Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0073000
Sequence Length
2448 nt
GC Content
0.4252
GAGAAUUACUGGCUCCAGUAGCCGCAGAAGCCAUGGAGGAAGGAACAGUGGGUGAUGAUGUAGGUGCGACAGCUGGUGACUCUGAUGACUCCCUUCAACAGUCCUCAGUUCAGUUGCUGGAAACUAUAGAUGAACCUUUGACACAUGACAUAACAGGUGCACCUCCUCUGUCCUCUUUGGAAAAAGAUAAAGAAAUUGACCUUGAGUUACUUCAGGAUCUAAUGGAAGUUGACAUUGAUCCUUUAGAUAUUGAUUUGGAAAAGGACCCUCUUGCAGCCAAGGUUUUUAAGCCAAUAAGCAGUACAUGGUAUGAUUAUUGGGGUGCUGAUUAUGGGACCUACAAUUACAACCCUUACAUUGGAGGUCUGGGAAUUCCUGUAGCAAAGCCACCAGCAAACACGGAGAAGAACGGAUCACAGACAGUUAGCGUUUCAGUCUCUCAGGCCCUGGAUGCUCGCCUAGAAGUUGGACUUGAACAGCAAGCAGAACUGAUGUUGAAAAUGAUGUCUACUCUGGAGGCAGAUUCCAUUUUACAGGCAUUAACAAAUACAUCUCCUACAUUAUCACAGUCUCCCACUGGAACAGAUGAUUCACUUCUAGGGGGUUUACAAGCAGCAAACCAAACCAGCCAGCUUAUUAUACAGUUAUCAUCUGUCCCAAUGUUAAAUGUUUGUUUCAACAAACUUUUUUCCAUGCUUCAAGUCCAUCAUGUUCAGUUGGAGUCACUUCUCCAAUUGUGGCUCACACUGAGCCUGAAUUCUAGUUCAACUGGAAACAAAGAAAAUGGAGCAGACAUAUUUUUAUAUAAUGCUAAUAGGAUACCUGUUAUUUCAUUAAAUCAAGCAUCAAUAACUAGCUUUCUCACAGUGUUAGCUUGGUAUCCCAAUACUUUGCUCCGGACAUGGUGCCUUGUGCUUCAUAGCCUAACACUCAUGACAAACAUGCAGCUUAAUUCUGGUUCCAGCAGUGCCAUUGGAACUCAGGAGAGUACUGCUCAUUUGUUGGUUUCAGAUCCAAACCUAAUUCAUGUAUUAGUGAAAUUUCUUUCUGGCACCAGUCCACAUGGAACAAAUCAACACAGUCCACAGGUUGGUCCUACAGCUACACAAGCUAUGCAAGAAUUUCUUACUCGAUUACAAGUGCAUCUUUCUUCAACAUGUCCUCAGAUAUUCAGUGAAUUUUUGCUCAAGCUAAUUCAUAUACUUUCAACUGAAAGGGGUGCUUUCCAGACAGGCCAAGGACCUCUCGAUGCCCAAGUGAAGCUCUUAGAAUUCACUCUGGAGCAGAAUUUUGAAGUCGUUUCAGUUAGUACUAUUUCUGCCGUGAUAGAAUCGGUUACAUUUUUAGUGCACCACUAUAUCACUUGCUCAGACAAAGUAAUGUCAAGAAGUGGAUCAGAUAGCUCCGUGGGUGCUCGAGCAUGCUUUGGGGGACUCUUUGCCAAUCUUAUUCGUCCGGGUGAUGCAAAAGCAGUUUGUGGCGAAAUGACAAGAGAUCAACUCAUGUUUGAUUUGUUAAAACUUGUUAACAUUUUAGUGCAGCUGCCUCUUUCAGGCAAUAGGGAAUACAGUGCAAGAGUGUCUGUGACCACAAAUACAACAGAUAGUGUUUCAGAUGAAGAAAAAGUCUCAGGAGGCAAAGAUGGCAAUGGAAGCAGUACCAGUGUUCAAGGAUCGCCUGCAUAUGUUGCUGACUUAGUCUUAGCCAACCAACAAAUUAUGAGCCAGAUUUUGUCUGCUCUGGGCCUGUGUAAUAGCAGUGCCAUGGCAAUGAUAAUUGGAGCAAGUGGAUUACAUCUCACUAAACAUGAAAACUUUCAUGGUGGGUUGGAUGCCAUAUCAGUUGGGGAUGGAUUAUUUACCAUACUGACAACCCUUAGUAAAAAAGCUUCUACAGUCCACAUGAUGCUGCAGCCAAUUUUAACAUACAUGGCCUGUGGAUAUAUGGGCAGACAAGGCUCUCUUGCUACUUGCCAGUUAUCUGAGCCAUUAUUGUGGUUCAUUUUGAGAGUAUUGGAUACUAGUGAUGCCUUGAAAGCAUUUCAUGAUAUGGGUGGUGUUCAGCUCAUAUGCAAUAAUAUGGUUACUAGUACAAGGGCUAUUGUGAACACUGCAAGAAGUAUGGUAUCAACUAUUAUGAAAUUUCUUGACUCUGGUCCAAAUAAAGCUGUUGACAGCACAUUGAAAACAAGAAUACUAGCUUCUGAGCCUGACAAUGCUGAAGGGAUUCAUAACUUUGCACCCCUCGGUACAAUCACAUCUAGCAGUCCUACUGCCCAACCAGCUGAAGUGCUAUUGCAGGCCACACCUCCUCACAGAAGAGCUCGCUCUGCUGCUUGGUCCUACAUCUUUCUUCCAGAGGAGGCUUGGUGUGACCUUACCAUUCACCUUCCUGCAGCAGUGCUGCUUAAGGAGAUACAUAUCCAGCCUCAUCUUGCAUCUCUUGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-681 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -727.