Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0035700
Sequence Length
2496 nt
GC Content
0.4339
GUAUGGCAGGAGGAAAAUAUCGUUCGUUUUUAAUCCAUGUCAAGGCAGUGAAUGAAAGAGGAACAGAAGAGAUUUGUAAUGGUGGUAUGCGUCCUGUAGUAAGGCUUCCAUCCCUAAAACACCAGAGUAACAAGGGUUAUUCACUUGCUUCACUUUUGGCUAAAGUUGCAGCAGGCAAGGAAAAAUCAUCUAAUGUUAAGAAUGAAAAUACAAGUGGCACCCGUAAAUCUGAAAACCUCCGGGGCUGUGAUUUACUUCAAGAGGUCUCAGUCACCAUUCGAAGAUUUAAGAAAACCUCAAUUUCUAAGGAAAGAGUGCAACGAUGUGCCAUGUUACAGUUUUCAGAAUUUCAUGAGAAGCUUGUUAAUACUCUUUGCAGAAAAACAGAUGAUGGCCAGAUCACAGAACAUGCCCAGAGCCUUGUGUUGGAUACUCUCUGUUGGUUAGCUGGAGUUCAUUCAAAUGGACCCGGAAGCUCAAAGGAAGGAAAUGAGAACCUACUUUCAAAAACACGAAAAUUUCUGUCAGACAUCGUACGUGUUUGCUUCUUUGAGGCAGGACGAAGUAUAGCCCAUAAGUGUGCCCGAUUUCUAGCCUUGUGCAUUAGUAAUGGCAAAUGUGACCCAUGUCAACCAGCAUUUGGACCUGUUCUGUUGAAGGCUUUACUUGAUAAUAUGUCAUUUUUACCUGCAGCAACAACUGGUGGUUCUGUCUAUUGGUAUUUUGUCUUACUGAAUUAUGUGAAAGAUGAAGAUCUGGCUGGAUGCAGUACAGCUUGUGCAUCUUUGCUUACUGCAGUGUCCAGACAGUUACAGGACAGGCUAACACCAAUGGAGGCUUUACUUCAGACAAGAUAUGGAUUAUAUAGCUCACCAUUUGAUCCAGUCCUCUUUGAUUUGGAGAUGAGUGGCUCUUCUUGUAAAAAUGUUUAUAACAGCAGCAUUGGUGUCCAGUCAGAUGAAAUUGAUUUAUCAGAUGUCCUUUCAGGAAAUGGAAAGGUCAGUAGUUGCACAGCUGCUGAGGGUAGUUUCACAUCUCUCACUGGACUUUUGGAAGUUGAACCUCUGCACUUUACUUGUGUGUCAACUAGUGAUGGAACCAGAAUAGAAAGGGAUGAUGCAAUGAGUUCCUUCGGGGUUACUCCUGCAGUAGGUGGACUAUCAUCUGGGACAGUUGGGGAAGCCUCGACAGCCCUGAGUUCAGCAGCCCAGGUAGCUUUGCAGUCUCUCUCUCAUGCAAUGGCUUCAGCCGAGCAACAGCUACAGGUGCUGCAAGAGAAACAGCAGCAGCUUUUGAAGCUUCAGCAACAGAAAGCAAAGCUGGAAGCCAAGUUACAUCAGACAACAGCUGCAGCAGCUGCAGCAGCAUCAGCAGUAGGUCCUGUUCACAACUCUGUGCCUUCCAACCCAGUGGCUGCCCCUGGAUUCUUCAUUCAUCCAUCUGAUGUUAUUCCACCCACUCCAAAAACAACACCUCUUUUUAUGACUCCACCACUCACUCCACCCAAUGAAGCAGUUUCCGUUGUGAUUAAUGCCGAACUUGCACAGCUUUUCCCAGGCUCAGUCAUUGAUCCCCCAGCAGUCAAUCUUGCUGCACAUAACAAAAAUUCCAACAAGUCCAGAAUGAAUCCACUUGGUUCUGGUCUAGCCCUUGCAAUUUCUCAUGCUUCACAUUUUCUUCAACCUCCGCCUCACCAGUCCAUUAUUAUAGAGCGAAUGCAUUCAGGAGCAAGAAGAUUUGUGACCUUGGAUUUUGGGAGGCCUAUAUUGUUGACUGAUGUAUUGAUUCCCACUUGUGGAGACUUGGCCUCUUUGUCAAUUGACAUUUGGACAUUAGGAGAAGAGGUGGAUGGAAGGCGGUUGGUAGUGGCAACUGAUAUAAGCACUCAUUCACUAAUUCUUCAUGACUUAAUACCACCUCCCGUGUGCAGAUUCAUGAAGAUCACUGUUAUUGGACGUUACGGGAGUACAAAUGCCAGAGCCAAAAUCCCAUUAGGAUUUUACUAUGGUCAUACCUACAUCUUGCCUUGGGAAAGUGAACUGAAGUUAAUGCAUGAUCCUCUAAAGGGAGAGGGAGAAUCUGCAAACCAGCCAGAAAUUGACCAGCAUUUAGCAAUGAUGGUUGCUUUGCAGGAGGAUAUACAGUGCAGGUAUAACUUGGCUUGUCAUCGUCUGGAAACCCUUUUGCAAAGUAUUGAUCUUCCUCCUCUAAACAGUGCUAACAAUGCACAGUACUUUUUACGAAAACCAGAUAAGGCAGUUGAGGAAGACAGUAGGGUUUUUUCUGCUUAUCAAGAUUGUAUUCAGCUACAGCUUCAACUAAAUUUGGCUCAUAAUGCAGUGCAGAGGCUCAAAGUGGCGCUAGGUGCAAGCCGGAAGAUGUUGAGUGAAACAUCAAAUCCAGAAGAUUUAAUUCAGACAUCUUCCACAGAGCAGUUACGUACUAUCAUCAGAUAUUUACUGGACACUUUGCUCAGCCUGCUUCAUGCUUCUAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-698.