Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0084000
Sequence Length
2889 nt
GC Content
0.4278
GAGCAAGUGGAUUACAUCUCACUAAACAUGAAAACUUUCAUGGUGGGUUGGAUGCCAUAUCAGUUGGGGAUGGAUUAUUUACCAUACUGACAACCCUUAGUAAAAAAGCUUCUACAGUCCACAUGAUGCUGCAGCCAAUUUUAACAUACAUGGCCUGUGGAUAUAUGGGCAGACAAGGCUCUCUUGCUACUUGCCAGUUAUCUGAGCCAUUAUUGUGGUUCAUUUUGAGAGUAUUGGAUACUAGUGAUGCCUUGAAAGCAUUUCAUGAUAUGGGUGGUGUUCAGCUCAUAUGCAAUAAUAUGGUUACUAGUACAAGGGCUAUUGUGAACACUGCAAGAAGUAUGGUAUCAACUAUUAUGAAAUUUCUUGACUCUGGUCCAAAUAAAGCUGUUGACAGCACAUUGAAAACAAGAAUACUAGCUUCUGAGCCUGACAAUGCUGAAGGGAUUCAUAACUUUGCACCCCUCGGUACAAUCACAUCUAGCAGUCCUACUGCCCAACCAGCUGAAGUGCUAUUGCAGGCCACACCUCCUCACAGAAGAGCUCGCUCUGCUGCUUGGUCCUACAUCUUUCUUCCAGAGGAGGCUUGGUGUGACCUUACCAUUCACCUUCCUGCAGCAGUGCUGCUUAAGGAGAUACAUAUCCAGCCUCAUCUUGCAUCUCUUGCAACCUGCCCUUCCUCAGUGUCUGUUGAAGUAAGUGCAGAUGGGGUAAAUAUGCUACCUUUGUCCACUCCUGUUGUCACAAGUGGCCUCACCUACAUAAAAAUUCAGCUUGUAAAAGCCGAAGUAGCUUCUGCUGUCUGCCUUAGACUACAUCGUCCACGGGAUGCCAGCACAUUAGGCCUUUCACAAAUUAAAUUAUUGGGGCUCACUGCUUUUGGUACCACCUCUUCUGCAACAGUUAAUAAUCCAUUCCUUCCAUCUGAAGAUCAGGUAUCCAAAACAAGUAUUGGAUGGUUACGGUUAUUACAUCAUUGCCUUACUCACAUAAGUGAUCUAGAAGGAAUGAUGGCAAGUGCAGCUGCACCUACUGCUAAUCUGCUGCAGACUUGUGCGGCCUUAUUGAUGUCACCUUACUGUGGAAUGCAUUCACCCAACAUCGAGGUUGUGCUUGUAAAGAUAGGACUGCAGUCUACUAGAAUUGGCCUGAAGCUCAUAGACAUUCUCCUGAGAAAUUGUGCAGCAUCAGGCAGUGAUCCUACAGAUUUGAAUAGUCCUUUACUUUUUGGAAGACUAAAUGGACUCUCUUCUGACUCUACGAUAGAUAUUCUUUACCAGCUUGGAACAACUCAGGAUCCUGGUACAAAAGACAGAAUUCAGGCCUUGUUAAAAUGGGUUAGUGAUUCUGCAAGAGUGGCUGCUAUGAAGAGAAGUGGCAGGAUGAACUACAUGUGUCCUAACUCCUCAACAGUAGAGUAUGGUCUUCUGAUGCCAUCUCCUUCUCAUUUGCACUGUGUAGCAGCCAUUCUGUGGCAUAGUUAUGAGCUGCUUGUAGAAUAUGACUUACCAGCACUCCUGGACCAAGAGCUCUUUGAGUUACUUUUUAAUUGGUCCAUGUCUCUUCCCUGCAAUAUGGUUUUGAAGAAAGCUGUUGACAGUCUACUUUGCUCAAUGUGUCACGUACACCCAAACUAUUUUUCUUUGCUCAUGGGCUGGAUGGGAAUUACCCCUCCUCCAGUGCAAUGUCAUCAUAGACUGUCCAUGACAGAUGAUAGCAAAAAGCAGGAUCUUAGUUCAUCUUUAACAGAUGACUCUAAAAAUGCACAAGCACCUCUCGCAUUAACUGAAUCACAUUUGGCUACCCUUGCUUCCUCUUCUCAAUCUCCUGAAGCUAUUAAACAAUUACUAGACUCAGGUUUGCCUUCUCUUCUUGUGAGGAGUCUGGCUAGUUUCUGCUUUAGCCACAUUUCUAGCUCAGAAAGCAUUGCCCAGUCAAUAGAUAUUUCCCAGGACAAACUCAGGCGCCAUCAUGUCCCACAACAAUGUAAUAAGAUGCCUAUCACAGCCGACCUAGUUGCUCCUAUUCUUAGGUUUUUGACAGAAGUUGGCAAUAGCCAUAUUAUGAAAGAUUGGCUUGGUGGUUCUGAAGUCAAUCCACUAUGGACAGCACUUCUGUUUUUAUUGUGUCACUCUGGGUCCACUUCUGGAAGCCAUAAUUUAGGUGCACAACAGACCAGUGCAAGAUCAGCUUCUCUUUCUUCAGCUGCUACAACAGGACUGACUACUCAACAGCGCACAGCAAUUGAGAAUGCAACUGUUGCGUUCUUUCUACAGUGCAUUUCAUGCCAUCCUAAUAAUCAAAAGCUGAUGGCACAGGUUCUUUGUGAACUAUUUCAGACAUCUCCUCAAAGAGGGAACCUUCCAACAUCUGGGAACAUUUCAGGGUUUAUACGAAGAUUAUUUUUACAGUUGAUGCUGGAAGAUGAGAAAGUGACAAUGUUUCUUCAGUCUCCAUGUCCACUGUACAAAGGUAGAAUUAAUGCUACUAGCCACGUCAUCCAGCAUCCAAUGUAUGGAGCAGGCCACAAAUUCCGUACUCUUCAUUUGCCAGUCUCAACAACAUUAUCAGAUGUUCUUGACAGAGUGUCAGAUACUCCAAGUAUCACAGCUAAAUUAAUUAGUGAACAAAAAGAUGACAAAGAAAAGAAAAACCAUGAAGAGAAAGAAAAAGUUAAAGCGGAAAAUGGAUUUCAAGACAAUUACAGUGUUGUUGUUGCCUCUGGGCUGAAGUCUCAAUCUAAACGUGCUGUGUCAGCUACACCACCUCGCCCACCAUCCAGGAGGGGGAGGACAAUACCUGAUAAAAUAGGAAGUACUUCAGGAGCAGAGGCUGCCAACAAAAUAAUUACUGUCCCAGUGUUUCACCUGUUUCACAAACUCUUGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-800.57 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -859.