Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0089600
Sequence Length
1940 nt
GC Content
0.4232
UAUUGGAUGGUUACGGUUAUUACAUCAUUGCCUUACUCACAUAAGUGAUCUAGAAGGAAUGAUGGCAAGUGCAGCUGCACCUACUGCUAAUCUGCUGCAGACUUGUGCGGCCUUAUUGAUGUCACCUUACUGUGGAAUGCAUUCACCCAACAUCGAGGUUGUGCUUGUAAAGAUAGGACUGCAGUCUACUAGAAUUGGCCUGAAGCUCAUAGACAUUCUCCUGAGAAAUUGUGCAGCAUCAGGCAGUGAUCCUACAGAUUUGAAUAGUCCUUUACUUUUUGGAAGACUAAAUGGACUCUCUUCUGACUCUACGAUAGAUAUUCUUUACCAGCUUGGAACAACUCAGGAUCCUGGUACAAAAGACAGAAUUCAGGCCUUGUUAAAAUGGGUUAGUGAUUCUGCAAGAGUGGCUGCUAUGAAGAGAAGUGGCAGGAUGAACUACAUGUGUCCUAACUCCUCAACAGUAGAGUAUGGUCUUCUGAUGCCAUCUCCUUCUCAUUUGCACUGUGUAGCAGCCAUUCUGUGGCAUAGUUAUGAGCUGCUUGUAGAAUAUGACUUACCAGCACUCCUGGACCAAGAGCUCUUUGAGUUACUUUUUAAUUGGUCCAUGUCUCUUCCCUGCAAUAUGGUUUUGAAGAAAGCUGUUGACAGUCUACUUUGCUCAAUGUGUCACGUACACCCAAACUAUUUUUCUUUGCUCAUGGGCUGGAUGGGAAUUACCCCUCCUCCAGUGCAAUGUCAUCAUAGACUGUCCAUGACAGAUGAUAGCAAAAAGCAGGAUCUUAGUUCAUCUUUAACAGAUGACUCUAAAAAUGCACAAGCACCUCUCGCAUUAACUGAAUCACAUUUGGCUACCCUUGCUUCCUCUUCUCAAUCUCCUGAAGCUAUUAAACAAUUACUAGACUCAGGUUUGCCUUCUCUUCUUGUGAGGAGUCUGGCUAGUUUCUGCUUUAGCCACAUUUCUAGCUCAGAAAGCAUUGCCCAGUCAAUAGAUAUUUCCCAGGACAAACUCAGGCGCCAUCAUGUCCCACAACAAUGUAAUAAGAUGCCUAUCACAGCCGACCUAGUUGCUCCUAUUCUUAGGUUUUUGACAGAAGUUGGCAAUAGCCAUAUUAUGAAAGAUUGGCUUGGUGGUUCUGAAGUCAAUCCACUAUGGACAGCACUUCUGUUUUUAUUGUGUCACUCUGGGUCCACUUCUGGAAGCCAUAAUUUAGGUGCACAACAGACCAGUGCAAGAUCAGCUUCUCUUUCUUCAGCUGCUACAACAGGACUGACUACUCAACAGCGCACAGCAAUUGAGAAUGCAACUGUUGCGUUCUUUCUACAGUGCAUUUCAUGCCAUCCUAAUAAUCAAAAGCUGAUGGCACAGGUUCUUUGUGAACUAUUUCAGACAUCUCCUCAAAGAGGGAACCUUCCAACAUCUGGGAACAUUUCAGGGUUUAUACGAAGAUUAUUUUUACAGUUGAUGCUGGAAGAUGAGAAAGUGACAAUGUUUCUUCAGUCUCCAUGUCCACUGUACAAAGGUAGAAUUAAUGCUACUAGCCACGUCAUCCAGCAUCCAAUGUAUGGAGCAGGCCACAAAUUCCGUACUCUUCAUUUGCCAGUCUCAACAACAUUAUCAGAUGUUCUUGACAGAGUGUCAGAUACUCCAAGUAUCACAGCUAAAUUAAUUAGUGAACAAAAAGAUGACAAAGAAAAGAAAAACCAUGAAGAGAAAGAAAAAGUUAAAGCGGAAAAUGGAUUUCAAGACAAUUACAGUGUUGUUGUUGCCUCUGGGCUGAAGUCUCAAUCUAAACGUGCUGUGUCAGCUACACCACCUCGCCCACCAUCCAGGAGGGGGAGGACAAUACCUGAUAAAAUAGGAAGUACUUCAGGAGCAGAGGCUGCCAACAAAAUAAUUACUGUCCCAGUGUUUCACCUGUUUCACAAACUCUUGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-527 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -562.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 511.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((((....((((....(((((((.((((..((((....)))).....)))))))))))((....)).(((((((...((((.........))))....)))))))......((((((.......((((((((.((((.(((((....(((((((((.(((.((((((.(((((((((((((..(((.(((.((((((.((((((((...((((....)))).))))).))).))))))...))).))).))).)))..)))))))....)))))).)))))....((((.((......)).))))..........(((((((((((((((......)))))...))))))...)))).........)))))))......))))).))))))))))))((((((((((((((((((.((.((((((((((..((.....))))))).((((..(....)..))))...(((....)))))))).)))))).............))))))))))))))(((((...)))))(((.((((.((((........)))).))))))).((((((((((((((...))))).)).......)))))))....(((((...((......))...)))))..((((((((((((((..((((((..((.(((((.(.(((.......................((.((((((.(((......)))...)))))).))..(((......)))))).).))))).))...))))))..(((.....((((.((((((.....))))))..))))...))).(((((...(((..