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -750.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 715.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((..((.......((((.(((((..((..(((....)))..))...))))).))))(((((((......((((((((...(((((.((.((((((((((((((.............(((((((....)))))))....(((........)))....(((((.(((((.(((((...(((((((..(((.((((........((((((..(...(((((((((((((((....(((((((.(((((........))))).))))).)).(((..........)))...(((..((((....))))))).(((......))).........)))))))).)))).))).)..))))))......)))).))).......)))))))((((...((((((((((.(.(((((.((.......))........((((((((..((((.((((((....))))))))))...(((((((((......(((((......))))).((((((((..((.(((...))).))..).)))))))..)))))))))(((((..(((((...((.((....)).))...)))))....)))))(((((.((....)).)))))(((....)))))))))))))))).).))))))).))).)))).....(((((...)))))))))).))))).)))))...(((((..(((((((..((..((..((((((((((......((.(((((((..((.(((((((....)))).))).))...)))))))))......)))))...)))))))..)))))))))....))))))))))))))))))).)))))...(((((...))))).))))))))))....(((.((.(((((.....))))).)).))))))))))((((((....))))))......(((..((((((((((.(((((...(((((....((((.((((.....(((.(((((((..(((((((((....)))))))))......)))).))).)))....)))).))))....((((.((((((((((.((.(((((.(((((.((((((.(((((((.....................)).))))).))((((....))))((.((((.((((.(((.(((((((.(.(((((((...))))))).))))(((....((((((((.(((.(.((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((..........))))))((((((...((....))....)))))).....((((((....(((......)))....(((((((...))))))).(((.(((.(((.(..........).)))))))))))))))..)).)))))))....(((((.........)))))...(((((((((((....(((((((.((((.(((((((((((.(((.(((((((....((((((.....((((((......((((((((((((((.((.((((............)))).)).).))))))))...((((((......)))))).....................((.(((((((.((.....)).))))))).)).......)))))......))))))(((((.((..(((.....(((((.((((((((...(((((((.(...(((........)))....).)))))))...)))))..)))))))).....)))..))..)))))..............))))))...)))......((((....))))..))))..))).)))))))))))((..((..((......((((....))))......))..))..))......(((((((((((..((((........))))..))..)))))))))....)))).))))).))....))))))...((((((.((..(((((((.....))))))).)).))).)))....)))))))).))))).........))))))))).)))))))((((.....))))))))))))..))))))).).))).......(((((.((((....)))).)))))(((((((((((((.....((((((((((........))))).))....))).....)))))))))))))((((.((((((((..((.....((((.......)))).(((.....))).....((......)).))..)))))))))))).)))......)))))..))))))).))))))).)))).))....))))...))))).))))))).)))))))))).))))((((.((.(((.(((.....((((((((((((((.((((.((.......)).).))).))))).))))))))).....))).)))))))))