Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0070200
Sequence Length
2632 nt
GC Content
0.4267
GUUCUUGCACGCAUUGCAAAUGCCACGAGGCCAACUAUUCAUCUGUGUGAGAUUGUGAACGAACCCCAGCUGGAAAGACUGCUGUUACUUUUGGUUGGAACUGACUUCAAUAGAGGAGAUAUAUCUUGGGGUGGUGCUUGGGCUCAGUAUUCCUUAACUUGCAUGCUACAAGAUAUUUUAGCAGGAGAAUUACUGGCUCCAGUAGCCGCAGAAGCCAUGGAGGAAGGAACAGUGGGUGAUGAUGUAGGUGCGACAGCUGGUGACUCUGAUGACUCCCUUCAACAGUCCUCAGUUCAGUUGCUGGAAACUAUAGAUGAACCUUUGACACAUGACAUAACAGGUGCACCUCCUCUGUCCUCUUUGGAAAAAGAUAAAGAAAUUGACCUUGAGUUACUUCAGGAUCUAAUGGAAGUUGACAUUGAUCCUUUAGAUAUUGAUUUGGAAAAGGACCCUCUUGCAGCCAAGGUUUUUAAGCCAAUAAGCAGUACAUGGUAUGAUUAUUGGGGUGCUGAUUAUGGGACCUACAAUUACAACCCUUACAUUGGAGGUCUGGGAAUUCCUGUAGCAAAGCCACCAGCAAACACGGAGAAGAACGGAUCACAGACAGUUAGCGUUUCAGUCUCUCAGGCCCUGGAUGCUCGCCUAGAAGUUGGACUUGAACAGCAAGCAGAACUGAUGUUGAAAAUGAUGUCUACUCUGGAGGCAGAUUCCAUUUUACAGGCAUUAACAAAUACAUCUCCUACAUUAUCACAGUCUCCCACUGGAACAGAUGAUUCACUUCUAGGGGGUUUACAAGCAGCAAACCAAACCAGCCAGCUUAUUAUACAGUUAUCAUCUGUCCCAAUGUUAAAUGUUUGUUUCAACAAACUUUUUUCCAUGCUUCAAGUCCAUCAUGUUCAGUUGGAGUCACUUCUCCAAUUGUGGCUCACACUGAGCCUGAAUUCUAGUUCAACUGGAAACAAAGAAAAUGGAGCAGACAUAUUUUUAUAUAAUGCUAAUAGGAUACCUGUUAUUUCAUUAAAUCAAGCAUCAAUAACUAGCUUUCUCACAGUGUUAGCUUGGUAUCCCAAUACUUUGCUCCGGACAUGGUGCCUUGUGCUUCAUAGCCUAACACUCAUGACAAACAUGCAGCUUAAUUCUGGUUCCAGCAGUGCCAUUGGAACUCAGGAGAGUACUGCUCAUUUGUUGGUUUCAGAUCCAAACCUAAUUCAUGUAUUAGUGAAAUUUCUUUCUGGCACCAGUCCACAUGGAACAAAUCAACACAGUCCACAGGUUGGUCCUACAGCUACACAAGCUAUGCAAGAAUUUCUUACUCGAUUACAAGUGCAUCUUUCUUCAACAUGUCCUCAGAUAUUCAGUGAAUUUUUGCUCAAGCUAAUUCAUAUACUUUCAACUGAAAGGGGUGCUUUCCAGACAGGCCAAGGACCUCUCGAUGCCCAAGUGAAGCUCUUAGAAUUCACUCUGGAGCAGAAUUUUGAAGUCGUUUCAGUUAGUACUAUUUCUGCCGUGAUAGAAUCGGUUACAUUUUUAGUGCACCACUAUAUCACUUGCUCAGACAAAGUAAUGUCAAGAAGUGGAUCAGAUAGCUCCGUGGGUGCUCGAGCAUGCUUUGGGGGACUCUUUGCCAAUCUUAUUCGUCCGGGUGAUGCAAAAGCAGUUUGUGGCGAAAUGACAAGAGAUCAACUCAUGUUUGAUUUGUUAAAACUUGUUAACAUUUUAGUGCAGCUGCCUCUUUCAGGCAAUAGGGAAUACAGUGCAAGAGUGUCUGUGACCACAAAUACAACAGAUAGUGUUUCAGAUGAAGAAAAAGUCUCAGGAGGCAAAGAUGGCAAUGGAAGCAGUACCAGUGUUCAAGGAUCGCCUGCAUAUGUUGCUGACUUAGUCUUAGCCAACCAACAAAUUAUGAGCCAGAUUUUGUCUGCUCUGGGCCUGUGUAAUAGCAGUGCCAUGGCAAUGAUAAUUGGAGCAAGUGGAUUACAUCUCACUAAACAUGAAAACUUUCAUGGUGGGUUGGAUGCCAUAUCAGUUGGGGAUGGAUUAUUUACCAUACUGACAACCCUUAGUAAAAAAGCUUCUACAGUCCACAUGAUGCUGCAGCCAAUUUUAACAUACAUGGCCUGUGGAUAUAUGGGCAGACAAGGCUCUCUUGCUACUUGCCAGUUAUCUGAGCCAUUAUUGUGGUUCAUUUUGAGAGUAUUGGAUACUAGUGAUGCCUUGAAAGCAUUUCAUGAUAUGGGUGGUGUUCAGCUCAUAUGCAAUAAUAUGGUUACUAGUACAAGGGCUAUUGUGAACACUGCAAGAAGUAUGGUAUCAACUAUUAUGAAAUUUCUUGACUCUGGUCCAAAUAAAGCUGUUGACAGCACAUUGAAAACAAGAAUACUAGCUUCUGAGCCUGACAAUGCUGAAGGGAUUCAUAACUUUGCACCCCUCGGUACAAUCACAUCUAGCAGUCCUACUGCCCAACCAGCUGAAGUGCUAUUGCAGGCCACACCUCCUCACAGAAGAGCUCGCUCUGCUGCUUGGUCCUACAUCUUUCUUCCAGAGGAGGCUUGGUGUGACCUUACCAUUCACCUUCCUGCAGCAGUGCUGCUUAAGGAGAUACAUAUCCAGCCUCAUCUUGCAUCUCUUGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-728.