Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0063100
Sequence Length
1748 nt
GC Content
0.4079
GGUCUUCAUGUUACUUUCCUGCAUUGGUCAAAGAUCACUUAGUAAUAGUGGAGUAUUAGAAAGCUUACUUAAUCUCUUGGAUAAUUUAUUGUCACCUCUUCAGCCACAGUUACCCAUGCAUAGGAGGACAGAAGGAGUACUAGAUAUUCCCAUGAUCAGUUGGGUUGUUAUGCUGGUGUCCAGGUUGCUGGAUUAUGUGGCAACUGUUGAAGAUGAAGCAGCAGCUGCAAAGAAACCUUUGAAUGGUAAUCAGUGGAGUUUUAUUAACAAUAAUCUACACACUCAGAGCUUAAAUAGAUCUUCUAAAGGCAGCAGUAGCCUUGAUAGAUUAUAUUCCAGAAAAAUCAGAAAGCAGCUUGUUCAUCAUAAACAGCAACUUAACCUACUAAAAGCAAAGCAGAAGGCAUUGGUAGAACAGAUGGAAAAAGAAAAAAUACAAAGUAACAAAGGAUCAUCAUAUAAACUCCUGGUAGAACAAGCAAAACUAAAGCAGGCCACUUCAAAGCACUUUAAGGAUUUAAUUCGUUUACGUCGGACAGCAGAAUGGUCCCGUUCUAAUUUAGACACAGAAGUUACAACAGCAAAAGAAAGUCCUGAGAUAGAACCACUUCCAUUUACUCUGGCCCAUGAGCGUUGUAUCUCAGUAGUCCAGAAACUUGUUCUGUUUCUUCUCUCCAUGGACUUUACAUGUCAUGCAGAUCUCUUAUUGUUUGUUUGUAAGGUUCUUGCACGCAUUGCAAAUGCCACGAGGCCAACUAUUCAUCUGUGUGAGAUUGUGAACGAACCCCAGCUGGAAAGACUGCUGUUACUUUUGGUUGGAACUGACUUCAAUAGAGGAGAUAUAUCUUGGGGUGGUGCUUGGGCUCAGUAUUCCUUAACUUGCAUGCUACAAGAUAUUUUAGCAGGAGAAUUACUGGCUCCAGUAGCCGCAGAAGCCAUGGAGGAAGGAACAGUGGGUGAUGAUGUAGGUGCGACAGCUGGUGACUCUGAUGACUCCCUUCAACAGUCCUCAGUUCAGUUGCUGGAAACUAUAGAUGAACCUUUGACACAUGACAUAACAGGUGCACCUCCUCUGUCCUCUUUGGAAAAAGAUAAAGAAAUUGACCUUGAGUUACUUCAGGAUCUAAUGGAAGUUGACAUUGAUCCUUUAGAUAUUGAUUUGGAAAAGGACCCUCUUGCAGCCAAGGUUUUUAAGCCAAUAAGCAGUACAUGGUAUGAUUAUUGGGGUGCUGAUUAUGGGACCUACAAUUACAACCCUUACAUUGGAGGUCUGGGAAUUCCUGUAGCAAAGCCACCAGCAAACACGGAGAAGAACGGAUCACAGACAGUUAGCGUUUCAGUCUCUCAGGCCCUGGAUGCUCGCCUAGAAGUUGGACUUGAACAGCAAGCAGAACUGAUGUUGAAAAUGAUGUCUACUCUGGAGGCAGAUUCCAUUUUACAGGCAUUAACAAAUACAUCUCCUACAUUAUCACAGUCUCCCACUGGAACAGAUGAUUCACUUCUAGGGGGUUUACAAGCAGCAAACCAAACCAGCCAGCUUAUUAUACAGUUAUCAUCUGUCCCAAUGUUAAAUGUUUGUUUCAACAAACUUUUUUCCAUGCUUCAAGUCCAUCAUGUUCAGUUGGAGUCACUUCUCCAAUUGUGGCUCACACUGAGCCUGAAUUCUAGUUCAACUGGAAACAAAGAAAAUGGAGCAGACAUAUUUUUAUAUAAUGCUAAUAGGAUACCUGUUAUUUCAUUAAAUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-443.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -479.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 456.2
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((.((((..((((((((((((((..((((.((((.......))))(((((..........))))).........(((((....)))))...))))..)))).........))))).((((((((((((((.(((((.......((((........)))).((((((((..(((((((((((.((((((((((((((..(((((........)))))..)))))((((....(((((((((((.....(((((................))))).........((((.....(((((....(((((.......)))))...)))))........................(((((((((((.................(((((((..((..........)).)))))))..................................((((.............))))))).)))))))).......))))..)))).)))))))..))))..((((.(((..((((((.((((((.....((((((....((((((.(((((((.........................)).))))).)))))).....))))))..))))))...))))))))).))))..))))))))).))))))..((((((((((.((((((((.((((((((.((((((((((......((((.(((.((((((...)))))).)))