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 635.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((......((((((((...(((.(((...((..((.(((((((.....((((((.(((.((.(((((..((((((((.......((((.((((((((.((....(((((((((..(((((..........((((..(((((.(((((.......((((((((...(((.(((.((((((........))))))....)))...)))...((..((((((.((((........))))))))))..))...(((...(.((..((((...(((((((.(((.((((......(((((((...((((...))))..)))))))......)))).)))(((((.((((............)))).)))))(((((...(((((.((..(((..((((....(..(((((.(((((....((.....))...)))))...)))))..)...))))..))).))........(((((((((..((((.(.((((..(((((......((((((((....(((((.....)))))......))))))))......))))).....................((.(((.(((((((((..(((.((.((.(((((..............)))))..))))..........))).))))))))).))).))......((((((....))))))..)))).).)))))))))))))(((.(((((((..(((((((..........)))))))..))))))).))).(((((((...)))))))...........((((((((............(((((.(((((((...)))))))...))))).(((((((.....((((..(((.......))))))))))))))..........))))))))((((.((((((((((.(((....))).))).......((((((...((((.....((((((((((((........))))))).))))).....))))...))))))(((((.......)))))...(((((......)))))..........)))))))))))....(((..............))))))))....))))).((((.....)))).)))))))...))))..)).)...)))))))))))........)))))..)))))..))))(((((((...((....)).)))))))...(((((....)))))((((.(((.((.....))..))).)))).((((((.(((((((((..........)))))).))).((((((..(((((.....)))))..........)))))).((((((.....((((((.......))).)))....)))))).......((((......))))......(((((((((...(((((.(.((((....)))).)..)))))(..(((((((((.((((.((((.(((.(...(((....)))...).)))))))..((((.(((.....))).))))(((..((((((......))))))..))).......((((((((..((((..............((.((.(.(((((((.............))))))).).)).))............)))).)))))))))))))))))).)))..).....(((((((((..(((.(((((((((((..(((((..........((((.((..((.(((((((((((((..........)))))(((((((((...((((.((((((........((((((((((.(((((((.(((((.(((...((((((....))))))...))).))))).....(((((..((.............))..)))))........(((......))).....)))))))....))))....))))))........))))))))))...)))))))))...((((((..((..((((.(..(((((..((((((((((....)))))))......)))..)))))..).)))))).)))))).......)))))))).))))))))..))))).)))))))......................)))).))).)))))))))((((((((.(.(((........))).).))))))))..)))))))))......((((....)))).))))))...........)))))..))))).))))...)).)))))))).))))....(((.(((....))).))).........(((((...)))))...))))))))..)))))....((.((((..(((((((.(((.((((....)))).)))..(((...............))))))))))