Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0022100

Sequence Length

1932 nt

GC Content

0.4115

GGCAUACAUCACAGAAGGAAGCCAUGGAAGUAAGCCUUGAUAUAACAGCACUCAGCAUUCUCCAACAGCCAGAAAAACUUCAGUGGGAGAUUGUUGCAAAUGUGCUUGAAGAUACUGUUAAGGAUCUUGAAGAACUUGGGGCAAAUCCUUGUUUAACAAACUCUAAGAGUGAAAAGACAAAGGAAAAGCACCAGGAGCAACACAACAUUCCUUUUCCAUGUUUAUUAGCUGGAGGUUUAUUAACAUAUAAAUCUCCUGCUACCUCACCCAUUAGUAGUAAUUCUCACAGGUCACUGGAUGGUUUAAGCAGAACUCAGGGUGAAAGUAUAUCAGAACAAGGGUCAACUGACAAUGAAUCCUGCACUAAUUCAGAACUAAAUUCUCCUCUGGUAAGGAGGACUUUACCGGUUUUGCUUCUUUAUAGCAUCAAGGAAUCUGAUGAGAAAGCAGGAAAGAUCUUUUCACAGAUGAACAAUAUUAUGAGUAAAAGUUUGCAUGAUGAUGGUUUUACUGUUCCACAGAUUAUUGAAAUGGAGCUGGAUAGUCAGGAGCAGUUGUUAUUGCAGGAUCCUCCUGUGACUUACAUUCAGCAAUUUGCAGAUGCAGCAGCCAACCUUACCUCUCCGGAUUCUGAGAAGUGGAACUCUGUGUUUCCCAAGCCUGGGACUUUGGUUCAGUGCUUGAGGCUGCCAAAGUUUGCAGAGGAGGAGAAUCUUUGUAUAGACUCAAUAACUCCUUGUGCUGACGGAAUUCAUUUGUUGGUAGGACUGCGGACAUGCCCUGUUGAAUCCUUGAGUGCAAUAAAUCAAGUAGAGGCCUUGAAUAAUUUAAAUAAAUUAAACUCUGCACUAUGUAAUAGACGGAAAGGUGAGCUGGAAUCAAAUCUUGCUGUAGUGAAUGGUGCAAAUAUUAGUGUAAUCCAACAUGAAUCACCAGCAGAUGUACAGACUCCUUUAAUAAUUCAGCCUGAGCAGAGGAAUGUUAGUGGUGGAUAUUUAGUGCUUUAUAAAAUGAAUUAUGCCACUCGGAUAGUGACUUUAGAAGAGGAGCCAAUAAAAAUACAACAUAUCAAAGAUCCCCAGGACACAAUUACCUCGCUCAUUUUGCUUCCACCCGAUAUAUUGGAUAAUCGAGAGGAUGACUGUGAGGAACCUAUUGAGGACAUGCAGUUAACCUCAAAGAAUGGUUUUGAGAGAGAAAAAACGUCUGACAUUUCUACUCUUGGACACCUGGUAAUAACCACUCAGGGAGGAUAUGUAAAAAUACUAGAUCUUUCAAACUUUGAAAUUUUGGCCAAAGUGGAGCCUCCCAAAAAGGAGGGCACUGAGGAACAGGACACAUUUGUUUCUGUGAUUUACUGUUCUGGCACAGACAGGCUGUGUGCAUGCACCAAAGGUGGUGAGCUUCAUUUUCUCCAAAUUGGAGGAACCUGUGAUGAUAUUGAUGAAGCUGAUAUACUAGUGGAUGGAUCUCUUUCUAAAGGAAUAGAACCAUCUUCAGAAGGUUCCAAACCUUUAUCAAAUCCUUCAAGUCCUGGCAUUUCAGGAGUUGAUUUAUUGGUGGACCAGCCAUUCACCCUUGAAAUCUUGACAUCCCUAGUGGAGCUAACCCGCUUUGAGACUUUGACUCCAAGGUUUUCAGCGACUGUUCCUCCAUGCUGGGUAGAAGUUCAACAAGAACAGCAGCAAAGGAGGCAUCCUCAACAUUUGCAUCAGCAACACCAUGGUGAUGCUGCUCAGCAUACUCGAACUUGGAAACUACAGACCGACAGCAACAGCUGGGAUGAACAUGUAUUUGAAUUAGUACUACCUAAAGCUUGUAUGGUUGGACAUGUGGACUUCAAAUUCGUUUUGAACUCAAACAUCACCAAUAUUCCACAGAUACAAGUGACACUGCUGAAAAAUAAAGCUCCAGGAUUAGGGAAAGUCAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-534.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -574.47

