Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0069800

Sequence Length

1400 nt

GC Content

0.4193

GUUCUUGCACGCAUUGCAAAUGCCACGAGGCCAACUAUUCAUCUGUGUGAGAUUGUGAACGAACCCCAGCUGGAAAGACUGCUGUUACUUUUGGUUGGAACUGACUUCAAUAGAGGAGAUAUAUCUUGGGGUGGUGCUUGGGCUCAGUAUUCCUUAACUUGCAUGCUACAAGAUAUUUUAGCAGGAGAAUUACUGGCUCCAGUAGCCGCAGAAGCCAUGGAGGAAGGAACAGUGGGUGAUGAUGUAGGUGCGACAGCUGGUGACUCUGAUGACUCCCUUCAACAGUCCUCAGUUCAGUUGCUGGAAACUAUAGAUGAACCUUUGACACAUGACAUAACAGGUGCACCUCCUCUGUCCUCUUUGGAAAAAGAUAAAGAAAUUGACCUUGAGUUACUUCAGGAUCUAAUGGAAGUUGACAUUGAUCCUUUAGAUAUUGAUUUGGAAAAGGACCCUCUUGCAGCCAAGGUUUUUAAGCCAAUAAGCAGUACAUGGUAUGAUUAUUGGGGUGCUGAUUAUGGGACCUACAAUUACAACCCUUACAUUGGAGGUCUGGGAAUUCCUGUAGCAAAGCCACCAGCAAACACGGAGAAGAACGGAUCACAGACAGUUAGCGUUUCAGUCUCUCAGGCCCUGGAUGCUCGCCUAGAAGUUGGACUUGAACAGCAAGCAGAACUGAUGUUGAAAAUGAUGUCUACUCUGGAGGCAGAUUCCAUUUUACAGGCAUUAACAAAUACAUCUCCUACAUUAUCACAGUCUCCCACUGGAACAGAUGAUUCACUUCUAGGGGGUUUACAAGCAGCAAACCAAACCAGCCAGCUUAUUAUACAGUUAUCAUCUGUCCCAAUGUUAAAUGUUUGUUUCAACAAACUUUUUUCCAUGCUUCAAGUCCAUCAUGUUCAGUUGGAGUCACUUCUCCAAUUGUGGCUCACACUGAGCCUGAAUUCUAGUUCAACUGGAAACAAAGAAAAUGGAGCAGACAUAUUUUUAUAUAAUGCUAAUAGGAUACCUGUUAUUUCAUUAAAUCAAGCAUCAAUAACUAGCUUUCUCACAGUGUUAGCUUGGUAUCCCAAUACUUUGCUCCGGACAUGGUGCCUUGUGCUUCAUAGCCUAACACUCAUGACAAACAUGCAGCUUAAUUCUGGUUCCAGCAGUGCCAUUGGAACUCAGGAGAGUACUGCUCAUUUGUUGGUUUCAGAUCCAAACCUAAUUCAUGUAUUAGUGAAAUUUCUUUCUGGCACCAGUCCACAUGGAACAAAUCAACACAGUCCACAGGUUGGUCCUACAGCUACACAAGCUAUGCAAGAAUUUCUUACUCGAUUACAAGUGCAUCUUUCUUCAACAUGUCCUCAGAUAUUCAGUGAAUUUUUGCUCAAGCUAAUUCAUAUACUUUCAACUGAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-366.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -396.69

Frequency: 0.0000

Diversity: 380.11

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((.(((((...)))))....(((((((((.........((((.(((((((........((((((((((.(((....)))..))))))))))....(((((......((((......))))...((((((((.((((.((((((((((..........((((.((....)).)))))))))...))))))))).)))).)))).(((((.((((((((((.((((.((((.(((((((...(((.((.(((((((((((.((((((.....(((((((....(((((((..(((((((..........((...(((((..(((.((..(..(((....((((((..(((..((((((........))))))....(((((((.(((.((..((((((.((((........))))))))))..))..........((........))......))))))))))......(((((((...((((...))))..)))))))(((.((......)).)))................)))..)))))))))..)..)).)))..))))).)))))))))...((........))...........(((.((((((.((((((((((((...........)))).).))..))))).)))).)).))).))))))))))))))..((((((((....(((((.....)))))......))))))))..................)))))).))))..((.((((((..((....))..))))))))(((((.(.....).)))))......)))))))..)).)))...)))))))...)))).))))....((((((....))))))))))))))))))))))))))...(((((.(((((((((......))))))))).((((((...))))))....(((((((...)))))))...........((((((((............(((((.(((((((...)))))))...))))).(((((((.....((((..(((.......))))))))))))))..........))))))))((((.((((((((((.(((....))).))).......((((((...((((.....((((((((((((........))))))).))))).....))))...))))))(((((.......)))))...(((((......)))))..........))))))))))))))))...........))))))))))))))))).)))..((((.....)))).)))))))))....((((........))))..............(((((....)))))...(((((((...((....)).)))))))...(((((....)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((.(((((...}))))....{((((((((......(((((({.{{((((,........((((((((({.(({.,,,)}}.,}}}}}|||||,.....{{{{,,,.}|}|{{.....}}}||||((((((((.((((.((((((((({.........{((((.{{....}}.)))))))}),,.))))))))),)))},)))).(((({,((((((((((,..{((((((((((((((((((.{{....||{(({({,((((,.({,{,,.,{{,,,|}}}.||||{{{.{(((({({...,,.,,,.,{..,(({((..{{,.{,,,,..{|{|,|{{(({{{,,({{..((((({...,,,},,,,}}}....(((((((.({{.{{..((((((.((((........))))))))))..}},,....,.,|{|...(({...,}}}}..}}))))))))......(((((((.,.((((...))))..)))))))|||}}||,||,||({{{||.{|||,.....,...,,),,)}))))))}|,...))}))),}}},}}.}})))))...,.,{{{{,.{{{||....,|.....||,.,|||||.,{|||||,((((.,.|,..,},.)))).},,|,,}}}||,|,,}.}),))}.,}}}}|||||,,,...((((((((....(((((.....)))))......))))))))......}}}}}.))))))))))))......})))))|(.(((((((((..,{{.,,.{{.(((({.,.....|.,,,,,...}}.,},,|||........))).))))))))).}}..,,,.....{(((({....))))}))))))))))))))))...{{{{(((,(({(((((((((,,,,..}}}}}}}}),|||||,.,,)))))},,..(((((((...)))))))...........((((((((.,{{,....,,.{{(((.(((((((...)))))))...}}}}}.,{{((((.....,,,{,.||,.......})))})))))}))),,,,..,...))))))))((((.(((((((.{(.(((....)))..,,.......((((((...((((.....((((((((((((........))))))).)))))..,..))))...))))))(({{{.....,,))}))..,{{{{{....,,)))}}........,.)))))))))))..,})},})}}.)).})))))...,..)))))).)))..((((.....)))).)))))))))....,,{{.{,...,.||}}..............{{(({....))))}...(((((((...((....)).)))))))...(((((....)))))