Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0029600

Sequence Length

1075 nt

GC Content

0.4167

CUCUUAACAUUGAAGUGGAACAAAAUGGGAAACCGUCCCUGGUUGAUUUGAAUGAAGAAAUGCAGCACAUGGAUGUAGAGGAAUCACAGUGUCUUAGAUUAUGUCCAUUUUUGGAGGAUCAUAAAGAAGACAUUCUAUGUGGGCCAGUAUGGCUUGCUAGUGGCCUUGAUCUAUCAGGGCAUGCUGGAAUGUUGACGUUAACAAGCCCCAAACUUGUUAAAGGUAUGGCAGGAGGAAAAUAUCGUUCGUUUUUAAUCCAUGUCAAGGCAGUGAAUGAAAGAGGAACAGAAGAGAUUUGUAAUGGUGGUAUGCGUCCUGUAGUAAGGCUUCCAUCCCUAAAACACCAGAGUAACAAGGGUUAUUCACUUGCUUCACUUUUGGCUAAAGUUGCAGCAGGCAAGGAAAAAUCAUCUAAUGUUAAGAAUGAAAAUACAAGUGGCACCCGUAAAUCUGAAAACCUCCGGGGCUGUGAUUUACUUCAAGAGGUCUCAGUCACCAUUCGAAGAUUUAAGAAAACCUCAAUUUCUAAGGAAAGAGUGCAACGAUGUGCCAUGUUACAGUUUUCAGAAUUUCAUGAGAAGCUUGUUAAUACUCUUUGCAGAAAAACAGAUGAUGGCCAGAUCACAGAACAUGCCCAGAGCCUUGUGUUGGAUACUCUCUGUUGGUUAGCUGGAGUUCAUUCAAAUGGACCCGGAAGCUCAAAGGAAGGAAAUGAGAACCUACUUUCAAAAACACGAAAAUUUCUGUCAGACAUCGUACGUGUUUGCUUCUUUGAGGCAGGACGAAGUAUAGCCCAUAAGUGUGCCCGAUUUCUAGCCUUGUGCAUUAGUAAUGGCAAAUGUGACCCAUGUCAACCAGCAUUUGGACCUGUUCUGUUGAAGGCUUUACUUGAUAAUAUGUCAUUUUUACCUGCAGCAACAACUGGUGGUUCUGUCUAUUGGUAUUUUGUCUUACUGAAUUAUGUGAAAGAUGAAGAUCUGGCUGGAUGCAGUACAGCUUGUGCAUCUUUGCUUACUGCAGUGUCCAGACAGUUACAGGACAGGCUAACACCAAUGGAGGCUUUACUUCAGACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-276.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -302.22

Frequency: 0.0000

Diversity: 265.22

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((..((((.((((.((.((....((((.....)))))).)).)))).))))...........(((((((((((.((....)))))(((((((...(((((((((....))))....)))))..)))))))))))))))(((((...)))))..(((((.(((((((....)))))))..)))))..((((.((.((((((((.......))))))))..))..)))).((........))((((.(((((..((..(((....)))..))...))))).))))..))))).(((((.(((........))).(((.((((((((((((((.............(((((((....)))))))....(((........)))....(((((.(((((.(((((...(((((((..(((.((((........((((((..(...(((((((((((((((....(((((((.(((((........))))).))))).)).(((..........)))...(((..((((....))))))).(((......))).........)))))))).)))).))).)..))))))......)))).))).......)))))))((((...((((((((((.(.(((((.((.......))........((((((((..((((.((((((....))))))))))...(((((((((......(((((......))))).((((((((..((.(((...))).))..).)))))))..)))))))))(((((..(((((...((.((....)).))...)))))....)))))(((((.((....)).)))))(((....)))))))))))))))).).))))))).))).)))).....(((((...)))))))))).))))).)))))...(((((..(((((((..((..((..((((((((((......((.(((((((..((.(((((((....)))).))).))...)))))))))......)))))...)))))))..)))))))))....))))))))))))))))))).))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((..((((.((((.({.({....((((.....))))}}.)).)))).)))),}}}...|{..(((((((((((.((....))))}(((((((...((((((((,....,}}}}}}.)))))..)))))))))))))))(((({...}))))..(((((,(((((((....))))))).,)))))..,{,,,,{.{{{{{{{(,,,,...|||||||,..||.|}}||||,.,......||((((.(((((.,{{{,(((....))).,),,}.})))).)))).,},,,..|||,|..,|,,},}.,})||}(((.((((((((((((((..........,,,(((((((.,,.}}}}})).,,,|{{........))}....(((((.(((((.(((((...(((((((..(((.((((.,,.....((((((..(...{({(({(((((((((....(((((((.(((((.,,...,,))))).))))).)).,{{......,...|||...,|,..||||,..,)}},}}|{({{....,}))),........))))))))}.))}.}}).)..))))))...,,.)))).))).......)))))))((((...((((((((((.(.(((({.,,..{{({{{{...{{,{{({(((({{..((((.((((((....))))))))))..}|||||{|||{|,...(((((......))))}.,{(((((,..,,.{{{...}}}.||..,.))))))}{||||,,,)))|||{{.,{{{{{,,.{{.{,....})|)}...}}}))..|||}}},|{{{,.||...})).,,,,|(((....)))),))))))))))).).)))))))},)).)))).....(((({...}))))))))).))))).)))))...(((((..(((((((..{{,,{,,((((((((({{......||,{{|||||,,,{.((({(((,,,,||||,}||{.....}}}}}}})),)),,,))}}),,,))}))),,.),)))))))....))))))))))))))))))).)))}}..)