Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CCDC66_0009500
Sequence Length
468 nt
GC Content
0.4209
GAAACAGUACUGCUGGAGCACCCUUUCAGUGCUGUGAAACAAGAACUGCAAAGAAAAUGGAUUGAAGAGUUGAAUAAGCAAAUAGAAGAUGACCGUCAAAGAAAAAUAGAGGAAAAAAUUAUAUAUUCAAAGGGUGAGGAACAUGACAGAUGGGCAAUGCACUUUGAUUCAUUAAAGAGUUAUCCUGGUUCUCAAUCUCAGCUGUUCUCUCAGUCAACACACAAACAACCUGAGUACUUCUGUGUCUCUCCUGACACUCAGGAGCUGGCUGAUGUCAGCAGUGUUUGUACACCUACAACCGGAAGCCAGGUUGAACCUUCAGAGGAGGAGCAUAUAGCAAAACCUAUUAAGGAUGUGGUUAUGGCAAACAGUAAGAAAACAAACUUUCUCCGUUCUAUGACUGCUCUCUUGGACCCAGCUCAGAUUGAGGAACGAGACAGACGACGACAAAAACAAUUAGAGCAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-102.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -113.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 117.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((..((.....))...)))))))))..........((....))....(((.((.(((((.......((((..............((((.((((.....((((((.................((.(((((((((....(((((((.(((.((...((((((......))))))...)))))))).))))....))))).)))).))..........(((((((.(..((((((.((...((((((...))))))((((((....)))))).((((....)))).....))))))))))))))))..(((((...))))).((.((((((....(((....))).....))))))))...................))))))..)))).))))))))))))).)).)))((((.(((((..........................))))).)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,..(((((((((..((.....}),..)))))))))....|..{{..({{......,,{{{{(({,,,.{{{,.....,}........,,{,.,(,((...........,,.,......,,.....,||{,{{.(({..(..(((.....)))..)...}).))))))|||,,,...,,|||.|}((.(((((((((((.(((((.,,,,,,,{,...........(((((((.(..((((((,((...((((({...))))))((((((....)))))).((((....))))...,,||))))))})))))))..(((((...))))).((.....)}....,||...,|||,.((((((((((..{((.{..(((((......))))),.))})))))))))),,,})}))}..))))).)))))))))))).))...,,,},,................))})).,
Back