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 745.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((((((...))).))))...((((((....))))))(((.(((((((((.....((((((((((.(((..........((((((......))))))...((((((((...(((((((((...(((((((((.............))).))))))...)))).((...((((((..((..((((.(..(((((..((((((((((....)))))))......)))..)))))..).)))))).))))))...)).(((((((((((((.(((((((((((.(((((......)))))))...((((......))))...)))))))).((((((((.(.(((........))).).))))))))..(((((...(((((...((((((((.(((..(((....)))........((((((((((.(((...((((((.(((...((......))...)))))))))...)))......(((((...)))))..........(((((((((..((((((((...(((((((((((((((...((...(((((..((((((((((((((((((.(((.(((((.((((((((((..((((((((.......(((((((.((((((.((((((...(((((...(((((((((.((((..(((.((((..((.((.....)).))..)))))))...)))))))))))))..))))))).)))).(.(((((..((....))..))))).)................((.((((....)))).))))))))..)))))))..(((((((((......)))...((((.(((.........))).))))..............))))))..(((..((((((((((...(((((...............................)))))...)))).))))))..)))..))))))))...))))...))))))..)))))..((((....))))))).))))))).))))((((((((((((((((...((((.........))))....)))))))............(((((..(((((...........)).)))..)))))))))))))).....))))))))))))............((((((.((((((((...((((....)))).))))).))).))))))...((((((.((((...((..(((((((((((((...))))..)))).))))).)).))))..((((.(((.((((((((((((((((((((......)))))...))))))...))))(((((((..(((((.........)))))...)))))))..((((((((((((((((((.((.((((((((((..((.....))))))).((((..(....)..))))...(((....)))))))).)))))).............))))))))))))))((((((((....(((((((((.((((........)))).))))....((((((((((((((...))))).)).......)))))))..........(((((((..((((((....)))))))))).)))........))))).))))))))............................((.((((((.(((......)))...)))))).)))))))))).))))(((((...)))))......((.....))))))))((((.((((((.....))))))..)))).(((((.............)))))...(((.........(((.......)))........)))....(((((..(((.(((....))).)))..)))))...))...)))))).)))))))))..))))......))))..))))...)))))..)))))).))))..)))...)))))))).))))).)))))........((((...(((.(((..((......))..))).)))))))......((((((((.((((..((((....))))....))))))..))))))...).)))))))))))))(((((((((.(......).))))))))).....))))).((((((((((......((((.((((.(((.((((....))))..))).......)))))))))))))..))))).)))..))))).))).))))))))))........(((.((((..(((((..((.....))..)))))((((((.((((............))))))))))...(((((((................)))))))..(((((.....)))))..........((.((((...))))))..((((.(((.(((((((...)))))))))).....))))........((((((.((((.((((.(((((((((.........))))))..))))))))))).))))))....(((((........)))))......))))))).))))))))).)))(((((((((((....((((((.((((((((.......(((........(((((...(((((.(((((...)))))((((((...))))))...(((((.....))))))))))....)))))........)))......))))))))...............))))))..)))......(((((...((((((((((((..(((((((..(((((((((..........((((((...)))).))....((((.(((.((.....)).))).))))......((((......)))).)).)))))))