Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_BIRC6_0104300
Sequence Length
1353 nt
GC Content
0.4472
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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-358.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -387.9
Frequency: 0.0000
Diversity: 336.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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