Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0032300

Sequence Length

985 nt

GC Content

0.4173

GUCUUAGAUUAUGUCCAUUUUUGGAGGAUCAUAAAGAAGACAUUCUAUGUGGGCCAGUAUGGCUUGCUAGUGGCCUUGAUCUAUCAGGGCAUGCUGGAAUGUUGACGUUAACAAGCCCCAAACUUGUUAAAGGUAUGGCAGGAGGAAAAUAUCGUUCGUUUUUAAUCCAUGUCAAGGCAGUGAAUGAAAGAGGAACAGAAGAGAUUUGUAAUGGUGGUAUGCGUCCUGUAGUAAGGCUUCCAUCCCUAAAACACCAGAGUAACAAGGGUUAUUCACUUGCUUCACUUUUGGCUAAAGUUGCAGCAGGCAAGGAAAAAUCAUCUAAUGUUAAGAAUGAAAAUACAAGUGGCACCCGUAAAUCUGAAAACCUCCGGGGCUGUGAUUUACUUCAAGAGGUCUCAGUCACCAUUCGAAGAUUUAAGAAAACCUCAAUUUCUAAGGAAAGAGUGCAACGAUGUGCCAUGUUACAGUUUUCAGAAUUUCAUGAGAAGCUUGUUAAUACUCUUUGCAGAAAAACAGAUGAUGGCCAGAUCACAGAACAUGCCCAGAGCCUUGUGUUGGAUACUCUCUGUUGGUUAGCUGGAGUUCAUUCAAAUGGACCCGGAAGCUCAAAGGAAGGAAAUGAGAACCUACUUUCAAAAACACGAAAAUUUCUGUCAGACAUCGUACGUGUUUGCUUCUUUGAGGCAGGACGAAGUAUAGCCCAUAAGUGUGCCCGAUUUCUAGCCUUGUGCAUUAGUAAUGGCAAAUGUGACCCAUGUCAACCAGCAUUUGGACCUGUUCUGUUGAAGGCUUUACUUGAUAAUAUGUCAUUUUUACCUGCAGCAACAACUGGUGGUUCUGUCUAUUGGUAUUUUGUCUUACUGAAUUAUGUGAAAGAUGAAGAUCUGGCUGGAUGCAGUACAGCUUGUGCAUCUUUGCUUACUGCAGUGUCCAGACAGUUACAGGACAGGCUAACACCAAUGGAGGCUUUACUUCAGACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-252.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -277.09

Frequency: 0.0000

Diversity: 259.19

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.........((((....))))((..((((.((((....)))).))))..)).....(((((((((((.(((((((....)))))))..)))))((((....))))..))))))(((.((((.....)))).)))(((((.(....((((((((.((((((.((..(((....)))..)).)))))).)..(((((.....)))))))))))).....).))))).((((((((((((((.............(((((((....)))))))....(((........)))....(((((.(((((.(((((...(((((((..(((.((((........((((((..(...(((((((((((((((....(((((((.(((((........))))).))))).)).(((..........)))...(((..((((....))))))).(((......))).........)))))))).)))).))).)..))))))......)))).))).......)))))))((((...((((((((((.(.(((((.((.......))........((((((((..((((.((((((....))))))))))...(((((((((......(((((......))))).((((((((..((.(((...))).))..).)))))))..)))))))))(((((..(((((...((.((....)).))...)))))....)))))(((((.((....)).)))))(((....)))))))))))))))).).))))))).))).)))).....(((((...)))))))))).))))).)))))...(((((..(((((((..((..((..((((((((((......((.(((((((..((.(((((((....)))).))).))...)))))))))......)))))...)))))))..)))))))))....)))))))))))))))))))..))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((,.{{{{.{,((((....)))).}}}),}},,||,{{{{{{{|..((((((({...}))))))){(((,(((((((....))))))).,)))))}}}}}}.,{.{{{{(({(,,.,...|||}}}},..||.|||(({{{.{...,{{((((((.(((((..({{,(((....))).,),,),))))).))}},|{.....}}},,..,}}}),},},),))|||,((((((((((((((..........,,,(((((((.,,.}}}}})).,,,|{{........))}....(((((.(((((.(((((...(((((((..(((.((((.,,.....((((((..(...{({(({(((((((((....(((((((.(((((.,,...,,))))).))))).)).,{{......,...|||...,|,..||||,..,)}},}}|{({{....,}))),........))))))))}.))}.}}).)..))))))...,,.)))).))).......)))))))((((...((((((((((.(.(((({.,,..{{({{{{...{{,{{({(((({{..((((.((((((....))))))))))..}|||||{|||{|,...(((((......))))}.,{(((((,..,,.{{{...}}}.||..,.))))))}{||||,,,)))||||{.,{{{{{,,.{{.{,....})|)}..,}}}))..|||}}},|{{{,.||...})).,,,,|(((....)))),))))))))))).).)))))))},)).)))).....(((({...}))))))))).))))).)))))...(((((..(((((((..{{,,{,,((((((((({{......||,{{|||||,,,{.((({(((,,,,||||,}||{.....}}}}}}})),)),,,))}}),,,))}))),,.),)))))))....))))))))))))))))))).})))}...