Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0080400
Sequence Length
1494 nt
GC Content
0.4284
CUGGUUCCAGCAGUGCCAUUGGAACUCAGGAGAGUACUGCUCAUUUGUUGGUUUCAGAUCCAAACCUAAUUCAUGUAUUAGUGAAAUUUCUUUCUGGCACCAGUCCACAUGGAACAAAUCAACACAGUCCACAGGUUGGUCCUACAGCUACACAAGCUAUGCAAGAAUUUCUUACUCGAUUACAAGUGCAUCUUUCUUCAACAUGUCCUCAGAUAUUCAGUGAAUUUUUGCUCAAGCUAAUUCAUAUACUUUCAACUGAAAGGGGUGCUUUCCAGACAGGCCAAGGACCUCUCGAUGCCCAAGUGAAGCUCUUAGAAUUCACUCUGGAGCAGAAUUUUGAAGUCGUUUCAGUUAGUACUAUUUCUGCCGUGAUAGAAUCGGUUACAUUUUUAGUGCACCACUAUAUCACUUGCUCAGACAAAGUAAUGUCAAGAAGUGGAUCAGAUAGCUCCGUGGGUGCUCGAGCAUGCUUUGGGGGACUCUUUGCCAAUCUUAUUCGUCCGGGUGAUGCAAAAGCAGUUUGUGGCGAAAUGACAAGAGAUCAACUCAUGUUUGAUUUGUUAAAACUUGUUAACAUUUUAGUGCAGCUGCCUCUUUCAGGCAAUAGGGAAUACAGUGCAAGAGUGUCUGUGACCACAAAUACAACAGAUAGUGUUUCAGAUGAAGAAAAAGUCUCAGGAGGCAAAGAUGGCAAUGGAAGCAGUACCAGUGUUCAAGGAUCGCCUGCAUAUGUUGCUGACUUAGUCUUAGCCAACCAACAAAUUAUGAGCCAGAUUUUGUCUGCUCUGGGCCUGUGUAAUAGCAGUGCCAUGGCAAUGAUAAUUGGAGCAAGUGGAUUACAUCUCACUAAACAUGAAAACUUUCAUGGUGGGUUGGAUGCCAUAUCAGUUGGGGAUGGAUUAUUUACCAUACUGACAACCCUUAGUAAAAAAGCUUCUACAGUCCACAUGAUGCUGCAGCCAAUUUUAACAUACAUGGCCUGUGGAUAUAUGGGCAGACAAGGCUCUCUUGCUACUUGCCAGUUAUCUGAGCCAUUAUUGUGGUUCAUUUUGAGAGUAUUGGAUACUAGUGAUGCCUUGAAAGCAUUUCAUGAUAUGGGUGGUGUUCAGCUCAUAUGCAAUAAUAUGGUUACUAGUACAAGGGCUAUUGUGAACACUGCAAGAAGUAUGGUAUCAACUAUUAUGAAAUUUCUUGACUCUGGUCCAAAUAAAGCUGUUGACAGCACAUUGAAAACAAGAAUACUAGCUUCUGAGCCUGACAAUGCUGAAGGGAUUCAUAACUUUGCACCCCUCGGUACAAUCACAUCUAGCAGUCCUACUGCCCAACCAGCUGAAGUGCUAUUGCAGGCCACACCUCCUCACAGAAGAGCUCGCUCUGCUGCUUGGUCCUACAUCUUUCUUCCAGAGGAGGCUUGGUGUGACCUUACCAUUCACCUUCCUGCAGCAGUGCUGCUUAAGGAGAUACAUAUCCAGCCUCAUCUUGCAUCUCUUGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-408.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -438.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 431.91
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((.(((.....)))..).)))))))).....((((((...((((((...(((((..(((((................((.((((((......((((((....(((......((((((.(((((......))))).....((((..((((((((...(((((.(((....((.((((...........)))).)).....))).)))))))))))))...))))........((((...(((((((((((((.(((.((.....))..))).))))))((((..(.((((...(((((.(((......))))))))...)))).)..)))).)))))))))))........((.((((((.....((((((.......))).)))....))))))..))...((((......)))).....))))))..)))...)))))))))))).)))))))..)))))))).)))..))))))....((((.(((.(...(((....)))...).)))))))..((((.(((.....))).))))(((..((((((......))))))..))).......(((((.....)))))....))))).)))(((((((.(((((((.............))))))).).....(((((((((......(((.(((((.(((((((.......(((((((....(((....(((...(((((((...((((((((.......)))).))))...........((((.((((...))))))))...(((((((((...((((.((((((........((((((((((.(((((((.(((((.(((...((((((....))))))...))).))))).....(((((..((.............))..)))))........(((......))).....)))))))....))))....))))))........))))))))))...)))))))))...((((((..((..((((.(..(((((..((((((((((....)))))))......)))..)))))..).)))))).))))))..(((((((((.....(((.(((.((((((.((((((......))))))...((((((...((((((..((........((((((((.(.(((........))).).))))))))))..)))))).......((((....))))................))))))...)))))).(((...((((((.(((...((......))...)))))))))...)))......(((((...)))))))).)))..)))))))))..)))))))....)))...)))...((((....))))))))))).......)))))))))))).)))((((((.((((((..........((.((((...(((((...)))))..)))).))..)))))).)))))).)))).)))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((({.((({....)))..}.)))))))).....{(((((.,,{{,,||,..,{{{{{,{{{..,,,,),|||.....,,}}|((,{|||{,((...{{{{.{...........,}}}}..|||||,,.,..}||||.....{(||..((((((({,,..{(((.({.....|{,|{{{.,{.....,..}}||,}}..|,}}}},}||||||}}}}||...,))},,,,,,,...{{,,,..{{|||||((((.(({.{(.....)},.|||,}}}}|{(((({(((({({{,{(((,,..{,.||||||{|||{||,,.,..|{{{{|,..,))))},,.{{|{{{,||||{{,((((((.....((({{(,.....,))).}))....}))))),,}|,..((((......)))).})}}))))}},.|}.,)})})}}))))},)})))}}},},}))))))},)}}.,)))}.},,..((((.(((.(...(((....)))...).))))))).,|{{{.({(,,|,,)}}.})}}|||.,{(((({......))))))..}}}},}.}}}|||||,,,,,))))}....))))).)))((((((({(((((({,............}}}}}}}|}||,..{{{{|||||......(((.(((((.(((((((,,...((((((((((.(((((((({,.(((.(((((((((((..(((((,.........((({,((..,,.{((((((((((((,....,,,}.)))))(((((((((...((((.((((((........((((((((((.(((((((.(((((.(((...((((((....))))))...))).))))).....{(((({{(,,{{{,.....,..))}.})))}........|{{,.....,,,..,..)))))))....))))....))))))........))))))))))...)))))))))...((((((..,,..((((.{..(((((..((((((((((....)))))))}.....}))..)))))..}.)))))).)))))).......|))))))}.}})}))))|.})))).))))))),....,,,,,,..,........}))).))).)))))))))((((((((.(.(((........))).).))))))))..{{{,{|.,.,.....((((....))))...,},...,}.}}}.}))).)})))}|.|||(({,,.((((({.(((.,.((......)).,,))}))))))...}},......(((((...)))))|||,.|{{{.|,,||||}.,}})}||}.....,,,|,..|,|.,|||,...)))})))),)}}}.....)))))))))))).)))((((((.((((((..........{{.((((...(((((...)))))..}))),)}..)))))).)))))).))),,))}))))))),,
Back