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -782.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 696.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.(((((...)))))....(((((((((.........((((.(((((((........((((((((((.(((....)))..))))))))))....(((((......((((......))))...((((((((.((((.((((((((((..........((((.((....)).)))))))))...))))))))).)))).)))).(((((.((((((((((.((((.((((.(((((((...(((.((.(((((((((((.((((((.....(((((((....(((((((..(((((((..........((...(((((..(((.((..(..(((....((((((..(((..((((((........))))))....(((((((.(((.((..((((((.((((........))))))))))..))..........((........))......))))))))))......(((((((...((((...))))..)))))))(((.((......)).)))................)))..)))))))))..)..)).)))..))))).)))))))))...((........))...........(((.((((((.((((((((((((...........)))).).))..))))).)))).)).))).))))))))))))))..((((((((....(((((.....)))))......))))))))..................)))))).))))..((.((((((..((....))..))))))))(((((.(.....).)))))......)))))))..)).)))...)))))))...)))).))))....((((((....))))))))))))))))))))))))))...(((((.(((((((((......))))))))).((((((...))))))....(((((((...)))))))...........((((((((............(((((.(((((((...)))))))...))))).(((((((.....((((..(((.......))))))))))))))..........))))))))((((.((((((((((.(((....))).))).......((((((...((((.....((((((((((((........))))))).))))).....))))...))))))(((((.......)))))...(((((......)))))..........))))))))))))))))...........))))))))))))))))).)))..((((.....)))).)))))))).....((((........))))....((((((((.(..(((..(((((((((.(((((((...((....)).)))))))........(((((((((((((.(((.((.....))..))).))))))((((..(.((((...(((((.(((......))))))))...)))).)..)))).))))))).((((((((((((((.(((.(((..(((((.(((...(((((...)))))...(((((.((..((((......)))).)))))))(((((((.((((((..(.((((....)))).)....)))).)).))))...)))...((((.(((.(...(((....)))...).)))))))..((((.(((.....))).))))(((..((((((......))))))..)))))).)))))..))).))))))....))))))..)))))..))))))))).)))...((((((........))))))..).))))))))....(((.(((((.(((((((.......(((((((....(((....(((...(((((((...((((((((.......)))).))))...........((((.((((...))))))))...(((((((((...((((.((((((........((((((((((.(((((((.(((((.(((...((((((....))))))...))).))))).....(((((..((.............))..)))))........(((......))).....)))))))....))))....))))))........))))))))))...)))))))))...((((((..((..((((.(..(((((..((((((((((....)))))))......)))..)))))..).)))))).))))))..(((((((((.....(((.(((.((((((.((((((......))))))...((((((...((((((..((........((((((((.(.(((........))).).))))))))))..)))))).......((((....))))................))))))...)))))).(((...((((((.(((...((......))...)))))))))...)))......(((((...)))))))).)))..)))))))))..)))))))....)))...)))...((((....))))))))))).......)))))))))))).)))((((((.