Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CDYL_0005500

Sequence Length

1097 nt

GC Content

0.5105

GUUGAAAGGAUUGUUGACAAAAGGAAAAAUAAAAAAGGGAAGACAGAGUAUUUGGUUCGGUGGAAAGGCUAUGACAGCGAGGACGACACUUGGGAGCCGGAACAGCACCUCGUGAACUGUGAGGAAUACAUCCACGACUUCAACAGACGCCACACGGAGAAGCAGAAGGAGAGCACAUUGACCAGAACAAACAGGACCUCUCCCAACAAUGCUAGGAAACAAAUCUCCAGAUCCACCAACAGCAACUUUUCUAAGACCUCUCCUAAGGCACUCGUGAUUGGGAAAGACCACGAAUCCAAAAACAGCCAGCUGUUUGCUGCCAGCCAGAAGUUCAGGAAGAACACAGCUCCAUCUCUCUCCAGCCGGAAGAACAUGGACCUAGCGAAGUCAGGUAUCAAGAUCCUCGUGCCUAAAAGCCCCGUUAAGAGCAGGACCGCAGUGGACGGCUUUCAGAGCGAGAGCCCUGAGAAACUGGACCCCGUCGAGCAGGGUCAGGAGGACACAGUGGCACCCGAAGUGGCAGCGGAAAAGCCGGUCGGAGCUUUAUUGGGCCCCGGUGCCGAGAGGGCCAGGAUGGGGAGCAGGCCCAGGAUACACCCACUAGUGCCUCAGGUGCCCGGCCCUGUGACUGCAGCCAUGGCCACAGGCUUAGCUGUUAACGGGAAAGGUACAUCUCCGUUCAUGGAUGCAUUAACAGCCAAUGGGACAACCAACAUACAGACAUCUGUUACAGGAGUGACUGCCAGCAAAAGGAAAUUUAUUGACGACAGAAGAGACCAGCCUUUUGACAAGCGAUUGCGUUUCAGCGUGAGGCAAACAGAAAGUGCCUACAGAUACAGAGAUAUUGUGGUCAGGAAGCAGGAUGGCUUCACCCACAUCUUGUUAUCCACAAAGUCCUCAGAGAAUAACUCACUAAAUCCAGAGGUAAUGAGAGAAGUCCAGAGUGCUCUGAGCACGGCCGCUGCCGAUGACAGCAAGCUGGUACUGCUCAGCGCCGUUGGCAGCGUCUUCUGUUGUGGACUUGACUUUAUUUAUUUUAUACGACGUCUGACAGAUGACAGGAAAAGAGAAAGCACUAAAAUGGCAGAAGCUAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-308.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -327.91

Frequency: 0.0000

Diversity: 342.13

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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