Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0078300
Sequence Length
1732 nt
GC Content
0.4221
UUGGAGUCACUUCUCCAAUUGUGGCUCACACUGAGCCUGAAUUCUAGUUCAACUGGAAACAAAGAAAAUGGAGCAGACAUAUUUUUAUAUAAUGCUAAUAGGAUACCUGUUAUUUCAUUAAAUCAAGCAUCAAUAACUAGCUUUCUCACAGUGUUAGCUUGGUAUCCCAAUACUUUGCUCCGGACAUGGUGCCUUGUGCUUCAUAGCCUAACACUCAUGACAAACAUGCAGCUUAAUUCUGGUUCCAGCAGUGCCAUUGGAACUCAGGAGAGUACUGCUCAUUUGUUGGUUUCAGAUCCAAACCUAAUUCAUGUAUUAGUGAAAUUUCUUUCUGGCACCAGUCCACAUGGAACAAAUCAACACAGUCCACAGGUUGGUCCUACAGCUACACAAGCUAUGCAAGAAUUUCUUACUCGAUUACAAGUGCAUCUUUCUUCAACAUGUCCUCAGAUAUUCAGUGAAUUUUUGCUCAAGCUAAUUCAUAUACUUUCAACUGAAAGGGGUGCUUUCCAGACAGGCCAAGGACCUCUCGAUGCCCAAGUGAAGCUCUUAGAAUUCACUCUGGAGCAGAAUUUUGAAGUCGUUUCAGUUAGUACUAUUUCUGCCGUGAUAGAAUCGGUUACAUUUUUAGUGCACCACUAUAUCACUUGCUCAGACAAAGUAAUGUCAAGAAGUGGAUCAGAUAGCUCCGUGGGUGCUCGAGCAUGCUUUGGGGGACUCUUUGCCAAUCUUAUUCGUCCGGGUGAUGCAAAAGCAGUUUGUGGCGAAAUGACAAGAGAUCAACUCAUGUUUGAUUUGUUAAAACUUGUUAACAUUUUAGUGCAGCUGCCUCUUUCAGGCAAUAGGGAAUACAGUGCAAGAGUGUCUGUGACCACAAAUACAACAGAUAGUGUUUCAGAUGAAGAAAAAGUCUCAGGAGGCAAAGAUGGCAAUGGAAGCAGUACCAGUGUUCAAGGAUCGCCUGCAUAUGUUGCUGACUUAGUCUUAGCCAACCAACAAAUUAUGAGCCAGAUUUUGUCUGCUCUGGGCCUGUGUAAUAGCAGUGCCAUGGCAAUGAUAAUUGGAGCAAGUGGAUUACAUCUCACUAAACAUGAAAACUUUCAUGGUGGGUUGGAUGCCAUAUCAGUUGGGGAUGGAUUAUUUACCAUACUGACAACCCUUAGUAAAAAAGCUUCUACAGUCCACAUGAUGCUGCAGCCAAUUUUAACAUACAUGGCCUGUGGAUAUAUGGGCAGACAAGGCUCUCUUGCUACUUGCCAGUUAUCUGAGCCAUUAUUGUGGUUCAUUUUGAGAGUAUUGGAUACUAGUGAUGCCUUGAAAGCAUUUCAUGAUAUGGGUGGUGUUCAGCUCAUAUGCAAUAAUAUGGUUACUAGUACAAGGGCUAUUGUGAACACUGCAAGAAGUAUGGUAUCAACUAUUAUGAAAUUUCUUGACUCUGGUCCAAAUAAAGCUGUUGACAGCACAUUGAAAACAAGAAUACUAGCUUCUGAGCCUGACAAUGCUGAAGGGAUUCAUAACUUUGCACCCCUCGGUACAAUCACAUCUAGCAGUCCUACUGCCCAACCAGCUGAAGUGCUAUUGCAGGCCACACCUCCUCACAGAAGAGCUCGCUCUGCUGCUUGGUCCUACAUCUUUCUUCCAGAGGAGGCUUGGUGUGACCUUACCAUUCACCUUCCUGCAGCAGUGCUGCUUAAGGAGAUACAUAUCCAGCCUCAUCUUGCAUCUCUUGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-486.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -518.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 373.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((......))))))(((.((((((...))))))....(((((((...)))))))...........((((((((............(((((.(((((((...)))))))...))))).(((((((.....((((..(((.......))))))))))))))..........))))))))((((.((((((((((.(((....))).))).......((((((...((((.....((((((((((((........))))))).))))).....))))...))))))(((((.......)))))...(((((......)))))..........)))))))))))...((((..............))))..(((((......)))))...((((..((((((((......((((........))))....((((((((.(..(((..(((((((((.(((((((...((....)).)))))))........(((((((((((((.(((.((.....))..))).))))))((((..(.((((...(((((.(((......))))))))...)))).)..)))).))))))).((((((((((((((.(((.(((..(((((.(((...(((((...)))))...(((((.((..((((......)))).)))))))(((((((.((((((..(.((((....)))).)....)))).)).))))...)))