Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0080500
Sequence Length
2031 nt
GC Content
0.4333
CUGGUUCCAGCAGUGCCAUUGGAACUCAGGAGAGUACUGCUCAUUUGUUGGUUUCAGAUCCAAACCUAAUUCAUGUAUUAGUGAAAUUUCUUUCUGGCACCAGUCCACAUGGAACAAAUCAACACAGUCCACAGGUUGGUCCUACAGCUACACAAGCUAUGCAAGAAUUUCUUACUCGAUUACAAGUGCAUCUUUCUUCAACAUGUCCUCAGAUAUUCAGUGAAUUUUUGCUCAAGCUAAUUCAUAUACUUUCAACUGAAAGGGGUGCUUUCCAGACAGGCCAAGGACCUCUCGAUGCCCAAGUGAAGCUCUUAGAAUUCACUCUGGAGCAGAAUUUUGAAGUCGUUUCAGUUAGUACUAUUUCUGCCGUGAUAGAAUCGGUUACAUUUUUAGUGCACCACUAUAUCACUUGCUCAGACAAAGUAAUGUCAAGAAGUGGAUCAGAUAGCUCCGUGGGUGCUCGAGCAUGCUUUGGGGGACUCUUUGCCAAUCUUAUUCGUCCGGGUGAUGCAAAAGCAGUUUGUGGCGAAAUGACAAGAGAUCAACUCAUGUUUGAUUUGUUAAAACUUGUUAACAUUUUAGUGCAGCUGCCUCUUUCAGGCAAUAGGGAAUACAGUGCAAGAGUGUCUGUGACCACAAAUACAACAGAUAGUGUUUCAGAUGAAGAAAAAGUCUCAGGAGGCAAAGAUGGCAAUGGAAGCAGUACCAGUGUUCAAGGAUCGCCUGCAUAUGUUGCUGACUUAGUCUUAGCCAACCAACAAAUUAUGAGCCAGAUUUUGUCUGCUCUGGGCCUGUGUAAUAGCAGUGCCAUGGCAAUGAUAAUUGGAGCAAGUGGAUUACAUCUCACUAAACAUGAAAACUUUCAUGGUGGGUUGGAUGCCAUAUCAGUUGGGGAUGGAUUAUUUACCAUACUGACAACCCUUAGUAAAAAAGCUUCUACAGUCCACAUGAUGCUGCAGCCAAUUUUAACAUACAUGGCCUGUGGAUAUAUGGGCAGACAAGGCUCUCUUGCUACUUGCCAGUUAUCUGAGCCAUUAUUGUGGUUCAUUUUGAGAGUAUUGGAUACUAGUGAUGCCUUGAAAGCAUUUCAUGAUAUGGGUGGUGUUCAGCUCAUAUGCAAUAAUAUGGUUACUAGUACAAGGGCUAUUGUGAACACUGCAAGAAGUAUGGUAUCAACUAUUAUGAAAUUUCUUGACUCUGGUCCAAAUAAAGCUGUUGACAGCACAUUGAAAACAAGAAUACUAGCUUCUGAGCCUGACAAUGCUGAAGGGAUUCAUAACUUUGCACCCCUCGGUACAAUCACAUCUAGCAGUCCUACUGCCCAACCAGCUGAAGUGCUAUUGCAGGCCACACCUCCUCACAGAAGAGCUCGCUCUGCUGCUUGGUCCUACAUCUUUCUUCCAGAGGAGGCUUGGUGUGACCUUACCAUUCACCUUCCUGCAGCAGUGCUGCUUAAGGAGAUACAUAUCCAGCCUCAUCUUGCAUCUCUUGCAACCUGCCCUUCCUCAGUGUCUGUUGAAGUAAGUGCAGAUGGGGUAAAUAUGCUACCUUUGUCCACUCCUGUUGUCACAAGUGGCCUCACCUACAUAAAAAUUCAGCUUGUAAAAGCCGAAGUAGCUUCUGCUGUCUGCCUUAGACUACAUCGUCCACGGGAUGCCAGCACAUUAGGCCUUUCACAAAUUAAAUUAUUGGGGCUCACUGCUUUUGGUACCACCUCUUCUGCAACAGUUAAUAAUCCAUUCCUUCCAUCUGAAGAUCAGGUAUCCAAAACAAGUAUUGGAUGGUUACGGUUAUUACAUCAUUGCCUUACUCACAUAAGUGAUCUAGAAGGAAUGAUGGCAAGUGCAGCUGCACCUACUGCUAAUCUGCUGCAGACUUGUGCGGCCUUAUUGAUGUCACCUUACUGUGGAAUGCAUUCACCCAACAUCGAGGUUGUGCUUGUAAAGAUAGGACUGCAGUCUACUAGAAUUGGCCUGAAGCUCAUAGACAUUCUCCUGAGAAAUUGUGCAGCAUCAGGCAGUGAUCCUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-569.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -609.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 471.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....)))(.((((((.(((((((((((.((((...)))).))))..))))))).........(((((......))))).((((....))))))))))...(((....)))...........((((((...(((((......)))))......((...))((((...))))..((..(((((((((((............(((((....)))))...(((((((...((....)).)))))))...(((((....)))))((((.(((.((.....))..))).))))(((((((((((((..(.((((...((...(((((((((((......(((((.....)))))......((((((((((.((((((.....((((((.......))).)))....))))))..))...((((......)))).))))))))........)))))).))))).)))))).)..))))))((((..................))))((((((((((...(((((..(((((.....((((.(((.....))).))))(((..((((((......))))))..)))((((((((((((((((((((((...(((((..((((((((((.(((((((.............))))))).).....(((((((((......(((.(((((.(((((((.......(((((((....(((....(((...(((((((...((((((((.......)))).))))...........((((.((((...))))))))...(((((((((...((((.((((((........((((((((((.(((((((.(((((.(((...((((((....))))))...))).))))).....