Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0024700

Sequence Length

1893 nt

GC Content

0.4168

GUGGUGAGCUUCAUUUUCUCCAAAUUGGAGGAACCUGUGAUGAUAUUGAUGAAGCUGAUAUACUAGUGGAUGGAUCUCUUUCUAAAGGAAUAGAACCAUCUUCAGAAGGUUCCAAACCUUUAUCAAAUCCUUCAAGUCCUGGCAUUUCAGGAGUUGAUUUAUUGGUGGACCAGCCAUUCACCCUUGAAAUCUUGACAUCCCUAGUGGAGCUAACCCGCUUUGAGACUUUGACUCCAAGGUUUUCAGCGACUGUUCCUCCAUGCUGGGUAGAAGUUCAACAAGAACAGCAGCAAAGGAGGCAUCCUCAACAUUUGCAUCAGCAACACCAUGGUGAUGCUGCUCAGCAUACUCGAACUUGGAAACUACAGACCGACAGCAACAGCUGGGAUGAACAUGUAUUUGAAUUAGUACUACCUAAAGCUUGUAUGGUUGGACAUGUGGACUUCAAAUUCGUUUUGAACUCAAACAUCACCAAUAUUCCACAGAUACAAGUGACACUGCUGAAAAAUAAAGCUCCAGGAUUAGGGAAAGUCAAUGCUCUUAACAUUGAAGUGGAACAAAAUGGGAAACCGUCCCUGGUUGAUUUGAAUGAAGAAAUGCAGCACAUGGAUGUAGAGGAAUCACAGUGUCUUAGAUUAUGUCCAUUUUUGGAGGAUCAUAAAGAAGACAUUCUAUGUGGGCCAGUAUGGCUUGCUAGUGGCCUUGAUCUAUCAGGGCAUGCUGGAAUGUUGACGUUAACAAGCCCCAAACUUGUUAAAGGUAUGGCAGGAGGAAAAUAUCGUUCGUUUUUAAUCCAUGUCAAGGCAGUGAAUGAAAGAGGAACAGAAGAGAUUUGUAAUGGUGGUAUGCGUCCUGUAGUAAGGCUUCCAUCCCUAAAACACCAGAGUAACAAGGGUUAUUCACUUGCUUCACUUUUGGCUAAAGUUGCAGCAGGCAAGGAAAAAUCAUCUAAUGUUAAGAAUGAAAAUACAAGUGGCACCCGUAAAUCUGAAAACCUCCGGGGCUGUGAUUUACUUCAAGAGGUCUCAGUCACCAUUCGAAGAUUUAAGAAAACCUCAAUUUCUAAGGAAAGAGUGCAACGAUGUGCCAUGUUACAGUUUUCAGAAUUUCAUGAGAAGCUUGUUAAUACUCUUUGCAGAAAAACAGAUGAUGGCCAGAUCACAGAACAUGCCCAGAGCCUUGUGUUGGAUACUCUCUGUUGGUUAGCUGGAGUUCAUUCAAAUGGACCCGGAAGCUCAAAGGAAGGAAAUGAGAACCUACUUUCAAAAACACGAAAAUUUCUGUCAGACAUCGUACGUGUUUGCUUCUUUGAGGCAGGACGAAGUAUAGCCCAUAAGUGUGCCCGAUUUCUAGCCUUGUGCAUUAGUAAUGGCAAAUGUGACCCAUGUCAACCAGCAUUUGGACCUGUUCUGUUGAAGGCUUUACUUGAUAAUAUGUCAUUUUUACCUGCAGCAACAACUGGUGGUUCUGUCUAUUGGUAUUUUGUCUUACUGAAUUAUGUGAAAGAUGAAGAUCUGGCUGGAUGCAGUACAGCUUGUGCAUCUUUGCUUACUGCAGUGUCCAGACAGUUACAGGACAGGCUAACACCAAUGGAGGCUUUACUUCAGACAAGAUAUGGAUUAUAUAGCUCACCAUUUGAUCCAGUCCUCUUUGAUUUGGAGAUGAGUGGCUCUUCUUGUAAAAAUGUUUAUAACAGCAGCAUUGGUGUCCAGUCAGAUGAAAUUGAUUUAUCAGAUGUCCUUUCAGGAAAUGGAAAGGUCAGUAGUUGCACAGCUGCUGAGGGUAGUUUCACAUCUCUCACUGGACUUUUGGAAGUUGAACCUCUGCACUUUACUUGUGUGUCAACUAGUGAUGGAACCAGAAUAGAAAGGGAUGAUGCAAGUACGUUUACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-531.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -573.8