..))))..(((....))).........)))))))))).).))))).......((((((((((.(((....)))..))))))))))......((((....)))).........(((.(((..((((.((((.((((((((((..........((((.((....)).)))))))))...))))))))).))))))).))).)))))))))))))))))))).((((.....(((((......((((.(.(((..((((.((((.........)))).)))).))).).))))....))))).....))))..)))))..).)))))))))))).)))..))))))))))).)))))..))))..)))...)))(((((........((((((.((((........))))))))))...(((((((..((((...((((...))))....))))((((....))))(((((((......((((.......((((..(((((......((((((.((((............)))).))))))(((....))).......(((..((((....(..(((((.(((((....((.....))...)))))...)))))..)...))))..)))(.(((((((((.(((((((.....)))).......(((((......((((((((....(((((.....)))))......))))))))......))))).....((((.((.((((.....))))))...)))).)))))))))))).).........)))))..))))))))....)))))))..((((.......))))..)))))))..((((((((((((.....((((((((((.............(((.(((((((..(((((((..........)))))))..))))))).))).............)))))).))))....)))))))))))).........(((((.(((((((...)))))))...)))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..((((.({,.(((((.(((((((.{..,({.,(((..,,...||,|((((({{(({..,....}}}.{{{{...})}}........((((((.((((.(((((((((((((((((.((((((,,,,...((((((.....)))))).,||,||.(((((((((({.{,,(((((,,(((((((((||||,,{(((((..(((((........}})}}..}|)}|}..,..,,({{{{,.,|||.....((({{,..,,,,,...,}}},}}))).},.},}}}},{..,,{{(((((....(((((.......)))))...))))).)}}},.,|.....,,....})))))))),,))))}..,,,)))))))))))(((((((..((..........)).)))))))....,,{{............................},}))),.......)))))))){(((((((......,,,,{,.,{{,........}}.}}}}|,,((,.,,,.,|{|||,.||,||,,.,..((((((....((((((.(((((((......|{,......,,........)),})))).)))))).....)))))}..{{||||...{|{|.,,,..,,))))...),))}}}..)))))))|((((((((.((((((((.{(((((((.((((((((((......{,((,,(({(((,,({{.,|||||.,,,.}))))..|||,,,}))).}},.....)))))))))).),})))),......((((((((({.(((....))}..})))))))))......{{{{....}}))||.....}}|||.|(({{((((.((((.((((((((({.........{((((.{{....}}.)))))))}),,.))))))))).))))}))}),,,}}))))))))))))))))})))))))))..))).)))..)).))..))))))}||||}||||}}}}...,,))),.)),).}))),})).))))).}}.).)))))))(((((...((((.((((((((((((((,.,{{{.{,,{{{{{|,,.,,})}...}}}....{((((((.{{{.{{..((((((.((((........))))))))))..}},,......||{{...(({....}})}..}})))))))}......(((((((.,.((((...))))..)))))))))))).,{{{.{.((((({.((((............)))).}))))).}.}}}{(((((((((.{((..((((....{..(((((.(((((....{{.....)}...)))))...)))))..}...))))..))},.....,..,.(((((((((..{(((.{.,{{,..(((((......((((((((....(((((.....)))))......))))))))......)))))..............,{,..,,{,|{((|({{(({{{{,,,,|,}}}||,||{{,..,,,,.|,,..,,...,,.}}..}}},......,||,.}}}}})))).}}},}},.,,{.((((((....)))))).,}}},.}.))))))))))))){{{.{{{((((,{((({{{{..,,,,,,,,)}|||||..}}))))),}}}.(((((((...)))))))...,{{{{.{((.......)}).}))}}......))))}}))))}.))))))))).))))....)))))
Back