Frequency: 0.0000

Diversity: 465.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(((.((.((...((...)).)))).))).)))(..........((((.((((...(((((...(((((((....(((((((((((((((((((.......(((.((((..((....))..)))).)))..(((((.((...(((((((((.....((((...))))....)))).)))))...)).))))).)))))......(((((((((...(((...((((.((((((((((......)))))))))).))))..((((((...(((.((((((.((.(((....))))).))))...))...)))..))))))...............(((((((........)).)))))(((((((((((..(((((....(((((((.(.(((..((.......((((((((((.(((((.(((((((((((((((.((((((.............)))))))))))((((..((((((.(((((....)))).).)))))))))).((((((((...(((((((.(........).))))))).))))))))(((..((((((((...))))))))...)))(((((((.(((((((((...((((((......((.((((.(....).)))).))(((((.....))))).(((((((((.((....)))))).))))).))))))....)))))))))((((..((.(((......))).)).....))))((.((((((((((.....)))))))))).))..(((....)))..)))))))))))))).))).)))))..))))))).))).....((((((....))))))...((((..((((...)))).))))((((.((((((.......((((.((((..((((.(.(((....................))).).))))))))))))...))).)))))))......))..))).).)))))))...)))))..)))))...))))))............(((((.((....))))))))))....)))))))))..............(((((((.....((((..((.....((((((..((.......))......((((....))))........((((.((((((((.(...(((....))).).)))))))).)))).......((((((((((((((((............))))).)))))))).))).)))))).....))..)))).)))))))..........)))))))))....))))).))))))).....)))))(((((......))))).(((..(((((((((.....)))))))))))).....((((.(((...))))))))))).))))...(((((....)))))((((((((((((((((...)))))))...............))))))))).........(.((((((.(((.((((....)))).))).)))))).).(((((((...)))))))..........((((.(((((......))))).))))((((..((((((.......))))))..))))...(((((.((((((((((((((....((((..(((((((((....))))))))).))))(((((((.((((((((((((((..((((.....)))).((((.....((((...)))).....))))((((.((......)).)))).)))))))))))..(((...(((.......)))..)))((((....))))))).))))).)).......((((((.........((((((((((((((..((((.((.((((((.....)))))).))..))))..))))....)))....))))))).....)))))).......)))))))...)))))))..))))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((,,{,((((((((...(((((,.((((((((({.((((((.,,...((((((((((,(((((,{(,{...{{,...,|,|,||{||||}.|||{{{....,,.(((.((((,.((....)).})))).)))..(((((.((...(((((((((.....((((...))))....))))}}})))...)).))))).}|||||...,,{{{{{{{{{{.|{{{,..((((.((((((((((......)))))))))).))))..,,.,,,.,..},,}},.{((((((((((..({.((((.(.,((((((((((...((((({,({.....,,..,.(((((((........)),,))))|..,,..,.,{{,,.....,||{(((((....,))))))})))))))))))))))}...,}.}.)))).})..))))).)))))}}||||}}}||.{({{.{{{{||||((((,.((((((,,({{,....})})})}))),)),,,..((((((((...(((((((.(........).))))))).)))))))){((..{(((((((...))))))))...}}}.((((({.,{(((((((...((((((......{(.((((.{....}.)))).)}(((((.....))))),((((((((((((....)))))).))))).))))))....)))))))}|{((({{(,.{{{..,...}}}.}).....)))))}.}))))).,,..}})}}))))})).)))),}||||,.,,},,,))))),.)})})))))))..}}.))))))...{(((..{((((,{(({....,,,}},...((((..((((...}))).))))((((.((((((....,..{((,{((((..((((.(,(((.....,,...,}}}......))).}.)))))))))))),..))).)))))))....}))))))))((((.(((({(((({..(((.((((.{{{,{{{,.,{{{,,.....,|||||{|.||,,,,||{|..,,||,...)))..))................,,,.,,,.))))))).}},),.,)).))))))))..}))))))))}.((((....}}))....||..((((.((((((((.(...(((....))).).)))))))).)))).......((((((((((((((((............))))).)))))))).)))((((....))))((((((((((((..(((....)))...)))))))..((((((..........))))))...{(((((......)))))}).))))){{((((,,(({{....,...)))).,...})))))|{{(((({,....)))))),}...(((({..,,))))).}}|||.,((((((({...}))))))}.}}))))}).,.,,|||||||||{...{{{{,(,((((((.(((.{(((....)))).))).)))))).,.{((((({...}))))))..........((((.(((((,....,))))).)))),{{|,,||||{,.,,,,..)))))),.}}},...(((((.((((((((((((((....((((..(((((((((....))))))))).)))),,(((((.((((((((((((((..((((.....))))..,,,...,.((((...)))).....,}||((((.((......)).))))})))))))))))..{((..,(((,......}))..)))((((....))))))).))))).||{{{....{{((||.........((((((((((((((..((((.((.((((((.....)))))).))..))))..))))....))}...,))))))).....}))))}.,.....))))))}..,)))))))..))))).)