Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0049900
Sequence Length
2099 nt
GC Content
0.4335
UGAGUUCCUUCGGGGUUACUCCUGCAGUAGGUGGACUAUCAUCUGGGACAGUUGGGGAAGCCUCGACAGCCCUGAGUUCAGCAGCCCAGGUAGCUUUGCAGUCUCUCUCUCAUGCAAUGGCUUCAGCCGAGCAACAGCUACAGGUGCUGCAAGAGAAACAGCAGCAGCUUUUGAAGCUUCAGCAACAGAAAGCAAAGCUGGAAGCCAAGUUACAUCAGACAACAGCUGCAGCAGCUGCAGCAGCAUCAGCAGUAGGUCCUGUUCACAACUCUGUGCCUUCCAACCCAGUGGCUGCCCCUGGAUUCUUCAUUCAUCCAUCUGAUGUUAUUCCACCCACUCCAAAAACAACACCUCUUUUUAUGACUCCACCACUCACUCCACCCAAUGAAGCAGUUUCCGUUGUGAUUAAUGCCGAACUUGCACAGCUUUUCCCAGGCUCAGUCAUUGAUCCCCCAGCAGUCAAUCUUGCUGCACAUAACAAAAAUUCCAACAAGUCCAGAAUGAAUCCACUUGGUUCUGGUCUAGCCCUUGCAAUUUCUCAUGCUUCACAUUUUCUUCAACCUCCGCCUCACCAGUCCAUUAUUAUAGAGCGAAUGCAUUCAGGAGCAAGAAGAUUUGUGACCUUGGAUUUUGGGAGGCCUAUAUUGUUGACUGAUGUAUUGAUUCCCACUUGUGGAGACUUGGCCUCUUUGUCAAUUGACAUUUGGACAUUAGGAGAAGAGGUGGAUGGAAGGCGGUUGGUAGUGGCAACUGAUAUAAGCACUCAUUCACUAAUUCUUCAUGACUUAAUACCACCUCCCGUGUGCAGAUUCAUGAAGAUCACUGUUAUUGGACGUUACGGGAGUACAAAUGCCAGAGCCAAAAUCCCAUUAGGAUUUUACUAUGGUCAUACCUACAUCUUGCCUUGGGAAAGUGAACUGAAGUUAAUGCAUGAUCCUCUAAAGGGAGAGGGAGAAUCUGCAAACCAGCCAGAAAUUGACCAGCAUUUAGCAAUGAUGGUUGCUUUGCAGGAGGAUAUACAGUGCAGGUAUAACUUGGCUUGUCAUCGUCUGGAAACCCUUUUGCAAAGUAUUGAUCUUCCUCCUCUAAACAGUGCUAACAAUGCACAGUACUUUUUACGAAAACCAGAUAAGGCAGUUGAGGAAGACAGUAGGGUUUUUUCUGCUUAUCAAGAUUGUAUUCAGCUACAGCUUCAACUAAAUUUGGCUCAUAAUGCAGUGCAGAGGCUCAAAGUGGCGCUAGGUGCAAGCCGGAAGAUGUUGAGUGAAACAUCAAAUCCAGAAGAUUUAAUUCAGACAUCUUCCACAGAGCAGUUACGUACUAUCAUCAGAUAUUUACUGGACACUUUGCUCAGCCUGCUUCAUGCUUCUAAUGGACACUCUGUUCCUGCAGUUUUGCAGAGCACAUUUCAUGCCCAGGCCUGUGAAGAGCUCUUUAAACACUUGUGCAUCAGUGGAACCCCAAAGAUACGGUUACAUACUGGUCUUCUUCUUGUUCAACUGUGUGGUGGUGAAAGGUGGUGGGGUCAAUUUCUUUCUAAUGUCCUUCAGGAAUUGUACAAUUCGGAACAGCUUCUCAUCUUUCCACAGGAUAGGGUCUUCAUGUUACUUUCCUGCAUUGGUCAAAGAUCACUUAGUAAUAGUGGAGUAUUAGAAAGCUUACUUAAUCUCUUGGAUAAUUUAUUGUCACCUCUUCAGCCACAGUUACCCAUGCAUAGGAGGACAGAAGGAGUACUAGAUAUUCCCAUGAUCAGUUGGGUUGUUAUGCUGGUGUCCAGGUUGCUGGAUUAUGUGGCAACUGUUGAAGAUGAAGCAGCAGCUGCAAAGAAACCUUUGAAUGGUAAUCAGUGGAGUUUUAUUAACAAUAAUCUACACACUCAGAGCUUAAAUAGAUCUUCUAAAGGCAGCAGUAGCCUUGAUAGAUUAUAUUCCAGAAAAAUCAGAAAGCAGCUUGUUCAUCAUAAACAGCAACUUAACCUACUAAAAGCAAAGCAGAAGGCAUUGGUAGAACAGAUGGAAAAAGAAAAAAUACAAAGUAACAAAGGAUCAUCAUAUAAACUCCUGGUAGAACAAGCAAAACUAAAGCAGGCCACUUCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-572.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -612.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 583.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((..(((((((((((.((((....(.(((((..(((...(((.(.(((((((...))))))).)))))))))))).)(((((.(((.(.((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((..........))))))((((((...((....))....)))))).....((((((....(((......)))....(((((((...))))))).(((.(((.(((.(..........).)))))))))))))))..)).)))))))....(((((.........)))))...(((((((((((....(((((((.((((.(((((((((((.(((.(((((((....((((((.....((((((......((((((((((((((.((.((((............)))).)).).))))))))...((((((......)))))).....................((.(((((((.((.....)).))))))).)).......)))))......))))))(((((.((..(((.....(((((.((((((((...(((((((.(...(((........)))....).)))))))...)))))..)))))))).....)))..))..)))))..............))))))...)))......((((....))))..))))..))).)))))))))))((..((..((......((((....))))......))..))..))......(((((((((((..((((........))))..))..)))))))))....)))).))))).))....))))))...((((((.((..(((((((.....))))))).)).))).)))....)))))))).))))).........))))))))).)))))))