..)))).)))).))).))))))))))))).))))..))).)))...))))........)))).....))(((((.....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((......((((((((...(((.(((...((..((.(((((((...,(((({({,.,..{{,(((((..((((((((,......((((.((((((((.((....(((((((((..(((((...,,,,,,.{((.,,({{(({((.,({,{....{(({{{{|,}..|,}}||.((((({.....,,,}}}}}}....{((({{(,({,.{{..((((((.((((........))))))))))..}}....,,,,|{{{..,(({,...||||,,|,}}}}}}|}......(((((((.,,((((...))))..))))))){((((((.{|.{.((((({.((((............)))).}))))),|{,.,{((({,((((.,((..{,((({..(({((((,.,,,,,{{{{,,.....|,..,|||||,.{|||||..{{{{{{{|{.||.{||{{....,.(((((((((..{(((.{.,{{,..(((((......((((((((....(((((.....)))))......))))))))......)))))..............,,,..,,{,|(((,({{(({{{{,,,,|,||,||}|{{{,..,,,,.|,...,....,,.}}..}}},.......}}}.}}})))))).}}}.}}..,,{.((((({....)))))).,))},.}.))))))))))))){{{.{{{(((({{((({{{{..,,,,,,,,)}|||||..}}))))),}}}.(((((((...)))))))...........((((((((.,{{,....,,.{{{((.(((((((...)))))))...)))}}.,,{((((.....,.,{,.|||.......})))})}))}}))),,.,......))))))))((((.(((((((.{(.(((....)))..,,.......((((((...((((.....((((((((((((........))))))).)))))..,..))))...))))))(((({.......))))}...(((((......))))}..........)))))))))))...{(({.{...........})))}..||{{|,,....}||||.....||||..({({{{{{{|,||{{{.{{,....{|,||||.|,.......,)))).,)..},,}})})|||||||}}}||...,))},,,,,,,...(({{{..,,}}}))||}|}|,,}|}}}...))}},})})),}},,||{{{(((((((((.,{,..,|,.)))))).))).))|,,,..,||||},},})})}}},.|||{{,.||||{{,({{{{{.....|||,|{.....,|))),}})..,.},}|||{{,{{..((((......)))).}}}}}}|||||,{,...|||||}|.,|}|}.,.)).)})}.}}))),,,|{{{((((,,((((.((((.(((.(...(((....)))...).))))))).,((((,(((,.,,,|}}.})}}|||.,|{{{{,..,,,,)))}}}..}}},,,....((((((((..((((....,{,..,{{{{{({{,.,.|||||||,.,,....,,,,.}}}}}},,)}))||....,........)))).)))))))))))))))))).))}.,)}}}}}|{||||{{||,|{|,{{{((((((((..(((((,.........((({,((,.,,.((((((({(((((........}.)))))(((((((((...((((.((((((........((((((((((.(((((({.(((((.(((...((((((....))))))...))).))))).....{(((({{(,,{{{......,..))}.})))}........{{{,.....,,,..,..}))))))....))))....))))))........))))))))))...)))))))))...((((((..,,..((((.{..(((((..((((((((((....)))))))}.....}))..)))))..}.)))))).)))))).......}))))))).)))})))),.))))).)))))))}....,,||}},....,,.,,,,})),}}}.}}}}}}}}|((((((((.(.(((........))).).)))))))).,}}))))))}......{{{{,,,.))))...,||....,,,.....)))))..)))))},)))...)).)))))))).))))....(((.(((....))).))).........(((((...))))).,.))))))))..)))))...,|(.((((..(((((((.{{(.((((....}})}.)})..{{{.....,.....,}}})},)))))))..}))),)).,.,}})))}}..))))))).))))..))).)))...))))........))))..},.))(((((.....)))))
Back