Frequency: 0.0000

Diversity: 432.21

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.((((((((((((((((...)))))))...............))))))))).)).)))(((((((((.(((((((((((((((....(((((.((....)).)))))....))))...........((((.(((((......))))).))))((((..((((((.......))))))..))))...(((((.((((((((((((((....((((..(((((((((....))))))))).))))(((((((.((((((((((((((..((((.....)))).((((.....((((...)))).....))))((((.((......)).)))).)))))))))))..(((...(((.......)))..)))((((....))))))).))))).)).......((((((.........((((((((((((((..((((.((.((((((.....)))))).))..))))..))))....)))....))))))).....)))))).......)))))))...)))))))..)))))((.(((..((......))))).))...(((....(((((.(((((((((.................(((((((((((((((((...(((((((((((...(((((((((....))))....)))))..)))))))....))))(((((...)))))..(((((.(((((((....)))))))..))))).......((.((((((((.......))))))))..)).((((((((.((((((.......))))))..))).)))))...((((((...((((((((......(.((((...((((((((...(((((.((.((((((((((((((.............(((((((....)))))))....(((........)))....(((((.(((((.(((((...(((((((..(((.((((........((((((..(...(((((((((((((((....(((((((.(((((........))))).))))).)).(((..........)))...(((..((((....))))))).(((......))).........)))))))).)))).))).)..))))))......)))).))).......)))))))((((...((((((((((.(.(((((.((.......))........((((((((..((((.((((((....))))))))))...(((((((((......(((((......))))).((((((((..((.(((...))).))..).)))))))..)))))))))(((((..(((((...((.((....)).))...)))))....)))))(((((.((....)).)))))(((....)))))))))))))))).).))))))).))).)))).....(((((...)))))))))).))))).)))))...(((((..(((((((..((..((..((((((((((......((.(((((((..((.(((((((....)))).))).))...)))))))))......)))))...)))))))..)))))))))....))))))))))))))))))).)))))...(((((...))))).)))))))))).)))))..))))))))((((.(((.((.((((.((((..(((((((....))))))).)).)))))).)).))))))).((((((.....))))))((((((((((((........))))))(((((((((....)))))))))..........)))))).))))))(((((....)))))...)))))))).))))..)))))))))))))).)))))..)))...)))))))))))..........)))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((.((((((((((((((({...})))))),..............})))))))).)).)))(((((((((.((((((((((({(((....(((((.((....)).)))))....))))|{,,,,.....((((.(((((,....,))))).))))....}|||||,.,,...(((((((((((({....(((((.((((((((((((((....((((..(((((((((....))))))))).)))),,(((((.((((((((((((((..((((.....))))..,,,...,.((((...)))).....,}||((((.((......)).))))})))))))))))..{((..,(((,......}))..)))((((....))))))).))))).||{{{....{{((||.........((((((((((((((..((((.((.((((((.....)))))).))..))))..))))....))}...,))))))).....}))))}.,.....))))))}..,)))))))..))))){((((({..((((.((((.{{.{{...,(({{..,,,)}}}||,}).)))).)))),}}}...}}}.,{(((((((,,(((,(,,{(({((((((((...((((((((,....,}}}}}}.)))))..))))))),...})))(((({...}))))..(((((,(((((((....))))))).,)))))..{(((,{{.{(((((((.......))))))}},.)).|))}|{((.{{.....,},))).)))},.}))))))))))))..))))))){(((((((.,.,..,.((((...(((((((({.,{,(({(((.((((((((((((((..........,,,(((((((.,,.}}}}})).,,,|{{........))}....(((((.(((((.(((((...(((((((..(((.((((.,,.....((((((..(...{({(({(((((((((....(((((((.(((((.,,...,,))))).))))).)).,{{......,...|||...,|,..||||,..,)}},}}|{({{....,}))),........))))))))}.))}.}}).)..))))))...,,.)))).))).......)))))))((((...((((((((((.(.(((({.,,..{{({{{{...{{,{{({(((({{..((((.((((((....))))))))))..}|||||{|||{|,...(((((......))))}.,{(((((,..,,.{{{...}}}.||..,.))))))}{||||,,,)))|||{{.,{{{{{,,.{{.{,....})|)}...}}}))..|||}}},|{{{,.||...})).,,,,|(((....)))),))))))))))).).)))))))},)).)))).....(((({...}))))))))).))))).)))))...(((((..(((((((..{{,,{,,((((((((({{......||,{{|||||,,,{.((({(((,,,,||||,}||{.....}}}}}}})),)),,,))}}),,,))}))),,.),)))))))....))))))))))))))))))).)))}}...,{{{|,,,,,))}.}},))))))).))))}.,)))))))|(({{{(((.((.((({{((,(,.(((((({....})))))).)).)))))).)).))))))),((((((.....)))))).,,,,,((((((......,.))))))((({(((((,,,,|}}|||}||((,.,,{{{{|||,}|||,,||}|}{,,.||}}|||||,.}}}},|||{.......}))))})))))),}))}}}..))),..}))))))))))..........)))))))))