCUCAAUUUCUAAGGAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-702.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -756.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 649.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....)))(((((((.((((((..(((.....)))((((((......)))).))((((((.(((.((.((...((...)).)))).))).)))))).(((((.(((((((((((.(((((.((................)).))))).)))))........(((.((((..((....))..)))).)))..(((((.((...(((((((((.....((((...))))....)))).)))))...)).)))))..((.((((((((((((((.(((.(((...((((.((((((((((......)))))))))).)))).((((((...............(((.(((((.(((..(((((((.((...((((((((..............((((.((((....(((((((...(((((.((((.(((((.........((((.(((((((((....)))))))))...((((.......))))((((..((((((.((.((..((((..((((((...(((((..(((((................)))))..)).))).)))))).)))))))))))))).))))...))))))))))))))))))...)))))))((((((((...)))))))).......((((((...(((((((...((((((......((.((((.(....).)))).))(((((.....))))).(((((((((.((....)))))).))))).))))))....)))))))((((((..((.(((......))).)).....)))))).))))))...........((((.(((....))).)))).))))))))....))))))))))..)))))))..))).)))))))).((((((....))))))...((((..((((...)))).))))..))))))..(((.((..((((.((((..((((.(.(((....................))).).)))))))))))).....)).)))...........))).)).).))))))))))).))).)).......)))))))))))..........(((((((((.....((((.(((((.((....((............(((((((.....((((..((.....((((((..((.......))......((((....))))........((((.((((((((.(...(((....))).).)))))))).)))).......((((((((((((((((............))))).)))))))).))).)))))).....))..)))).)))))))...............(((((...)))))(((((((((((((((((((((((......))))).......(((((((..((((........)))).....))))))).((((((.....)))))).....(((((....)))))((((((((((((((((...)))))))...............))))))))).......(((.(((((((..((((.(((.((((.....((((((....(((((((...)))))))......((((((((.(((((......))))).))).....((((....)))).(((((((((((((....(((((.((((((((((((((....((((..(((((((((....))))))))).))))(((((((.((((((((((((((..((((.....)))).((((.....((((...)))).....))))((((.((......)).)))).)))))))))))..(((...(((.......)))..)))((((....))))))).))))).)).......((((((.........((((((((((((((..((((.((.((((((.....)))))).))..))))..))))....)))....))))))).....)))))).......)))))))...)))))))..)))))(((((((..((((.((((.((.((....((((.....)))))).)).)))).))))))))...)))...(((((((..(((.(((((((((((((((...(((((((((....))))....)))))..)))))))....))))(((((...)))))..(((((.(((((((....)))))))..)))))..((((.((.((((((((.......))))))))..))..)))).((........)))))).)))...)))))))))))))..)))))))...)))))(((((.....)))))...)))))).....)))).))).))))..))))))))))........(((((((....))))))).....)))))).))))))))))))(((.....))).)).....)).))))).))))....)))........))))))........))))))..)))))(((((((.(((((........))))).))))).)).............(((((.......)))))......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.,.,|||(((((((.((((({,,{{{|{,,{,,|(((({{......||||,||((((((.(((.((.((,..{,...}}.)))).))).)))))).......{((((,(((((.(((((.{(.....{,....,},,.)).))))).))))).....))}||(.((((,.((....)).,)))).)}|..(((((.((...(((((((((.....((((...))))....))))}}})))...)).)))))..|.........,,.,{{{{{{.||{{,..((((.((((((((((......)))))))))).))))..,.........|,||||,,{{((((((((..((,(({(,(,{{{{(((({{{..,(((({,,{{......,..,.(((((((........)),,)))){,,{{,,,,{{,.{,,...,||{(((((,...|||}}}}}))))))})||||||||..,||.},||||,||,.}|||}.}}}}}}}}}}}}}}}|.|||}}}}||||||((((..((((((,{({{,....})}),),)))})}}}}}.{(((((((...(((((((.{........).))))))).)))))))){((..{{((((({...)))))))).,.}}},{(((({.,{(((((((...((((((......{(.((((.{....}.)))).)}(((((.....))))),((((((((((((....)))))).))))).))))))....)))))))||{((({{(,.(((......))).}).....)))))|.||||||{{{,..,,,}}})}})}|}.},.}||{|,,.||||||||||,,|||||||||||.,}},|||}}|||||{||,.{{{,{{{(({....,}}))}...{{((,.((((...}}}}.}||}((((.((((((....,..{(({{((((..((((.(,(((,....,,...,}},......))).}.)))))))))))),..))).))))))}....,,}}|,},|{{{{,|||||{{{||.,|{{,||||.,||||||},,{,{,...,,.,,|||{({{((,,..|,{{,.{,{||...}})..}}.............,,,|,{,.,..,||||}},|,.,..,}}.||}}||}}|.,,,}}|||,..{{{{....}))},...,,..((((.((((((({.{...(((....))).}.}))))))).))))...,...((((((((((((((((............))))).)))))))).))){(({....})))}},,)))|{|||,,||{....}}}...}}}}|||,....|||}{(((((((((((((((((((((((......))))|{({.{{{(,,((((((((,,..,},,,}))),.}}},,)))}}|.((((({.....}))))),}...((((,..,,))||}((((((((((((((({...})))))),..............})))))))).,,....(((.(((((((..((((.(((.((((.....((((((....(((((((...}))))))..,,,.((((((((.(((((,....}))))).)))}....{(((....))),.(((((((((((({....(((((.((((((((((((((....((((..(((((((((....))))))))).)))),,(((((.((((((((((((((..((((.....))))..,,,...,.((((...)))).....,}||((((.((......)).))))})))))))))))..{((..,(((,......}))..)))((((....))))))).))))).||{{{....{{(({|.........((((((((((((((..((((.((.((((((.....)))))).))..))))..))))....))}...,))))))).....}))))}.,.....))))))}..,)))))))..)))))(((((((..((((.((((.((.({....((((.....))))}}.)).)))).))))})))...)))..{(((((((..(((.({{{(((((((((((...((((((((,....,}}}}}}.)))))..))))))),...))))(((({...}))))..(((((,(((((((....))))))).,)))))..((((,{{.{(((((((.......))))))}},.)).})))},{{.,,.....}}}))).))),..)))))))))))))..)))))))....}}},{{{{{.....))))}...)))))).,...)))).))).})))..))))))))))........(((((((....)))))))....))))))))))))))))))))}.})},}}})}.}},....||{|||,..,,,.,}..}}}.....,.})))))},))},...))))})..)))))|||{|||.||{||,||...,}))))).))))).|}.{{{..,{{....,|,....,},..,,||}..})),})
Back