Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CD44_0003800
Sequence Length
255 nt
GC Content
0.4275
CUUUGAUGAGCACUAGUGCUACAGCAACUGAGACAGCAACCAAGAGGCAAGAAACCUGGGAUUGGUUUUCAUGGUUGUUUCUACCAUCAGAGUCAAAGAAUCAUCUUCACACAACAACACAAAUGGCUGGUACGUCUUCAAAUACCAUCUCAGCAGGCUGGGAGCCAAAUGAAGAAAAUGAAGAUGAAAGAGACAGACACCUCAGUUUUUCUGGAUCAGGCAUUGAUGAUGAUGAAGAUUUUAUCUCCAGCACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-55.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -59.77
Frequency: 0.0007
Diversity: 53.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((....)))).(((...)))(((.((((((((.((......(((((.......))))))).)))))))))))..))))))))(.......(((((((((..........((..(((((((((..........)))))((((((....))))))))))..)).......)))))))))..((..((((.((....))...))))..)).((..(((..(((((........)))))..)))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
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