Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0094500
Sequence Length
2787 nt
GC Content
0.4399
GUUACUUUUUAAUUGGUCCAUGUCUCUUCCCUGCAAUAUGGUUUUGAAGAAAGCUGUUGACAGUCUACUUUGCUCAAUGUGUCACGUACACCCAAACUAUUUUUCUUUGCUCAUGGGCUGGAUGGGAAUUACCCCUCCUCCAGUGCAAUGUCAUCAUAGACUGUCCAUGACAGAUGAUAGCAAAAAGCAGGAUCUUAGUUCAUCUUUAACAGAUGACUCUAAAAAUGCACAAGCACCUCUCGCAUUAACUGAAUCACAUUUGGCUACCCUUGCUUCCUCUUCUCAAUCUCCUGAAGCUAUUAAACAAUUACUAGACUCAGGUUUGCCUUCUCUUCUUGUGAGGAGUCUGGCUAGUUUCUGCUUUAGCCACAUUUCUAGCUCAGAAAGCAUUGCCCAGUCAAUAGAUAUUUCCCAGGACAAACUCAGGCGCCAUCAUGUCCCACAACAAUGUAAUAAGAUGCCUAUCACAGCCGACCUAGUUGCUCCUAUUCUUAGGUUUUUGACAGAAGUUGGCAAUAGCCAUAUUAUGAAAGAUUGGCUUGGUGGUUCUGAAGUCAAUCCACUAUGGACAGCACUUCUGUUUUUAUUGUGUCACUCUGGGUCCACUUCUGGAAGCCAUAAUUUAGGUGCACAACAGACCAGUGCAAGAUCAGCUUCUCUUUCUUCAGCUGCUACAACAGGACUGACUACUCAACAGCGCACAGCAAUUGAGAAUGCAACUGUUGCGUUCUUUCUACAGUGCAUUUCAUGCCAUCCUAAUAAUCAAAAGCUGAUGGCACAGGUUCUUUGUGAACUAUUUCAGACAUCUCCUCAAAGAGGGAACCUUCCAACAUCUGGGAACAUUUCAGGGUUUAUACGAAGAUUAUUUUUACAGUUGAUGCUGGAAGAUGAGAAAGUGACAAUGUUUCUUCAGUCUCCAUGUCCACUGUACAAAGGUAGAAUUAAUGCUACUAGCCACGUCAUCCAGCAUCCAAUGUAUGGAGCAGGCCACAAAUUCCGUACUCUUCAUUUGCCAGUCUCAACAACAUUAUCAGAUGUUCUUGACAGAGUGUCAGAUACUCCAAGUAUCACAGCUAAAUUAAUUAGUGAACAAAAAGAUGACAAAGAAAAGAAAAACCAUGAAGAGAAAGAAAAAGUUAAAGCGGAAAAUGGAUUUCAAGACAAUUACAGUGUUGUUGUUGCCUCUGGGCUGAAGUCUCAAUCUAAACGUGCUGUGUCAGCUACACCACCUCGCCCACCAUCCAGGAGGGGGAGGACAAUACCUGAUAAAAUAGGAAGUACUUCAGGAGCAGAGGCUGCCAACAAAAUAAUUACUGUCCCAGUGUUUCACCUGUUUCACAAACUCUUGGCAGGCCAGCCAUUGCCAGCUGAAAUGACACUUGCCCAGCUUUUAACUCUCCUAUAUGACCGAAAACUUCCUCAGGGUUACCGCUCAAUAGAUCUGACUGUUAAAUUGGGAUCAAGAGUUAUAACAGACCCCAGUCUAUCAAAAACAGAUUCUUAUAAAAGACUACACCCUGAAAAAGAUCAUGGAGACUUACUUGCUAGCUGUCCAGAAGAUGAGGCUCUCACUCCAGGUGAUGAAUGCAUGGAUGGGAUACUGGAUGAAUCUUUGCUUGAAACCUGUCCAAUUCAGUCACCAUUACAAGUUUUUGCAGGAAUGGGUGGACUGGCUCUUAUUGCUGAAAGACUACCCAUGCUAUAUCCAGAAGUAAUUCAACAGGUGAGUGCUCCAGUUGUAACAUCUACCACUCAGGAAAAGCCGAAGGAUAGCGAUCAGUUUGAAUGGGUGACCAUUGAACAGUCAGGGGAGUUAGUUUAUGAAGCACCAGAAACUGUUGCGGCUGAACCUCCACCUAUCAAGUCAGCAGUACAGACCAUGUCUCCCAUACCUGCCCAUUCUUUGGCUGCUUUUGGAUUAUUUCUUCGUCUUCCGGGCUAUGCGGAAGUGCUACUGAAAGAGAGAAAACAUGCCCAGUGCCUUCUUCGAUUGGUAUUGGGAGUGACAGAUGAUGGAGAAGGAAGUCAUAUUCUUCAAUCUCCAUCAGCCAAUGUGCUUCCAACCCUUCCUUUCCACGUCCUUCGUAGCUUGUUUAGCACUACACCUUUGACAACUGAUGAUGGUGUACUUCUAAGGCGGAUGGCAUUGGAAAUUGGAGCCUUACACCUCAUUCUUGUCUGUCUCUCUGCUUUGAGCCACCAUUCCCCACGAGUUCCAAACUCUAGCGUGAAUCAAACUGAGCCACAGGUGUCAAGCUCUCAUAACCCUACAUCAACAGAAGAACAACAGUUAUAUUGGGCCAAAGGGACUGGCUUUGGAACAGGCUCUACAGCUUCUGGGUGGGAUGUGGAACAAGCCUUAACUAAGCAAAGGCUGGAAGAGGAACAUGUUACCUGCCUUCUGCAGGUUCUUGCCAGUUACAUAAAUCCCGUCAGUAGUGCGGUAAAUGGAGAAGCUCAGUCAUCUCAUGAGACUAGAGGGCAGAACAGUAAUGCCCUUCCUUCUGUACUUCUCGAGCUUCUCAGUCAGUCCUGCCUCAUCCCAGCCAUGUCAUCUUAUCUACGAAAUGAUUCAGUUCUGGACAUGGCAAGACAUGUGCCACUCUAUCGGGCACUGCUGGAAUUGCUUCGGGCCAUUGCUUCUUGUGCUGCCAUGGUGCCCCUAUUGUUGCCCCUUUCUACAGAGAACGGUGAAGAGGAAGAAGAACAGUCAGAAUGUCAAACUUCUGUUGGUACAUUGUUAGCCAAAAUGAAGACCUGUGUUGAUACCUAUACCAACCGUUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-784.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -836.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 593.4
