Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0094100

Sequence Length

1352 nt

GC Content

0.4186

GUUACUUUUUAAUUGGUCCAUGUCUCUUCCCUGCAAUAUGGUUUUGAAGAAAGCUGUUGACAGUCUACUUUGCUCAAUGUGUCACGUACACCCAAACUAUUUUUCUUUGCUCAUGGGCUGGAUGGGAAUUACCCCUCCUCCAGUGCAAUGUCAUCAUAGACUGUCCAUGACAGAUGAUAGCAAAAAGCAGGAUCUUAGUUCAUCUUUAACAGAUGACUCUAAAAAUGCACAAGCACCUCUCGCAUUAACUGAAUCACAUUUGGCUACCCUUGCUUCCUCUUCUCAAUCUCCUGAAGCUAUUAAACAAUUACUAGACUCAGGUUUGCCUUCUCUUCUUGUGAGGAGUCUGGCUAGUUUCUGCUUUAGCCACAUUUCUAGCUCAGAAAGCAUUGCCCAGUCAAUAGAUAUUUCCCAGGACAAACUCAGGCGCCAUCAUGUCCCACAACAAUGUAAUAAGAUGCCUAUCACAGCCGACCUAGUUGCUCCUAUUCUUAGGUUUUUGACAGAAGUUGGCAAUAGCCAUAUUAUGAAAGAUUGGCUUGGUGGUUCUGAAGUCAAUCCACUAUGGACAGCACUUCUGUUUUUAUUGUGUCACUCUGGGUCCACUUCUGGAAGCCAUAAUUUAGGUGCACAACAGACCAGUGCAAGAUCAGCUUCUCUUUCUUCAGCUGCUACAACAGGACUGACUACUCAACAGCGCACAGCAAUUGAGAAUGCAACUGUUGCGUUCUUUCUACAGUGCAUUUCAUGCCAUCCUAAUAAUCAAAAGCUGAUGGCACAGGUUCUUUGUGAACUAUUUCAGACAUCUCCUCAAAGAGGGAACCUUCCAACAUCUGGGAACAUUUCAGGGUUUAUACGAAGAUUAUUUUUACAGUUGAUGCUGGAAGAUGAGAAAGUGACAAUGUUUCUUCAGUCUCCAUGUCCACUGUACAAAGGUAGAAUUAAUGCUACUAGCCACGUCAUCCAGCAUCCAAUGUAUGGAGCAGGCCACAAAUUCCGUACUCUUCAUUUGCCAGUCUCAACAACAUUAUCAGAUGUUCUUGACAGAGUGUCAGAUACUCCAAGUAUCACAGCUAAAUUAAUUAGUGAACAAAAAGAUGACAAAGAAAAGAAAAACCAUGAAGAGAAAGAAAAAGUUAAAGCGGAAAAUGGAUUUCAAGACAAUUACAGUGUUGUUGUUGCCUCUGGGCUGAAGUCUCAAUCUAAACGUGCUGUGUCAGCUACACCACCUCGCCCACCAUCCAGGAGGGGGAGGACAAUACCUGAUAAAAUAGGAAGUACUUCAGGAGCAGAGGCUGCCAACAAAAUAAUUACUGUCCCAGUGUUUCACCUGUUUCACAAACUCUUGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-344.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -368.02

Frequency: 0.0000

Diversity: 314.4

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((..((((((....((...((((((((((...((......))...)))))..((((((((((((((..((((((..((.(((((.(.(((.......................((.((((((.(((......)))...)))))).))..(((......)))))).).))))).))...))))))..(((.....((((.((((((.....))))))..))))...))).(((((...(((..(((...............((((((...(((((....(((((......(((((..(((.(((....))).)))..)))))..(((.((((......((.((((((.(((((((........))))))).)))))).))..)))).))).......(((((.((((.......((((..((((.((((((((((.(((..((......))..))).)))).........).)).)))))))..))))........))))))))))))))..)))))))))))....)))..)))...)))))(((((.((((((....((((...))))..((((((((((......((((.((((.(((.((((....))))..))).......)))))))))))))..))))).(((......)))....))))))..)))))....)))))).....))))))))((((.......((((((((((...))))))))))......))))......(((((((................)))))))..(((((.....)))))......)))))..))...))))))..))((.((((...((((((...))))))(((((......))))).....((((...(((((((((.((((....(((((((.((.............))))).)))).......(((((........))))).....)))).)))))))))...))))((((((((((((....((((((.((((((((.......(((........(((((...(((((.(((((...)))))((((((...))))))...(((((.....))))))))))....)))))........)))......))))))))...............))))))..)))......(((((...((((((((((((..(((((((..(((((((((..........((((((...)))).))....((((.(((.((.....)).))).))))......((((......)))).)).)))))))...)))))))...))))))......)))))).....)))))..))))))))).......)))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((,.((((((....((...((((((((((,,.{{.....})}...))))}..((((((((((((((..{(((((..((.(((((.{.{({................{{{{.,.(({({{(((.(((......)))}},)))))},)),.(({...,,.)}}})).}.))))).)),..)))))}.,(((,,...((((.((((((.....))))))..)))}..,|||.{{{({...{{{.,|||,...,,.........((((({...{((((....(((({,,,...(((((..(((.((,....})).))).,)))))..{{{,,,((({{{....}}||||,.(((((((.....,,.}}}))}}.,|||}}.}}.,)))}}}},..},...{{{{,.,{{,.......((((,.{(((.((({((((((.(((..,(,.....}),.))).)))).........||||.|}}}))),.)}}|.....}}}),,.}))))}))))..)))})))))))..,.}}}..})).,,)))))(((({.((((((....((({...}))}..((((((((((......((((.((({,(((.((((....)))}..))}......,)))))))))))))..))))).{({......,,},,,.))))))..)))}}....)))))).....))))))))((((.,.....((((((((({...})))))))))....,.))))......(((((((................)))))))..(((((.....))))).....,)))))..))...}))))).}))((.((({..,((((({...})))))}||,......,|,,.......((((...(((((((((.((((.{..(((((({.{{...,....,....}}))),,))).......(((((........))))).....)))).)))))))))...))))((((((((({{{....((((((.((((((((.,{.,,.((({{,.,{{{((,,,.}}||||,,|||,,,,.))}))((((((...))))))...(((((.....)))))},,},....}}}}}........,},......))))))))...............))))))..)))......{((((...(((((((((((({.(((((((..((((((({{..........{({(((,,,|||}.}}....((((.(((.((.....)).))).))))......{|||,,....)))).}).)))))))...))))))).},})))))......)))))).....))))}..))))))))}.......}))).))