...))))).))))))))))))))).)))))..)))))..)))))(......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((..(,.......((((.(((((.,(,{,(((....))).,),,}.))))).))))(((((((......(((((((({,,{.(({(((.((((((((((((((..........,,,(((((((.,,.}}}}})).,,,|{{........))}....(((((.(((((.(((((...(((((((..(((.((((.,,.....((((((..(...{({(({(((((((((....(((((((.(((((.,,...,,))))).))))).)).,{{......,...|||...,|,..||||,..,)}},}}|{({{....,}))),........))))))))}.))}.}}).)..))))))...,,.)))).))).......)))))))((((...((((((((((.(.(((({.,,..{{({{{{...{{,{{({(((({{..((((.((((((....))))))))))..}|||||{|||{|,...(((((......))))}.,{(((((,..,,.{{{...}}}.||..,.))))))}{||||,,,)))|||{{.,{{{{{,,.{{.{,....})|)}...}}}))..|||}}},|{{{,.||...})).,,,,|(((....)))),))))))))))).).)))))))},)).)))).....(((({...}))))))))).))))).)))))...(((((..(((((((..{{,,{,,((((((((({{......||,{{|||||,,,{.((({(((,,,,||||,}||{.....}}}}}}})),)),,,))}}),,,))}))),,.),)))))))....))))))))))))))))))).)))}}...,{{{|.,.,,))).}),)))))))....(((.((.(((((.....))))).)).))))))))))(((((,....})))))...,.{(((..((((((((((.(((((...{((((,,.{((((.((((.....(((.{((((((..(((((((((....}))))))))......)))).))).)))....)))).))))}.,.{(((.((((((((((.{{.(((((.(((((.{(((({{((,..,,..{{{{{{{(((,(,.,{{{..{{||||||,,,|||..}}}),}||,(({((((((.((,{(((,(((.{.(((((((...))))))).)))),(((({{{({(((((.(({,({((((({{((({{{{{{,,(((,.,((((((((,,,(((....))}.,{(.((((((..........)))))).)},||}}}|||...)),..}))..))}}}))|((({({{{{(((....{{({{.,,.((((({(...}}))})).||..,,|}|||.,}}.,}}....,}))).)),)}}}}}},,,}|,|,||}}},..,}|||},}........,,.....)))).||,|||}}}.|||,,,...,,,.||,||||||||}|,..|{|||||.},.|{,,,,....,(({(({,,,,.,((((,({{{{{{({.|{|{{{|,...{{,,,,,{||||{||{||||}}|||,...{{((((......,)))))}....................((.(((((((.((.....)).))))))).)).{.,,,,}|||,.,,.,,}}},||(((,,.((,{(,,.,{,,{{{{{.{({{((({...,{{{{|{,,...{|{.....}},)}}.}},),,,)))))...)))),.}))}))))}.....})).})),}))}}|,.,,,.,,{{,...||}}}}..,|||{.....{|||....})))..})),.,|,,{|||||,,||||(({{{,.,((...{{.((((....))))......))..)))))))}}..}|||||{{||.|,.||||...{{{{{||||,,,|..|||||||}}....}}}}.})))),},,}}})))),,...{{((((.{{..(((((((.....))))))).}}.))),)}}....,,....,))}}})))},}}}},.}}))))))}.}))))}}||{{....||||}||||||||.,||||},,...)}}},,....(((((.((({....)))).)))))(((((((((((((.....((((((((((........))))).}}....))).....)))))))))))))|,,{.||||||||,,||..,,.((((.......)))).||..,.,.,,,,....{,.,,,,,}},||..}}|||||||}}},}})}},,}})))))}})).,},}||}}}},},})}),))})),,}}}...))))).)))))}).)))))))))).)))}{(({{((.(((.(((.....((((((((((((((,{(.{.((.......}}.).))}.)))))}})))))))).....))).))))))))).,,)))}).))))})))))))))).)))))..)))))..)))))(......)
Back