Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CDKN2B-AS1_0003400

Sequence Length

1852 nt

GC Content

0.4336

AUAUUGAGAAACCACAGAAAGAGAGAAGUUAAAUAAUUUUCCUGUCAAAGACCACAUCAAUGAUGAAGCCAGAAUUUGAGCUCAUGUACUUAACCACUGGACUACCUGCCUGCCCUGUCGAGGAACAGCUAAGUGUCCCUUUUGAUGAGAAGAAUAAGCCUCAUUCUGAUUCAACAGCAGAGAUCAAAGAAAAGACUUCUGUUUUCUGGCCACCAGAUAUAUGUUAUCUGUGCUUAAAGAAUUGAAAAACACACAUCAAAGGAGAAUUUUCUUGGAAAGAGAGGGUUCAAGCAUCACUGUUAGGUGUGCUGGAAUCCUUUCCCGAGUCAGUACUGCUUUCUAGAAGAAAACCGGGGAGAUCUAUUUGGAAUGUAUCUAACUCCAAAGAAACCAUCAGAGGUAACAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGACUGGUCUUGAACUCUCGACCUCGUGAUUCGCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGACACCACACCCGGCGGAUAGAGAGAAUUUUGACAGUCUCUCCAAUGAACGCCUUCACUGAUAUCCAAAGCAUGAAGGACACACCAGGGAAAAACAUAGACCUAACACAGGACAAAUGGAAUUAUUAGAAACAUUUUCUAGCAGAAGAACACUAUUCUGUUGCCAUUUGAAUCUUUGCUUCUUUCUAGGUUUGACAAUGAGCCUAUCAUAUAAGCCCAAAUGUAAACAGAAAGAGGUUGAAUCAGUCACGAUAAGCCCAAUUAUGCUGUGGUAACAAACAACCUCAAAAUCUCAUUGGCUUAAAAUAUACAGAAUUAUUCUUACUCAUGGCACAUAUCCAUCUAUCAUCUGCAGGGGAUCUGCUCACUGAAGUCACUUAGGAACUUGGACUGAUGGAACGGCCACUUUUUGGUCACUAUAUGUAUUAAUCUGUUUUAAUCCUGCUGAUAAAGACCCAAAAUUGGGAACAAAAAGAAGUUUAACUAGACUUACAGUUCCGCAUGGCUGAGGAGGCCUCAGAAUCAUGGUGGGAGGCGAAAGGCACUUCUUACAUGGUGGCAGCAAGAGAAAAAUGAGGAAGAAGCAAAAGCGGAAACCUCUGAUAAACCCAUCAGAUCUUAUGAGACUUAUUCCACUAUCAAGAGAAUAGCAUGGGAAAGACUGGCUCCCAUAAUUUACCUCCCUCUGGGUCCCUCCCUCAACAUGUGGGAAUUCUGGGAGAAACAAUUCAAGAUAUGACACAUUCAUAAUUUAAACAGAAGCCUACGAAGAACUCAUAAAUUAAAAGAAGAUAAUCUUUUCACAAGGUGAUGGAGGCUUUUUAUUUUGCCACAAAACCACUGGUGACGUUGCCUGUGGCCACCUUGGAGAAGACACUGGAGGCCUGGGACAUGGAGACUGCUUUUCUGCAGAAACCACAUCCCUUGGAGUAAUGAGCUACACCUACCUCAAUUAUUCAGUGCAGUACAACACUCCAGACAGGGUCUCACUCUGUCACCCAGGCUGGAGUGUAUUGGCAUGAUUACAGCUCACUGCAACCUUGAACUCCCAGGCUCAAACCUGAGCAGCUGGGACUACAGAUGCACCACCAUGCAUGGUACCAGAGAUAUAAUAAUGAGAAACAGACAUGCUCCCUCCCCUCAUUGAGGUUACAGCUUAGUGUGGAGACACACAGAUGCCUAACGCACUAUGGUAUGGAAGGUGCUAUGGACACAGUGCUCAAAUCCAUGAUCUACAUAGGUGGAGAACUUCAGUAGAGGAAGUGGCAGGAAUUUGGGAAUGAGGAGCACAGUGAUUAAACUGGGGCCAUUCAUAUGAGAGUUUAAGAACUCAGACCAGUGACUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-511.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -547.04

Frequency: 0.0000

Diversity: 383.65

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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