(((((..((.............))..)))))........(((......))).....)))))))....))))....))))))........))))))))))...)))))))))...((((((..((..((((.(..(((((..((((((((((....)))))))......)))..)))))..).)))))).))))))..(((((((((.....(((.(((.((((((.((((((......))))))...((((((...((((((..((........((((((((.(.(((........))).).))))))))))..)))))).......((((....))))................))))))...)))))).(((...((((((.(((...((......))...)))))))))...)))......(((((...)))))))).)))..)))))))))..)))))))....)))...)))...((((....))))))))))).......)))))))))))).)))((((((.((((((..........((.((((...(((((...)))))..)))).))..)))))).)))))).)))).)))))))))))..)))...)))))...))))))..))))....((((((.(((((...((((.((.....(.(((((..((....))..))))).).....))))))........((((....))))(((.((((((...((.....))...)).)))).)))......((.((((((((.....((((((.................))))))...)))...)))))))))))).)))))).....((((((((....((....((((((...))))))((((((........))))))))....))))))))(((((((.((((..((((....)))).....)))))))))))...)).)))))))))).............((((((......)))))).........)))))...)))))....)))).))))))..)))))))..))))))))))).))..))))))((((((...)).))))((((((.((((((((...((((....)))).))))).))).)))))).(((....))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({{,{{{{(,(((({.{(({{{{,|||{.{{||,,,)))}.,,}|,{{||||||,..,,,,..{{{{(,,,,..}}}})}|||......,}}})),))}}|{{{....|||.|.........((((((...(({{{..,,..}||||.....}||}..|,{(({...}}}}.,{{..(((((((((((.,..........{((((....)))))...(((((((...((....)).)))))))...(((((....)))))((((.(((.((.....))..))).))))((((((((((((({...((((...({...(((((((((((......{((({,...,)))}}...{{{(((,{{{{((,(({{{{.....|||,{{.....,}))).}})....}}}|||,,}|...((({......)))).}))))))).,,,,,..)))))).))))).)})))).}})))))))((((..................))))((((((((((...(((((..((((({.,,{((((.(((,,,,,|}}.}))}|||,,|(((({......))))))..}}}((((((((((((((({((((((...(((((..((((((((((((((((((.............))))))},|,|,.,{{{{{{{{,......(((.(((((.(((((((,,...((((((((((.(((((((({,.(((.(((((((((((..(((((,.........((({,((..,,.{((((((((((((.....,,,}.)))))(((((((((...((((.((((((........((((((((((.(((((((.(((((.(((...((((((....))))))...))).))))).....{(((({{(,,{{{,.....,..))}.})))}........|{{,.....,,,..,..}))))))....))))....))))))........))))))))))...)))))))))...((((((..,,..((((.{..(((((..((((((((((....)))))))}.....}))..)))))..}.)))))).)))))).......|))))))).}})}))))|.})))).))))))),....,.,,,,..,........}))).))).)))))))))((((((((.(.(((........))).).))))))))..{{{,{{...,.....((((....))))...,},...,}.}}}.}))).)))))}|.|||(({,,.((((({.(((.,.((......)).,,))}))))))...}},......(((((...)))))|||,.|{{{.||,|||||.,|}}|||}.....,,,|,..|,|.,{||,...}))})))),)}}}.....)))))))))))).)))((((((.((((((..........{{.{(((...(((((...)))))..}))),)}..)))))).)))))).})},,))}))))))))..)))...)))))...))))))..})))...,((((((.(((((...,,,(,{{,...,(.(((((..((....))..))))),,.......,,,.....,{(.((((....)))).))}||{{|...,||,{{{{|,..,))})..}..||,,...,{{.((((((((.....((((({.................))))))...))),..}))))})))))).)))))}.,...((((((((....((.,,.((((({...}))))}{(((({........)))))}))....))))))))(((((((.((((..((((....)))).....)))))))))))...)).)))))))))).............((((((......))))))..,}}}..})))))...)))))....)))),})))))..)))))))}.))))))))))).},..)))))){{|({{...}}.|}}}((((((.((((((((...(((,...,))},.))))).))).)))))).,||.,.,,,,.)
Back