Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0078500
Sequence Length
2269 nt
GC Content
0.4279
UUGGAGUCACUUCUCCAAUUGUGGCUCACACUGAGCCUGAAUUCUAGUUCAACUGGAAACAAAGAAAAUGGAGCAGACAUAUUUUUAUAUAAUGCUAAUAGGAUACCUGUUAUUUCAUUAAAUCAAGCAUCAAUAACUAGCUUUCUCACAGUGUUAGCUUGGUAUCCCAAUACUUUGCUCCGGACAUGGUGCCUUGUGCUUCAUAGCCUAACACUCAUGACAAACAUGCAGCUUAAUUCUGGUUCCAGCAGUGCCAUUGGAACUCAGGAGAGUACUGCUCAUUUGUUGGUUUCAGAUCCAAACCUAAUUCAUGUAUUAGUGAAAUUUCUUUCUGGCACCAGUCCACAUGGAACAAAUCAACACAGUCCACAGGUUGGUCCUACAGCUACACAAGCUAUGCAAGAAUUUCUUACUCGAUUACAAGUGCAUCUUUCUUCAACAUGUCCUCAGAUAUUCAGUGAAUUUUUGCUCAAGCUAAUUCAUAUACUUUCAACUGAAAGGGGUGCUUUCCAGACAGGCCAAGGACCUCUCGAUGCCCAAGUGAAGCUCUUAGAAUUCACUCUGGAGCAGAAUUUUGAAGUCGUUUCAGUUAGUACUAUUUCUGCCGUGAUAGAAUCGGUUACAUUUUUAGUGCACCACUAUAUCACUUGCUCAGACAAAGUAAUGUCAAGAAGUGGAUCAGAUAGCUCCGUGGGUGCUCGAGCAUGCUUUGGGGGACUCUUUGCCAAUCUUAUUCGUCCGGGUGAUGCAAAAGCAGUUUGUGGCGAAAUGACAAGAGAUCAACUCAUGUUUGAUUUGUUAAAACUUGUUAACAUUUUAGUGCAGCUGCCUCUUUCAGGCAAUAGGGAAUACAGUGCAAGAGUGUCUGUGACCACAAAUACAACAGAUAGUGUUUCAGAUGAAGAAAAAGUCUCAGGAGGCAAAGAUGGCAAUGGAAGCAGUACCAGUGUUCAAGGAUCGCCUGCAUAUGUUGCUGACUUAGUCUUAGCCAACCAACAAAUUAUGAGCCAGAUUUUGUCUGCUCUGGGCCUGUGUAAUAGCAGUGCCAUGGCAAUGAUAAUUGGAGCAAGUGGAUUACAUCUCACUAAACAUGAAAACUUUCAUGGUGGGUUGGAUGCCAUAUCAGUUGGGGAUGGAUUAUUUACCAUACUGACAACCCUUAGUAAAAAAGCUUCUACAGUCCACAUGAUGCUGCAGCCAAUUUUAACAUACAUGGCCUGUGGAUAUAUGGGCAGACAAGGCUCUCUUGCUACUUGCCAGUUAUCUGAGCCAUUAUUGUGGUUCAUUUUGAGAGUAUUGGAUACUAGUGAUGCCUUGAAAGCAUUUCAUGAUAUGGGUGGUGUUCAGCUCAUAUGCAAUAAUAUGGUUACUAGUACAAGGGCUAUUGUGAACACUGCAAGAAGUAUGGUAUCAACUAUUAUGAAAUUUCUUGACUCUGGUCCAAAUAAAGCUGUUGACAGCACAUUGAAAACAAGAAUACUAGCUUCUGAGCCUGACAAUGCUGAAGGGAUUCAUAACUUUGCACCCCUCGGUACAAUCACAUCUAGCAGUCCUACUGCCCAACCAGCUGAAGUGCUAUUGCAGGCCACACCUCCUCACAGAAGAGCUCGCUCUGCUGCUUGGUCCUACAUCUUUCUUCCAGAGGAGGCUUGGUGUGACCUUACCAUUCACCUUCCUGCAGCAGUGCUGCUUAAGGAGAUACAUAUCCAGCCUCAUCUUGCAUCUCUUGCAACCUGCCCUUCCUCAGUGUCUGUUGAAGUAAGUGCAGAUGGGGUAAAUAUGCUACCUUUGUCCACUCCUGUUGUCACAAGUGGCCUCACCUACAUAAAAAUUCAGCUUGUAAAAGCCGAAGUAGCUUCUGCUGUCUGCCUUAGACUACAUCGUCCACGGGAUGCCAGCACAUUAGGCCUUUCACAAAUUAAAUUAUUGGGGCUCACUGCUUUUGGUACCACCUCUUCUGCAACAGUUAAUAAUCCAUUCCUUCCAUCUGAAGAUCAGGUAUCCAAAACAAGUAUUGGAUGGUUACGGUUAUUACAUCAUUGCCUUACUCACAUAAGUGAUCUAGAAGGAAUGAUGGCAAGUGCAGCUGCACCUACUGCUAAUCUGCUGCAGACUUGUGCGGCCUUAUUGAUGUCACCUUACUGUGGAAUGCAUUCACCCAACAUCGAGGUUGUGCUUGUAAAGAUAGGACUGCAGUCUACUAGAAUUGGCCUGAAGCUCAUAGACAUUCUCCUGAGAAAUUGUGCAGCAUCAGGCAGUGAUCCUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-648.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -691.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 481.34
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((......))))))((((((((((...))))))..(((((((((...((((..............((((((((............(((((.(((((((...)))))))...))))).(((((((.....((((..(((.......))))))))))))))..........))))))))((((.((((((((((.(((....))).))).......((((((...((((.....((((((((((((........))))))).))))).....))))...))))))(((((.......)))))...(((((......)))))..........)))))))))))..................((((((...(((((......)))))......((...))((((...))))..((..(((((((((((............(((((....)))))...(((((((...((....)).)))))))...(((((....)))))((((.(((.((.....))..))).))))(((((((((((((..(.((((...((...(((((((((((......(((((.....)))))......((((((((((.((((((.....((((((.......))).)))....))))))..))...((((......)))).))))))))........)))))).))))).)))))).)..))))))((((..................))))((((((((((...(((((..(((((.....((((.(((.....))).))))(((..((((((......))))))..)))((((((((((((((((((((((...(((((..((((((((((.(((((((.............))))))).).....(((((((((......(((.(((((.(((((((.......(((((((....(((....(((...(((((((...((((((((.......)))).))))