Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0085800
Sequence Length
1264 nt
GC Content
0.4422
GUGGUGUUCAGCUCAUAUGCAAUAAUAUGGUUACUAGUACAAGGGCUAUUGUGAACACUGCAAGAAGUAUGGUAUCAACUAUUAUGAAAUUUCUUGACUCUGGUCCAAAUAAAGCUGUUGACAGCACAUUGAAAACAAGAAUACUAGCUUCUGAGCCUGACAAUGCUGAAGGGAUUCAUAACUUUGCACCCCUCGGUACAAUCACAUCUAGCAGUCCUACUGCCCAACCAGCUGAAGUGCUAUUGCAGGCCACACCUCCUCACAGAAGAGCUCGCUCUGCUGCUUGGUCCUACAUCUUUCUUCCAGAGGAGGCUUGGUGUGACCUUACCAUUCACCUUCCUGCAGCAGUGCUGCUUAAGGAGAUACAUAUCCAGCCUCAUCUUGCAUCUCUUGCAACCUGCCCUUCCUCAGUGUCUGUUGAAGUAAGUGCAGAUGGGGUAAAUAUGCUACCUUUGUCCACUCCUGUUGUCACAAGUGGCCUCACCUACAUAAAAAUUCAGCUUGUAAAAGCCGAAGUAGCUUCUGCUGUCUGCCUUAGACUACAUCGUCCACGGGAUGCCAGCACAUUAGGCCUUUCACAAAUUAAAUUAUUGGGGCUCACUGCUUUUGGUACCACCUCUUCUGCAACAGUUAAUAAUCCAUUCCUUCCAUCUGAAGAUCAGGUAUCCAAAACAAGUAUUGGAUGGUUACGGUUAUUACAUCAUUGCCUUACUCACAUAAGUGAUCUAGAAGGAAUGAUGGCAAGUGCAGCUGCACCUACUGCUAAUCUGCUGCAGACUUGUGCGGCCUUAUUGAUGUCACCUUACUGUGGAAUGCAUUCACCCAACAUCGAGGUUGUGCUUGUAAAGAUAGGACUGCAGUCUACUAGAAUUGGCCUGAAGCUCAUAGACAUUCUCCUGAGAAAUUGUGCAGCAUCAGGCAGUGAUCCUACAGAUUUGAAUAGUCCUUUACUUUUUGGAAGACUAAAUGGACUCUCUUCUGACUCUACGAUAGAUAUUCUUUACCAGCUUGGAACAACUCAGGAUCCUGGUACAAAAGACAGAAUUCAGGCCUUGUUAAAAUGGGUUAGUGAUUCUGCAAGAGUGGCUGCUAUGAAGAGAAGUGGCAGGAUGAACUACAUGUGUCCUAACUCCUCAACAGUAGAGUAUGGUCUUCUGAUGCCAUCUCCUUCUCAUUUGCACUGUGUAGCAGCCAUUCUGUGGCAUAGUUAUGAGCUGCUUGUAGAAUAUGACUUACCAGCACUCCUGGACCAAGAGCUCUUUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-357.07 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -380.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 406.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((..(((.(((((......)))))))).((((((...((((((..((........((((((((.(.(((........))).).))))))))))..)))))).......((((....))))................)))))).......(((((.(((((((((.(((...((......))...)))))))).............(((((...)))))......(((......)))))))))))).)))))..)(((...((((((((((......))(((((((..(((((((((((.(((.(((((.((((((((((..((((((((.......(((((((.((((((.((((((...(((((...(((((((((.((((..(((.((((..((.((.....)).))..)))))))...)))))))))))))..))))))).)))).(.(((((..((....))..))))).)................((.((((....)))).))))))))..)))))))..(((((((((......)))...((((.(((.........))).))))..............))))))..(((..((((((((((...(((((...............................)))))...)))).))))))..)))..))))))))...))))...))))))..)))))..((((....))))))).))))))).))))((....)).(((((((...((((.........))))....))))))).......(((((((.....((((((((.((((.(((((....(((((((((.(((.((((((.(((((((((((((..(((.(((.((((((.((((((((...((((....)))).))))).))).))))))...))).))).))).)))..)))))))....)))))).)))))....((((.((......)).))))..........(((((((((((((((......)))))...))))))...)))).........)))))))......))))).))))))))))))((((((((((((((((((.((.((((((((((..((.....))))))).((((..(....)..))))...(((....)))))))).)))))).............)))))))))))))))))))))......(((.((((.((((........)))).)))))))..))))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((,,(((.(((((......))))))}}.,{{((,,,,,{||||.,{||},||,,|((((((((.(.(((........))).).)))))))),|,,||||||{......((((....))))...,{,....,,|{..,,}}||,,..,{.(((((,{,,((((({,(((.,.((......)).,,))})))))}............(((((.,.}||}}......(((.,.,.,))},}}))))||||}}}|,,|((,..{{((((({{((.,,,{,||,(((({,..{{{{,,,{{{{,||{}||||,.{|||({{{{{.,{{{{{{{,.,,,,,,|{(((||.))|}},..|||||...{{{{{...(((((((({{((((.,(((.((((..((.{{.....)).))..)))))))...)))))))))))))..}}}}|,|,|,,,,(.(((({..{(,...})..))))),,...............|{{.((((....)))).})}|}}|}..}||||||,,,{{.,,|{|......}||,..|||},|.|||||.....|{(({|................,)))))}.|,{|}|{{((((({{...{{(((,{,,.,{{...,,,,..,,{,,{,,,.,,{,||}}},,,)))|,||||,,..,,,.,)))))}}|.,.|||,...,|}}}|,.)))||..((((....)))).,,.)))))))})}}}((,,{{||.(((((({...{{((......,.,))))....)))))))......,{((((((.....((((((((.((({.(((({....{{((({{||||{||{{({{,.(((((({{(((((..{((.{({.((((((.((((((((...(((,...,))}}.))))).))).))))))..,}}).})}.)))}},}..})))))}.,.,}}||||{||||,,,...|||.|,,},}}})}.||||...}))}...{{{{(((((((((((......}))))...)))))}...}})},}}...,},}))))))......))))).)))))))))))}(((((((((((((((((({(({((((((((({,.{{.....}}})}}}.{(((..{....)..)))}..,|||..,,},}))))}.}}))))}}.,,........))))))))))))))))))))).,,,,,{||,||{|,||||,.......}))),))))}}}.}))))))}))))))}}}))
Back