((((((..........((.((((...(((((...)))))..)))).))..)))))).))))))..)(((((.....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((.(((((...}))))...,(((((((((......(((((({.({((((,........((((((((((.(({.,,,)}}.,}}|}||||||,.....{{{{,,,.}|}|{{.....}}}||||((((((((.((((.((((((((({.........{((((.{{....}}.)))))))}),,.))))))))),)))},)))).(((({,((((((((((,..{((((((((((((((((((.{{....||{(({({,((((,.({,{,,.,{{,,,|}}}.||||{{{.{(((({({...,,.,,,.,{..,(({((..{{,.{,,,,..{|{|,|{{(({{{,,({{..((((({...,,,},,,,}}}....(((((((.({{.{{..((((((.((((........))))))))))..}},,....,.,|{|...(({...,}}}}..}}))))))))......(((((((.,.((((...))))..)))))))|||}}||,||,||({{{||.{|||,.....,...,,),,)}))))))}|,...})}))),}}},}}.}})))))...,.,{{{{,.{{{||....,|.....||,.,|||||.,{|||||,((((.,.|,..,},.)))).},,|,,}}}||,|,,}.}),))}.,}}}}|||||,,,...((((((((....(((((.....)))))......))))))))......}}}}}.))))))))))))......})))))|(.(((((((((..,{{.,,.{{.(((({.,.....|.,,,,,...}}.,},,|||........))).))))))))).}}..,,,.....{(((({....))))}))))))))))))))))...{{{{{((,(({(((((((((,,,,..}}}}}}}}),|||||,.,,)))))},,..(((((((...)))))))...........((((((((.,{{,....,,.{{(((.(((((((...)))))))...}}}}}.,{{((((.....,,,{,.||,.......})))})))))}))),,,,..,...))))))))((((.(((((((.{(.(((....)))..,,.......((((((...((((.....((((((((((((........))))))).)))))..,..))))...))))))(({{{.....,,))}))...{{{{{....,,)))}}........,.)))))))))))..,})},}),}.)).})))))...,..)))))),))}..((((.....)))).)))))))).....{(((.,......)))}....((((((((.,..(((..(((((((((.(((((((...((....)).)))))))........,{(((((((((((.(({.((.....})..|||,}}}}||(((({{({(((({,,((({..,{{.|||||)|}})|||,..,,,|,|,,}}},,)))))}}.((((({((((((((,(((.({{..{((((.({{...{{|||.,,)}}},,,||||{{,{{..((((......)))).}}}})))|,,|{{{.,|||{||.|,|||{,,,,))}}.)..}})))}.,)}}}}}}}..}}}..((((.(((.{...(((....)))...).))))))}.,{(((,(((,,,,,|}}.})))|||,,|(((({......)))))}..,,}))).)))}),,))).))))))|...,}}}}}..,))))..))))))))).)))...{(((((........))))))..}.))))))))....(((.(((((.(((((((,,...((((((((((.(((((((({,.(({.(((((((((((..(((((,.........((({,((..,,.{((((((((((((,....,,,}.)))))(((((((((...((((.((((((........((((((((((.(((((((.(((((.(((...((((((....))))))...))).))))).....{(((({{(,,{{{,.....,..))}.})))}........|{{,.....,,,..,..)))))))....))))....))))))........))))))))))...)))))))))...((((((..,,..((((.{..(((((..((((((((((....)))))))}.....}))..)))))..}.)))))).)))))).......|))))))}.}})}))))|.})))).))))))),....,,,,,,..,........}))).))).)))))))))((((((((.(.(((........))).).))))))))..{{{,{|.,.,.....((((....))))...,},...,}.}}}.}))).)}}))}|.|||(({,,.((((({.(((.,.((......)).,,))}))))))...}},......(((((...)))))|||,.|{{{.|,,|||||.,}})}||}.....,,,|,..|,|.,|||,...)))})))),)}}}.....)))))))))))).)))((((((.((((((..........{{.((((...(((((...)))))..}))).)}..)))))).))))))..)(((((.....)))))
Back