...........((((.((((...))))))))...(((((((((...((((.((((((........((((((((((.(((((((.(((((.(((...((((((....))))))...))).))))).....(((((..((.............))..)))))........(((......))).....)))))))....))))....))))))........))))))))))...)))))))))...((((((..((..((((.(..(((((..((((((((((....)))))))......)))..)))))..).)))))).))))))..(((((((((.....(((.(((.((((((.((((((......))))))...((((((...((((((..((........((((((((.(.(((........))).).))))))))))..)))))).......((((....))))................))))))...)))))).(((...((((((.(((...((......))...)))))))))...)))......(((((...)))))))).)))..)))))))))..)))))))....)))...)))...((((....))))))))))).......)))))))))))).)))((((((.((((((..........((.((((...(((((...)))))..)))).))..)))))).)))))).)))).)))))))))))..)))...)))))...))))))..))))....((((((.(((((...((((.((.....(.(((((..((....))..))))).).....))))))........((((....))))(((.((((((...((.....))...)).)))).)))......((.((((((((.....((((((.................))))))...)))...)))))))))))).)))))).....((((((((....((....((((((...))))))((((((........))))))))....))))))))(((((((.((((..((((....)))).....)))))))))))...)).)))))))))).............((((((......)))))).........)))))...)))))....)))).))))))..)))))))..))))))))))).))..))))))))))..))))))))).((((((.((((((((...((((....)))).))))).))).)))))).........))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((......))))))((((((,((({..,}||||,,,,(((((((...||||}},...........((((((((..{{,....,,.{{(((.(((((((...))))))}...}}}}}.,,{((((.....,,,{,.||,.......})))}))))}}))),,.,......))))))))((((.(((((((.{(.(((....)))..,,.......((((((...((((.....((((((((((((........))))))).)))))..,..))))...))))))(((({.......))))}...(((((......))))}..........)))))))))))...{((,.,.........,,||||,,}||||({{{{{,,{(((.....}}}}..{.((({...}}}}.,{{..(((((((((((.,..........(((((....)))))...(((((((...((....)).)))))))...(((((....)))))((((.(((.((.....))..))).))))((((((((((((({...((((...({...(((((((((((......{((((,...,}))}}...{{{(((,{{{{((,(({{{{.....|||,{{.....,}))).}})....}}}|||,,}|...((({......)))).}))))))).,,,,,..)))))).))))).)})))).}})))))))((((..................))))((((((((((...(((((..((((({.,,{((((.(((,,,,,|}}.}))}|||,,|(((({......))))))..}}}((((((((((((((({((((((...(((((..((((((((((((((((((.............))))))},|,|,.,{{{{{{{{,......(((.(((((.(((((((,,...((((((((((.(((((((({,.(((.(((((((((((..(((((,.........((({,((..,,.{((((((((((((.....,,,}.)))))(((((((((...((((.((((((........((((((((((.(((((((.(((((.(((...((((((....))))))...))).))))).....{(((({{(,,{{{,.....,..))}.})))}........|{{,.....,,,..,..}))))))....))))....))))))........))))))))))...)))))))))...((((((..,,..((((.{..(((((..((((((((((....)))))))}.....}))..)))))..}.)))))).)))))).......|))))))).}})}))))|.})))).))))))),....,.,,,,..,........}))).))).)))))))))((((((((.(.(((........))).).))))))))..{{{,{{...,.....((((....))))...,},...,}.}}}.}))).)))))}|.|||(({,,.((((({.(((.,.((......)).,,))}))))))...}},......(((((...)))))|||,.|{{{.||,|||||.,|}}|||}.....,,,|,..|,|.,{||,...}))})))),)}}}.....)))))))))))).)))((((((.((((((..........{{.{(((...(((((...)))))..}))),)}..)))))).)))))).})},,))}))))))))..)))...)))))...))))))..})))...,((((((.(((((...,,,(,{{,...,(.(((((..((....))..))))),,.......,,,.....,{(.((((....)))).))}||{{|...,||,{{{{|,..,))})..}..||,,...,{{.((((((((.....((((({.................))))))...))),..}))))})))))).)))))}.,...((((((((....((.,,.((((({...}))))}{(((((........)))))}))....))))))))(((((((.((((..((((....)))).....)))))))))))...)).)))))))))).............((((((......))))))..,}}}..})))))...)))))....)))),})))))..)))))))}.))))))))))).),}}))))),||||,.,,,))}))),((((((.((((((((...(((,...,))}}.))))).))).)))))).}}},.,}.))))
Back