...)))))))...))))))......)))))).....)))))..)))))))).....)))((...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((,((,...(({((.(((...((((((....))))))..,))},))))}||,..{{{(({{(,,{{{,.....,..))},}))}}.......,.,,.....(((((.....(((((.{({.,.(((((((((.............)))},))))),))).))))).,...}))))}.)))))).)((((({......((((((((....))))))))....{(((((.(((((.((..((((,({(((((({.,.(((((((((((((.(((((((((((,(((((......))))))},..{{{{......))},..,})))))))|((((((((.(.(((........))).}.))))))))..{((((...(((((...((((((((.(((..{({....}}}........((((((((((.,((...((((({,(((.,.((......)).,,))}))))))...,,,......(((((...))))).......{,{(({(((({{..(({(((((.{.(((((((((((((((...((.,,(((((..(((({{{{{(({{{{{{{,((({(((({.{(({({{{{{.,|||{{{{,...,,,,((((({{.|||||{,.|(({{...{{{{{...(((((((({{((((.,(((.((((..((.{{.....)).))..)))))))...)))))))))))))..}}}}|,|,|,|,,(.(((((..((,...}),,)))))..................{(.((((....)))).)))}}}|}..}}||}||,,,{,.,,|{|......}||,,.|||,,|,||||{.....(((({,.,..,,...........}))})}.,,|}}|{{{||||{{.,,||{(({{,,.,,,..,,,.....,,,{{,,,.,,{{||,,,,}})))|,||||,....,..,))))))}|...))}},,,}|||||,,}||||..((((....)))).,,.)))))))}))))(((((((({(({(({{...{{||......,.,))))....))))))),....,|,|||.{{{,,..{{({{,..,.,,..,,||.,}}.,)}))}}))))}}}},|||,}|||||||||||{,..,{{.{{{.((((((.((((((((...(((,...,))}}.))))).))).)))))).,,|||,||,,|||,,.|,.,||||||{{{|{{{,.,||}}|.}}}}.}}}}}.}},)))),.{{{{...}}}}...{{{{(((((((((({......}))))...))))))..,}}}}{{((({{{{(({{{.,......,})}}|,,||||||||{.(((((((((((((((((({(({((((((((({,.{{.....}}})}}}.{(((..{....)..)))}..,|||..,,},}))))}.}}))))}}.,,........))))))))))))))((((((((....{(((({{{{.((((,.......}}}}.}}}}....((((((((((((((...))))).)}......,))))))).,..{{{{{.{,{{,....|||,,,}}}}),,}|||,}}.))}},,,,...))))).)))))))),...................,{{{{.,.((,((((((.(((......))),,.)))))).)),|{{,{({{{...(((((...)))))))))),))),...))))))}}((((.((((((.....))))))..)))).{((((...,|........))))}..,}||}},.,,,,,|||...,}..)))},.,,,.....,...(((((..(((.(({....})).)))..)))))...)}...))))))}}))))))))}.)))),.....,))),,)))).,,.,,})..)))))))}}))..)))...)))))))).))))).)))))........((((,..{((.(((..,(,.....)),.))).)))))))......(((((({{.((({..((((....))))....,))),,..))))))...,.))))))))))))}{{{((((((((((((((((((((,,.(((,...}))}..((((((((((......((((.((({,(((.((((....)))}..))}.......)))))))))))))..))))).{{{.,,{,,,.,......{{|||||.,....,}),,}))),..{((((..((.....))..))))|((((({{((((.|.,......,.)))))))))}...(((((((............,,..)))))))..(((((.....))))),}}))))}..,,,((((...))))}|..((((,{,,.,{{{|||...,})))))))}.....}}}}..,.{{{,((((((.((((.((({,(((((((((,,....,,.)))))),.})))))))))).)))))).,}}|||{{.......,)))))}))))}}}}.|(({((|({{,,}},.))))|)|))|||....((((((.((((((((.,,.,,.(((,,,.,{{{((,,,.,}||||,,|||{,,,.))}))((((((...))))))...(((((.....)))))},,}}....}}}},........,},......))))))))...............))))))..))}.})))))),{,...({{((((((((({.(((((((..((((((({{..........{({(((,,,|||}.}}....((((.(((.((.....)).))).))))......{|||,,....)))).}).)))))))...))))))).},))))))......)}))))...,}))).))))..)).)).))))))))))))))
Back