(((...............((((((...(((((....(((((......(((((..(((.(((....))).)))..)))))..(((.((((......((.((((((.(((((((........))))))).)))))).))..)))).))).......(((((.((((.......((((..((((.((((((((((.(((..((......))..))).)))).........).)).)))))))..))))........))))))))))))))..)))))))))))....)))..)))...)))))(((((.((((((....((((...))))..((((((((((......((((.((((.(((.((((....))))..))).......)))))))))))))..))))).(((......)))....))))))..)))))....)))))).....))))))))((((.......((((((((((...))))))))))......))))......(((((((................)))))))..(((((.....)))))......))))))(((((...)))))...((((.(((.(((((((...)))))))))).....))))........((((((.((((.((((.(((((((((.........))))))..))))))))))).))))))....(((((........)))))))))...))))))))(..((((.((.((((((((((((....((((((.((((((((.......(((........(((((...(((((.(((((...)))))((((((...))))))...(((((.....))))))))))....)))))........)))......))))))))...............))))))..)))......(((((...((((((((((((..(((((((..(((((((((..........((((((...)))).))....((((.(((.((.....)).))).))))......((((......)))).)).)))))))...)))))))...))))))......)))))).....)))))..)))))))))...))..))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.,(((((((....(((({...(((((((.((((..((((....)))).....)))))))))))((.,,,||.(((((((...((((.........))))....)))))))..,,,{(((,{{{{{{{,,,(((((,,,,,,,.,.,,.....,{{{{||{{{({{{{{((({.(((((((((((((..(((.(((.((((((.((((((((...(((,...,))}}.))))).))).))))))...}}).))).)))}},)..))))))).}.}}}}{{((((({,,....|,,.,.}}}))))}.{{{{...}})}...{{({(((((((((((......}))))...)))))}...}}}}((((({{{,{((((,........))))}.,,))))))),.(((((((((((((((((({(({((((((((({,.{{.....}}})}}}.{(((..{....)..)))}..,|||..,,},}))))}.}}))))}}.,,........))))))))))))))((((((({....,((({((((.((((........)))).)))),,,.((((((((((((((...))))).)}......,))))))).,..(((((,{.{{.....|)|...)))))..|||||||{||||||...,,|||},,|}|||||}{.,,,...............,{{({.,.((,((((((.(((......))),,,)))))},)),,((,{{{{{.,,|{||{..,))))}))}}}})))},..|||}},,,{(((.((((((.....))))))..)))}...|||,|||||,,.|||.|{{{|,,,{{,,.....,.{((({{...{{{|{....{{{{,,,....(((((..(((.({,....,}}.))).,)))}|,.{{{.{{((({{{...,}|||||{.(((((((.....,,.}}}))}}.,,}|}},}}.,)))}}}}}..}},.,|||,,..|{....||,,(({{..,{{(,(((,((((((,{((...{,.....}}|.||}.}}}}.,,,,....|{{|{|||,|||,.,|||{....))))...,})))})},)}}))),}}|||||.,|,,,,..,}},}}))}))|||||,||||{{|,,.{((,...}))}..((((((((((......((((.((({,(((.((((....)))}..))}......,)))))))))))))..))))).{{{.,,{,,,.,....,,}|))}|)}},,....)))))),....||||,}||{{{{.}}..,,||((((((({...|)))))))}}...,}})))),,,...{((((((............,...)))))))..(((((.....)))))....,,))},,|,((((...)))))|,,|{{{,,...,|||||}...,}}}))))},.....)))},...,,,.{{||||,||||,((({,(((((((((,,....,..)))))),.}))))))}))),))})))..})}||||.,}},,}}}})})))))...)))))))){..((((.((.((((((((((((....((((((.((((((((.,,.,,.(((,,,.,{{{((,,,.,}||||,,|||{{,,.))}))((((((...))))))...(((((.....)))))},,}}....}}}},........,},......))))))))...............))))))..)))......{((((...(((((((((((({.(((((((..((((((({{..........{({(((,,,|||}.}}....((((.(((.((.....)).))).))))......{|||,,....)))).}).)))))))...))))))).},})))))......)))))).....))))}..)))))))))...))..))))..)
Back