Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CDKN2B-AS1_0000100

Sequence Length

2448 nt

GC Content

0.4506

AGCUACAUCCGUCACCUGACACGGCCCUACCAGGAACAGCCGCGCUCCCGCGGAUUCUGGUGCUGCUCGCGUCCCCGCUCCCCUAUUCCCCUUAUUUUAUUCCUGGCUCCCCUCGUCGAAAGUCUUCCAUUCUUCAAACUAGAUUAUUUAAAAAUGAAAAAGGAAGAAAGGAAAGCGAGGUCAUCUCAUUGCUCUAUCCGCCAAUCAGGAGGCUGAAUGUCAGUUUUGAACUAAAAGCCGCUCCGCUCCUCUUCUAGAUUUGGAAAACAAGCGAAAUUAAACUAAACCGCUGCACGCCUCUGACGCGACAUCUGGACACGGCGCGGCGCUGGCGCUGCCGGAGCUGUCGACCCGGCCUGGCGCCGGACUAGGACUAUUUGCCACGACAUUUCAAAGGAUUCCAAGAGAGAAUAUUGGUGUCCAUGCUGUGAUGAUUCCUCAGCUCCUCUCAUCUGAUCUCCGUCCUGGCCCCCAUGACUUUCUUUGUGGUAGUUAGGGUGUGGUAUGUGCCACUGAGGCCCACACCUAUUGCUGCAAUUUAUAGCACUGAUCUGUCAUCAAUACCACUUGCUGUCUUGGAUGUGAAGAUGAUUUUUCCUGCAGGGAUUCCCUCUACAAAAUUAAAAACACUGGGCAUGUGGAAAUAAUAUUCAUGCUUUAAAUUGUCUUUUCUCUUCACUACACCAGGGGUCCCCAACCCCUAGGCCACAGACUGUGGCCCUAGUGUAGUGAAUAGAAAAGACAAUUUAAAGCGUGAAUAUUAUUUCCUCAUGCCCAGUGUUUUUAAUUUUGUACUGGUCUGUGGCUUGUUAGAAACCAGGCUGCACAGCAGAAGGUGGGCAGCAGAUAUUGAGAAACCACAGAAAGAGAGAAGUUAAAUAAUUUUCCUGUCAAAGACCACAUCAAUGAUGAAGCCAGAAUUUGAGCUCAUGUACUUAACCACUGGACUACCUGCCUGCCCUGUCGAGGAACAGCUAAGUGUCCCUUUUGAUGAGAAGAAUAAGCCUCAUUCUGAUUCAACAGCAGAGAUCAAAGAAAAGACUUCUGUUUUCUGGCCACCAGAUAUAUGUUAUCUGUGCUUAAAGAAUUGAAAAACACACAUCAAAGGAGAAUUUUCUUGGAAAGAGAGGGUUCAAGCAUCACUGUUAGGUGUGCUGGAAUCCUUUCCCGAGUCAGUACUGCUUUCUAGAAGAAAACCGGGGAGAUCUAUUUGGAAUGUAUCUAACUCCAAAGAAACCAUCAGAGGUAACAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGACUGGUCUUGAACUCUCGACCUCGUGAUUCGCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGACACCACACCCGGCGGAUAGAGAGAAUUUUGACAGUCUCUCCAAUGAACGCCUUCACUGAUAUCCAAAGCAUGAAGGACACACCAGGGAAAAACAUAGACCUAACACAGGACAAAUGGAAUUAUUAGAAACAUUUUCUAGCAGAAGAACACUAUUCUGUUGCCAUUUGAAUCUUUGCUUCUUUCUAGGUUUGACAAUGAGCCUAUCAUAUAAGCCCAAAUGUAAACAGAAAGAGGUUGAAUCAGUCACGAUAAGCCCAAUUAUGCUGUGGUAACAAACAACCUCAAAAUCUCAUUGGCUUAAAAUAUACAGAAUUAUUCUUACUCAUGGCACAUAUCCAUCUAUCAUCUGCAGGGGAUCUGCUCACUGAAGUCACUUAGGAACUUGGACUGAUGGAACGGCCACUUUUUGGUCACUAUAUGUAUUAAUCUGUUUUAAUCCUGCUGAUAAAGACCCAAAAUUGGGAACAAAAAGAAGUUUAACUAGACUUACAGUUCCGCAUGGCUGAGGAGGCCUCAGAAUCAUGGUGGGAGGCGAAAGGCACUUCUUACAUGGUGGCAGCAAGAGAAAAAUGAGGAAGAAGCAAAAGCGGAAACCUCUGAUAAACCCAUCAGAUCUUAUGAGACUUAUUCCACUAUCAAGAGAAUAGCAUGGGAAAGACUGGCUCCCAUAAUUUACCUCCCUCUGGGUCCCUCCCUCAACAUGUGGGAAUUCUGGGAGAAACAAUUCAAGAUAUGACACAUUCAUAAUUUAAACAGAAGCCUACGAAGAACUCAUAAAUUAAAAGAAGAUAAUCUUUUCACAAGGUGAUGGAGGCUUUUUAUUUUGCCACAAAACCACUGGUGACGUUGCCUGUGGCCACCUUGGAGAAGACACUGGAGGCCUGGGACAUGGAGACUGCUUUUCUGCAGAAACCACAUCCCUUGGAGUAAUGAGCUACACCUACCUCAAUUAUUCAGUGCAGUACAACACUCCAGACAGGGUCUCACUCUGUCACCCAGGCUGGAGUGUAUUGGCAUGAUUACAGCUCACUGCAACCUUGAACUCCCAGGCUCAAACCUGAGCAGCUGGGACUACAGAUGCACCACCAUGCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-779.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -823.46

Frequency: 0.0000

Diversity: 545.8

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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