Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_BIRC6_0099400

Sequence Length

1224 nt

GC Content

0.4583

GCCAGCCAUUGCCAGCUGAAAUGACACUUGCCCAGCUUUUAACUCUCCUAUAUGACCGAAAACUUCCUCAGGGUUACCGCUCAAUAGAUCUGACUGUUAAAUUGGGAUCAAGAGUUAUAACAGACCCCAGUCUAUCAAAAACAGAUUCUUAUAAAAGACUACACCCUGAAAAAGAUCAUGGAGACUUACUUGCUAGCUGUCCAGAAGAUGAGGCUCUCACUCCAGGUGAUGAAUGCAUGGAUGGGAUACUGGAUGAAUCUUUGCUUGAAACCUGUCCAAUUCAGUCACCAUUACAAGUUUUUGCAGGAAUGGGUGGACUGGCUCUUAUUGCUGAAAGACUACCCAUGCUAUAUCCAGAAGUAAUUCAACAGGUGAGUGCUCCAGUUGUAACAUCUACCACUCAGGAAAAGCCGAAGGAUAGCGAUCAGUUUGAAUGGGUGACCAUUGAACAGUCAGGGGAGUUAGUUUAUGAAGCACCAGAAACUGUUGCGGCUGAACCUCCACCUAUCAAGUCAGCAGUACAGACCAUGUCUCCCAUACCUGCCCAUUCUUUGGCUGCUUUUGGAUUAUUUCUUCGUCUUCCGGGCUAUGCGGAAGUGCUACUGAAAGAGAGAAAACAUGCCCAGUGCCUUCUUCGAUUGGUAUUGGGAGUGACAGAUGAUGGAGAAGGAAGUCAUAUUCUUCAAUCUCCAUCAGCCAAUGUGCUUCCAACCCUUCCUUUCCACGUCCUUCGUAGCUUGUUUAGCACUACACCUUUGACAACUGAUGAUGGUGUACUUCUAAGGCGGAUGGCAUUGGAAAUUGGAGCCUUACACCUCAUUCUUGUCUGUCUCUCUGCUUUGAGCCACCAUUCCCCACGAGUUCCAAACUCUAGCGUGAAUCAAACUGAGCCACAGGUGUCAAGCUCUCAUAACCCUACAUCAACAGAAGAACAACAGUUAUAUUGGGCCAAAGGGACUGGCUUUGGAACAGGCUCUACAGCUUCUGGGUGGGAUGUGGAACAAGCCUUAACUAAGCAAAGGCUGGAAGAGGAACAUGUUACCUGCCUUCUGCAGGUUCUUGCCAGUUACAUAAAUCCCGUCAGUAGUGCGGUAAAUGGAGAAGCUCAGUCAUCUCAUGAGACUAGAGGGCAGAACAGUAAUGCCCUUCCUUCUGUACUUCUCGAGCUUCUCAGUCAGUCCUGCCUCAUCCCAGCCAUGUCAUCUUAUCUACGAAAUGAUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-352.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -372.8

Frequency: 0.0000

Diversity: 256.17

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((........))))....((((...((..(((...(((.(((((...((((.......(((..(((((((.....((....(((((((..((.((.((((((.((.............)).)))))).)).))....)))).)))......)).....)))))))..))).))))))))).)))...))).)))))).....(((((((((((((((...))))).))..((((.(((((((((((((..............((((...((((((..((((((.......(((.....(((((.(((((.(((((((.((((((((((((..((((......((((..(((.(((....)))....(((...(.((..(((.(((.....))).))).)).)...)))...))))))).....((((.(((((....)))))))))))))(((((((...(((((.(..(((.(((...))).)))..)))))))))).)))......))))))))).)))))).))))))))).))))).....)))))))))...))))))..))))(((.((((((((.((.(((((((((((.................(((.(((((((((..........))))))))).))).....(((((((((..((((.......))))..)))))))))......))))))))..........(((((((((((.(((((.((((..(((...((((((............(((((((...(((.((((((((.((((..((((...((.........))...))))....))))..))))))))))).)))))))......(((((...)))))....(((..(((...)))..)))))))))...)))...))))..)))).....((((((......(((....(((..((((((.......))))))..))))))......)))))).).)))))))))))..............))).)).)))))))).)))((....((((((.....))))))...))))))).......))))))))....))))((......(((((((((((((.((....)))))).(((((((.........)))))))...............))))))))).......)).))))))))...))(..(((((.((......)).)))))...)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((........))))....((((...({..(((...(((.(((((...((((.......(((..(((((((.....{{..,,(((((((..((.((.((((((.((.............)).)))))).)).))....))))}}}},,,...}).....)))))))..))).))))))))).)))...))),)))))).....(((((((((((((((...))))).)}..((((.(((((((((((((..,,..........((({...((((((..((((((.......(((..,..(((((.(((((.(((((((.((((((((((((..{,{{......(((,,,(((.({{,,..|||,...{{{{,{{{,.,,,{|,|,,.,..,)}},}}},.||,...,)}...)))))))|,...((((.(((((....)))))}))).)))(((((((...(((((.(..(((.(((...))).)))..)))))))))).)))......))))))))).)))))).))))))))).)))))..,..)))))))))...))))))..}))){((.((((((((.((.(((((((((((.,{(,....,,,.....(((.(((((((((..........))))))))).})).....(((((((((..((((.......))))..))))))))).....,))))))))....,,{,,.(((((((((((.{{{(({(((,..{{{...((((({..{,{,...{,,{(,((((|,.((({((,((,{{.{||,.,|||,...{{{{,..,||||}|},}},},},,||}|,{||,|,|,,))).}}},,,,......(((({...}))))....(((..(({...}))..))))))))).,,))),..,,.,..,,,},,,..((((((......(((,...{((..((((((.......))))))..))))))......)))))),).)))))))))))..||..,.......))).)).)))))))).))}||.,..((((((.....)))))),}.),))))).......))))))))....)))){{...,,.(((((((((((((.((....)))))).(((((((.........)))))))...............)))))))))..,....)).))))))))...))(..(((((,{{......}}.}))))...)