((((.....))))))))))))..))))))).).))).......(((((.((((....)))).)))))(((((((((((((.....((((((((((........))))).))....))).....)))))))))))))((((.((((((((..((.....((((.......)))).(((.....))).....((......)).))..)))))))))))).)))))...(((((........((((((((.(((((................)))))...)))))))))))))(((((..(((((((.(((.(((.....((((((((((((((.((((.((.......)).).))).))))).))))))))).....))).))))))..((((((((((........((...((((((..((((((((((((.((((...(((((((..(((((.((((....)))))))))......((((.((((....(((((....)))))....)))).))))((((..((((((((.(((.((.....((((((((((((((((.((((..((((((.(.(((((...((((((((((......((((((((((((((((..(((((....))))).)))..(((....((((((((((((((.((...(.....)...)).)))))...)))..)))))).....)))......))).))))))))))................(((((....))))))))))....)))))..))))))..))))))..)))))))))))).))))).))).....)))))..)))))..)))..)))))))))))((((((((.......))))))))...)))))))))))))..)))))))))...)))))).))))))....(((((................))))).))))..)))))....((((...))))...)))).)))))))))))..))..........................(((((((((((.................(((((((..((..........)).)))))))..................................((((.............))))))).)))))))).............))))((....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.({{{{,((((((({{((,((((..,{({((({{{.,,,{{|(((.{.(((((((...))))))).||}|{|||||||,|{((({.(((.{.((((((((((((((((((((((.((((((((({{{(((,.,,|||,{,(,((((((..........)))))){||{{{,..(({{,.||....,,,,}}...))||{||||{{{(((,,,,{{{||.,,.(((((((...))))))).||..,,|}{||.,|}.,}},...,,}}},))})|||||||..|{{|||||||.,,}|||,,...,,,,,.,||,,...||||{{{{{{{....{{{((({.{{{,.(((((((((({.{{{.((({(({....((((((....,((((((......(((((((((((((,.{{.{{{(,..,,,......)))).)),),))))))))...{{((((......,))))),....................((.(((((((.((.....)).))))))).)).,.....)))}}......))))))(((((.((.,(((.....(((((.((((((((...(((((((.{...(((........)))....}.)))))))...))))}..)))))))).....})),,))..))))).........,....))))))...))),.....((((....))))..})))..}}}.})))))))))){{||||,,|{,,,{{,((((,,..}}}}......)}..)),,)},,,...(((((((((,{..,(({.,......))))..,}..)))))))))....})}}.})))).)}..,,))))}}...{{((((.{(..(((((((.....))))))).}}.))).}}}...,}},,},}},,,)))}..,}}},.))))))))).))))))}{(((....,))))))))))))..))))))).}.))).......(((((.((({....)))).))))){((((((((((((.....((((((((((........))))).}}....))).....))))))))))))}{(((.((((((((..((..,,.((((.......)))).}}..,.,.,,......((......)).))..)))))))))))}|||}},..,|||||,.......(((((({{.{((({,{,,{,........,,}))))...}}))}))}}}|||((({{.,((((({(,({(,({{..,,,((((((((((((((,{(.{.((.......}}.).))}.)))))}}))))))))...,,|||,|}}}||,.((((....|}}}..|}}.||...{{{|||,,|||||{|{{{{{,|{{{...{((((((..{{{{{{{(((....}))|||||,..,{,{((((.,,,|}..}|||||.}}}))}}).,.,||||.||||(((({.((((((((.(((..({....((,(((((((((((({{((((..((((((,{.(((((...((((((((((.,....(((((((((((((.,,.,(((((,,.,,}}}},|{},,|.}}}}.((((({((((((((.((...{.....}...)).)))))...)))..}))))){{{{.......}))))).))))))))))..........,....,|{{{,....}))}))))))....)))))..)))))}.}))))))..)))))))))))).))))).),}..}}.,,)))..)))))..))).,))))))))}))||||||||,},,,,}})})}}}}}}}))))}))))))))..)))))))))..,||,,}},.,)}}.....(((((...{{,,....,},,,))))).)))),,)))))....{{{{||{,}},,,,||}}.}}}})))))}}.,)}},...,},..|,....,,........(((((((((((.................(((((((..((..........)).)))))))....,,||..........................{{({.............})))))).)))))))).........,.,))})){|....))
Back