Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0035200

Sequence Length

853 nt

GC Content

0.4162

GUAUGGCAGGAGGAAAAUAUCGUUCGUUUUUAAUCCAUGUCAAGGCAGUGAAUGAAAGAGGAACAGAAGAGAUUUGUAAUGGUGGUAUGCGUCCUGUAGUAAGGCUUCCAUCCCUAAAACACCAGAGUAACAAGGGUUAUUCACUUGCUUCACUUUUGGCUAAAGUUGCAGCAGGCAAGGAAAAAUCAUCUAAUGUUAAGAAUGAAAAUACAAGUGGCACCCGUAAAUCUGAAAACCUCCGGGGCUGUGAUUUACUUCAAGAGGUCUCAGUCACCAUUCGAAGAUUUAAGAAAACCUCAAUUUCUAAGGAAAGAGUGCAACGAUGUGCCAUGUUACAGUUUUCAGAAUUUCAUGAGAAGCUUGUUAAUACUCUUUGCAGAAAAACAGAUGAUGGCCAGAUCACAGAACAUGCCCAGAGCCUUGUGUUGGAUACUCUCUGUUGGUUAGCUGGAGUUCAUUCAAAUGGACCCGGAAGCUCAAAGGAAGGAAAUGAGAACCUACUUUCAAAAACACGAAAAUUUCUGUCAGACAUCGUACGUGUUUGCUUCUUUGAGGCAGGACGAAGUAUAGCCCAUAAGUGUGCCCGAUUUCUAGCCUUGUGCAUUAGUAAUGGCAAAUGUGACCCAUGUCAACCAGCAUUUGGACCUGUUCUGUUGAAGGCUUUACUUGAUAAUAUGUCAUUUUUACCUGCAGCAACAACUGGUGGUUCUGUCUAUUGGUAUUUUGUCUUACUGAAUUAUGUGAAAGAUGAAGAUCUGGCUGGAUGCAGUACAGCUUGUGCAUCUUUGCUUACUGCAGUGUCCAGACAGUUACAGGACAGGCUAACACCAAUGGAGGCUUUACUUCAGACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-212 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -232.68

Frequency: 0.0000

Diversity: 207.87

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.((......((((.((((((.(((((..((..(((....)))..))...))))).))))....)).)))).......)).))))).(.(((.((((((((((((((.............(((((((....)))))))....(((........)))....(((((.(((((.(((((...(((((((..(((.((((........((((((..(...(((((((((((((((....(((((((.(((((........))))).))))).)).(((..........)))...(((..((((....))))))).(((......))).........)))))))).)))).))).)..))))))......)))).))).......)))))))((((...((((((((((.(.(((((.((.......))........((((((((..((((.((((((....))))))))))...(((((((((......(((((......))))).((((((((..((.(((...))).))..).)))))))..)))))))))(((((..(((((...((.((....)).))...)))))....)))))(((((.((....)).)))))(((....)))))))))))))))).).))))))).))).)))).....(((((...)))))))))).))))).)))))...(((((..(((((((..((..((..((((((((((......((.(((((((..((.(((((((....)))).))).))...)))))))))......)))))...)))))))..)))))))))....))))))))))))))))))).)))...).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((({,((..,.,,({,{.((((((.(((((.,(,{,(((....))).,),,}.))))).)))).},.,}.,))).,.....)}.)))}},(.(((.((((((((((((((..........,,,(((((((.,,.}}}}})).,,,|{{........))}....(((((.(((((.(((((...(((((((..(((.((((.,,.....((((((..(...{({(({(((((((((....(((((((.(((((.,,...,,))))).))))).)).,{{......,...|||...,|,..||||,..,)}},}}|{({{....,}))),........))))))))}.))}.}}).)..))))))...,,.)))).))).......)))))))((((...((((((((((.(.(((({.,,..{{({{{{...{{,{{({(((({{..((((.((((((....))))))))))..}|||||{|||{|,...(((((......))))}.,{(((((,..,,.{{{...}}}.||..,.))))))}{||||,,,)))|||{{.,{{{{{,,.{{.{,....})|)}...}}}))..|||}}},|{{{,.||...})).,,,,|(((....)))),))))))))))).).)))))))},)).)))).....(((({...}))))))))).))))).)))))...(((((..(((((((..{{,,{,,((((((((({{......||,{{|||||,,,{.((({(((,,,,||||,}||{.....}}}}}}})),)),,,))}}),,,))}))),,.),)))))))....))))))))))))))))))).))),,.,.