...((((.(((.(...(((....)))...).)))))))..((((.(((.....))).))))(((..((((((......))))))..)))))).)))))..))).))))))....))))))..)))))..))))))))).)))...((((((........))))))..).))))))))....(((.(((((.(((((((.......(((((((....(((....(((...(((((((...((((((((.......)))).))))...........((((.((((...))))))))...(((((((((...((((.((((((........((((((((((.(((((((.(((((.(((...((((((....))))))...))).))))).....(((((..((.............))..)))))........(((......))).....)))))))....))))....))))))........))))))))))...)))))))))...((((((..((..((((.(..(((((..((((((((((....)))))))......)))..)))))..).)))))).))))))..(((((((((.....(((.(((.((((((.((((((......))))))...((((((...((((((..((........((((((((.(.(((........))).).))))))))))..)))))).......((((....))))................))))))...)))))).(((...((((((.(((...((......))...)))))))))...)))......(((((...)))))))).)))..)))))))))..)))))))....)))...)))...((((....))))))))))).......)))))))))))).)))((((((.((((((..........((.((((...(((((...)))))..)))).))..)))))).)))))).))))))))..)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((......))))))(((.((((({...})))))....(((((((...)))))))...........((((((((..{{,....,,.{{(((.(((((((...))))))}...}}}}}.,,{((((.....,,,{,.||,.......})))}))))}}))),,.,......))))))))((((.(((((((.{(.(((....)))..,,.......((((((...((((.....((((((((((((........))))))).)))))..,..))))...))))))(((({.......))))}...(((((......))))}..........)))))))))))...((({.{...........}))))..(((((......)))))...((((..((((((((......{(((.,......)))}....((((((((.,..(((..(((((((((.(((((((...((....)).)))))))........,{(((((((((((.(({.((.....))..|}}.}))}||(((({{({((((,,,((({..{{{.,,|||)|}))|)),..},,},|,.}}},,)))))}}.((((((((((((((,(((.({{..{((((.({{...{{|||.,,)}}}},,|||{{{,{{..((((......)))).}}}))))|,,,{{{.,|{|{{|.|,|||{,,,,))}}.)..}})))}.,}})}}}}}..}},..((((.(((.{...(((....)))...).))))))).,{(((,(((,,,,,|}}.})))|||,,|(((({......)))))}..,,}))).)))}),,))),))))}}|...,}}}}}..,))))..))))))))).)))...((((((........))))))..}.))))))))....(((.(((((.(((((((,,...((((((((((.(((((((({,.(({.(((((((((((..(((((,.........((({,((..,,.{((((((((((((,....,,,}.)))))(((((((((...((((.((((((........((((((((((.(((((((.(((((.(((...((((((....))))))...))).))))).....{(((({{(,,{{{,.....,..))}.})))}........|{{,.....,,,..,..)))))))....))))....))))))........))))))))))...)))))))))...((((((..,,..((((.{..(((((..((((((((((....)))))))}.....}))..)))))..}.)))))).)))))).......|))))))}.}})}))))|.})))).))))))),....,,,,,,..,........}))).))).)))))))))((((((((.(.(((........))).).))))))))..{{{,{|.,.,.....((((....))))...,},...,}.}}}.}))).)}}))}|.|||(({,,.((((({.(((.,.((......)).,,))}))))))...}},......(((((...)))))|||,.|{{{.|,,||||}.,}})|||}.....,,,|,..|,|.,|||,...)))})))),)}}}.....)))))))))))).)))((((((.((((((..........{{.((((...(((((...)))))..}))).)}..)))))).)))))).))))))))..)))))))
Back