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....)(((((.((((((((((..(......)..))))))(((((.......((((((((((((((...((..((..((((.....))))......................((.((((((.(((......)))...)))))).)).)).))...)))))))))...))))).......))))).((((((..((((.((((((.....))))))..)))).(((((.............))))).........((((((((((...(((.((((((((((.......(((((..(((.(((....))).)))..)))))...(((((((((....((.((((((.(((((((........))))))).)))))).))..((((((....((.....((((((.........((......))..((((((((...((..((((((((((......(((....)))...((((((((.((((..((((....))))....))))))..))))))...(((((.(((......))))))))..(((((.((((((....((((...))))..((((((((((......((((.((((.(((.((((....))))..))).......)))))))))))))..))))).(((......)))....))))))..)))))..(((((((((((.(((((..((.....))..))))).(((.(((((..(((((((((((.(((((((((((.(((((((................)))))))((((((((((((((.((.((((((...((.((((...))))))..((((.(((.(((((((...)))))))))).....))))........((((...(((((((((.((((....(((((((.((.............))))).)))).......(((((........))))).....)))).)))))))))...))))((((((((((((....((((((.((((((((.......(((........(((((...(((((.(((((...)))))((((((...))))))...(((((.....))))))))))....)))))........)))......))))))))...............))))))..)))......(((((...((((((((((((..(((((((..(((((((((..........((((((...)))).))....((((.(((.((.....)).))).))))......((((......)))).)).)))))))...)))))))...))))))......)))))).....)))))..))))))))).......(((((((........)))))))(((..(((((.(((((((((..((((((..((((((.(((.((..(((((.....)))))..)).)))))))....))..)))))))))))..)))).)))))..))).....(((((......................))))).....)))))).)).)))))))))...)))))...((.((((.((((((((((.......((((((((((((((...((((((((.....(.(........).)......))))))))))))).))))).............(((((.(((((.(((((((.((((((((((((..((((......((((..(((.(((....)))....(((...(.((..(((.(((.....))).))).)).)...)))...))))))).....((((.(((((....)))))))))))))(((((((...(((((.(..(((.(((...))).)))..)))))))))).)))......))))))))).)))))).))))))))).)))))(((.....))).......))))......)))))))))).))))...)).))))))).))))..))))))))..(((.(((((((((..........))))))))).))).....(((((((((..((((.......))))..)))))))))...((((((.((((....(((((.(((((((((((.(((((.((((..(((...((((((............(((((((...(((.((((((((.((((..((((...((.........))...))))....))))..))))))))))).)))))))......(((((...)))))....(((..(((...)))..)))))))))...)))...))))..)))).....((((((......(((....(((..((((((.......))))))..))))))......)))))).).)))))))))))..((((((.........))))))))))).))))))))))((((((.....))))))...)))))))).))).....(((.((....)))))......(((((((((((((.((....)))))).(((((((.........)))))))...............))))))))))))))))))))..........((((((((..((.(((........)))..)).....)))))))).......(((((.(......)))))).(((.(((....))).))))))))....)))))..)).)))))))).))))))..))..))))))..)))))).))))))))))))))))