Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CCNB1_0000900

Sequence Length

720 nt

GC Content

0.4292

GUUGAUACUGCCUCUCCAAGCCCAAUGGAAACAUCUGGAUGUGCCCCUGCAGAAGAAGACCUGUGUCAGGCUUUCUCUGAUGUAAUUCUUGCAGUAAAUGAUGUGGAUGCAGAAGAUGGAGCUGAUCCAAACCUUUGUAGUGAAUAUGUGAAAGAUAUUUAUGCUUAUCUGAGACAACUUGAGGAAGAGCAAGCAGUCAGACCAAAAUACCUACUGGGUCGGGAAGUCACUGGAAACAUGAGAGCCAUCCUAAUUGACUGGCUAGUACAGGUUCAAAUGAAAUUCAGGUUGUUGCAGGAGACCAUGUACAUGACUGUCUCCAUUAUUGAUCGGUUCAUGCAGAAUAAUUGUGUGCCCAAGAAGAUGCUGCAGCUGGUUGGUGUCACUGCCAUGUUUAUUGCAAGCAAAUAUGAAGAAAUGUACCCUCCAGAAAUUGGUGACUUUGCUUUUGUGACUGACAACACUUAUACUAAGCACCAAAUCAGACAGAUGGAAAUGAAGAUUCUAAGAGCUUUAAACUUUGGUCUGGGUCGGCCUCUACCUUUGCACUUCCUUCGGAGAGCAUCUAAGAUUGGAGAGGUUGAUGUCGAGCAACAUACUUUGGCCAAAUACCUGAUGGAACUAACUAUGUUGGACUAUGACAUGGUGCACUUUCCUCCUUCUCAAAUUGCAGCAGGAGCUUUUUGCUUAGCACUGAAAAUUCUGGAUAAUGGUGAAUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-178.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -196.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 183.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((.(((((((((..((....))....((((((((((.(.((..((((.((((.((((...)))))))).)))).(((((...)))))...........(((((((((.(.(((((((((((((.((((((((((((((((((....(((((........)))))..(((((((((((...((((..((((((((..(((.........((((..((....(((.((....)))))...))..)))).))).)))))).))....))))........)))))))))))((((((.((((...((..(.(((.(..((((.((....((..(((((((.....))))))).))..)).))))..)))))..)))))).)).)))))))))))))))))))...((((......))))....((((....(((((.....(((((.(((((.((....)).)))))..)))))....))))).....))))..(((((.(((...))))))))......))).)))))))).)))))).))))))..)))...)).).)))))).))))))))))))).).)))))).(........((.((((....((.((.((((...(((((((((.....))))))))).....))))......(((...((((((((((...)))))))..))).)))....)).))....)))).))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((((.(((((((((,.,{....|,....|{((((((((.{,((..((((.((((.((((...)))))))),)))).{(((,...,)))}......,,.,.((((((((({(.(((((((((((((.((({((((((((((((((....,{{{{....,{{{|,|||,.((,,,{||,,|}}.}}||,.((((({(,(((,.....{{,..,|||||((,..,({{.{(,...}}}}}.,,||,,}}...,})}}))))).}}.,,,}|||....},..}}}}}||||},{|{(((((({,,,,...,},}.))))))..,,,{{{{{(({.,,(((((.....{|||},,.,)},....,},)}))))))))))))),).}}}})))))))))))))))}...{(((......})))....{({{....((((((.(({.{..{..(((........)))..}..,.))))))))).||.....,,)))}..(((((.(((...))))))))......))).))))))))},)))).)))))))..))).,})).).))))))},)})))))))))).).)))))).(..,,{.,.{(.((((....{{.{{.((((...(((((((((.....))))))))).....))))||,,.,({{...{{{||{||||,..,}}}))}..))}.}}}....},.))....}))).}},,)