Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0078100

Sequence Length

1063 nt

GC Content

0.4149

UUGGAGUCACUUCUCCAAUUGUGGCUCACACUGAGCCUGAAUUCUAGUUCAACUGGAAACAAAGAAAAUGGAGCAGACAUAUUUUUAUAUAAUGCUAAUAGGAUACCUGUUAUUUCAUUAAAUCAAGCAUCAAUAACUAGCUUUCUCACAGUGUUAGCUUGGUAUCCCAAUACUUUGCUCCGGACAUGGUGCCUUGUGCUUCAUAGCCUAACACUCAUGACAAACAUGCAGCUUAAUUCUGGUUCCAGCAGUGCCAUUGGAACUCAGGAGAGUACUGCUCAUUUGUUGGUUUCAGAUCCAAACCUAAUUCAUGUAUUAGUGAAAUUUCUUUCUGGCACCAGUCCACAUGGAACAAAUCAACACAGUCCACAGGUUGGUCCUACAGCUACACAAGCUAUGCAAGAAUUUCUUACUCGAUUACAAGUGCAUCUUUCUUCAACAUGUCCUCAGAUAUUCAGUGAAUUUUUGCUCAAGCUAAUUCAUAUACUUUCAACUGAAAGGGGUGCUUUCCAGACAGGCCAAGGACCUCUCGAUGCCCAAGUGAAGCUCUUAGAAUUCACUCUGGAGCAGAAUUUUGAAGUCGUUUCAGUUAGUACUAUUUCUGCCGUGAUAGAAUCGGUUACAUUUUUAGUGCACCACUAUAUCACUUGCUCAGACAAAGUAAUGUCAAGAAGUGGAUCAGAUAGCUCCGUGGGUGCUCGAGCAUGCUUUGGGGGACUCUUUGCCAAUCUUAUUCGUCCGGGUGAUGCAAAAGCAGUUUGUGGCGAAAUGACAAGAGAUCAACUCAUGUUUGAUUUGUUAAAACUUGUUAACAUUUUAGUGCAGCUGCCUCUUUCAGGCAAUAGGGAAUACAGUGCAAGAGUGUCUGUGACCACAAAUACAACAGAUAGUGUUUCAGAUGAAGAAAAAGUCUCAGGAGGCAAAGAUGGCAAUGGAAGCAGUACCAGUGUUCAAGGAUCGCCUGCAUAUGUUGCUGACUUAGUCUUAGCCAACCAACAAAUUAUGAGCCAGAUUUUGUCUGCUCUGGGCCUGUGUAAUAGCAGUGCCAUGGCAAUGAUAAUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-282.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -301.16

Frequency: 0.0000

Diversity: 297.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((......))))).....((((((...))))))....(((((((...)))))))...........((((((((............(((((.(((((((...)))))))...))))).(((((((.....((((..(((.......))))))))))))))..........))))))))((((.((((((((((.(((....))).))).......((((((...((((.....((((((((((((........))))))).))))).....))))...))))))(((((.......)))))...(((((......)))))..........))))))))))).(((((.((......((((((((((..(((((((.....((((.....))))(((((......((......)).......))))).((((((((.(..(((..(((((((((.(((((((...((....)).)))))))........(((((((((((((.(((.((.....))..))).))))))((((..(.((((...(((((.(((......))))))))...)))).)..)))).))))))).((((((((((((((.(((.(((..(((((.(((...(((((...)))))...(((((.((..((((......)))).)))))))(((((((.((((((..(.((((....)))).)....)))).)).))))...)))...((((.(((.(...(((....)))...).)))))))..((((.(((.....))).))))(((..((((((......))))))..)))))).)))))..))).))))))....))))))..)))))..))))))))).)))...((((((........))))))..).)))))))).........(((((.(((..(((((((...((((.....(((.((...)).)))))))...)))))))..))).))))).)))))))..........((((.((((...)))))))))))).)))))).......)).))))))((((....))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((......))))).,,..((((({...})))))....(((((((...))))))}...........((((((((..{{,....,,.{{(((.(((((((...))))))}...}}}}}.,,{((((.....,,,{,.||,.......})))}))))}}))),,.,......))))))))((((.(((((((.{(.(((....)))..,,.......((((((...((((.....((((((((((((........))))))).)))))..,..))))...))))))(((({.......))))}...(((((......))))}..........))))))))))).(((((.{(......((((((((((,,(((((((,,,..((((.....}}}|{{(((,,,,,,{{......||......,}}|}|.(((({{{{...,(((..(((({{{{{.(((((({...{{....)).})))))}...,,,,,.,{{|||||((((,(({.((,....}},,|||,}}}}||(((({(((({({{,{(((,,.,{{.||||||||}||||,..,.,|{|{,|,,,,))))),,.{{{({{{{{{{{{{{(((,(,,..{((((,({,...,{|||.,})},,,,}}|||{{,|{..((((......)))).})}))))},}|,||.|}||||,,|}|||{}}}})}}}.),,}))}},.,}}}|||||..|||,.((((.(((.(...(((....)))...).))))))).,{(((,(((,,,,,|}}.}))}|||,,|{{{{{......)))})}..,,}}}}.}))|||||}},}}))||,...,|}},}.,,})))..))))))))),)})...{{((((........)))))}..,.}))))}},..,,,,..,|||||.|||,||||{{{|,,.{{{|,,,,.|||,{{.,})),))))))}...}|}})}}|.}}}.))))),)))))))..........((({,((((...)))))))))))),}))))).......)}.))))))((((....))))