...)))))).)))).....))))))(((((...(((((((((...........)).)))))))....))))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,.,,|{({,,.,(({((((((..(......}..}}}})),,{{|,}}},}|(((((((((({{{,..,{{,,,,,,((((.....}}}}...............,{{,.,.((,((((((.(((......))),,,)))))},)),,|,,|.,,}}))}}))|...))))),,,||,|}},,..{((((.{{((((.((((((.....))))))..}}},.(((((....,........)))))....,....,((((((((({..(((.((((((((((.......(((((..(((.(({....})).)))..)))))...(((((((((,,..{,,|((|{(.(((((((........))))))).}}}})}.}}..|||{{{,...{{.,,{,({{{{(,....,,...{||,...,,..((((((((...((..(((({.,..({,{{,.{{,,..,}},...(((((({(.(((,..((((....))))....,)))},..))))))...(((((.,{{......}}}))))).|(((({{((((((.{{{((({...,||...((((((((((......((((.((({,(((.((((....)))}..))}......,)))))))))))))..))))).,,..(((({...........))))).,....(((((((((((.(((((..((.....))..))))).((((({,,,,}||||(((((((.(((((((((((.(((((((............,...))))))){(((((((((((((.((.{{{{{{...,,,((((...)))))}...(((({.....}}))}...{{{{{((({,,....,,|,........((((...(((((((((.((((.,..(((((({.{{...,.........}}))),,))).......(((((........))))).....)))).)))))))))...))))((((((((((((....((((((.((((((((.,,.,,.(((,,,.,{{{((,,,.,}||||,,|||{{,,.))}))((((((...))))))...(((((.....)))))},,}}....}}}},........,},......))))))))...............))))))..)))......{((((...(((((((((((({.(((((((..((((((({{..........{({(((,,,|||}.}}....((((.(((.((.....)).))).))))......{|||,,....)))).}).)))))))...))))))).},})))))......)))))).....))))}..))))))))).......{((((((,.......})))))}|||..(((((.(((((((((..((((((..((((((.(((.((..(((((.....)))))..)).)))))))....))..)))))))))))..)))).)))))..}}}||...{||||.,,.......}},,{{,....,))),,..,,,)))))).)).)))))))))...}}}}},..((.((((.((((((((((.......((((((((((((((...((((((((...,.((,.,.....,}.)}.,...))))))))))))},))))).............(((((.(((((.(((((((.((((((((((((..{,{{......(((,,,(((.({{,,..|||,...{{{{,{{{,.,,,{|,|,,.,..,)}},}}},.||,...,)}...)))))))|,...((((.(((((....)))))}))).)))(((((((...(((((.(..(((.(((...))).)))..)))))))))).)))......))))))))).)))))).))))))))).)))))(((.....))).......))))......)))))))))).))))...)).))))))).))))..))))))),..(({,(((((((((......,,..))))))))),||},{,..(((((((((..((((.......))))..)))))))))....,||||,|{{{..,{(((((.(((((((((((.{{{(({(((,..{{{...((((({..{,{,...{,,{(,((((|,.((({((,((,{{.{||,.,|||,...{{{{,..,||||}|},}},},},,||}|,{||,|,|,,))).}}},,,,......(((({...}))))....(((..(({...,))..))))))))).,,))),..,,.,..,,,},,,..((((((......(((,...{((..((((((.......))))))..))))))......)))))),).)))))))))))..((((((.........))))))))))).)),,)))}}}((((((.....))))))...||||,}||,|,,.....{{{.{,...,})))),,....(((((((((((((.((....)))))).(((((((.........)))))))...............)))))))))))))))))))).......,..((((((((..((.(((........)))..)).....))))))))..{.{{.(((((.(......))))))})})))},}}))))))))))))))),}.)))))..)).)))))))).}}}}})}}}}.,}}||||..}))))).))})))))))))))))..{||,||{{{,||...,|}}}})}}||,.....|,}}))))}}.}}}})})}))},}}},,,....,,,,}))|,.,,,,)
Back