Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_CEP350_0019900
Sequence Length
1457 nt
GC Content
0.4365
GCACAACAGCAACGCCAUGAAAGAGACUUGGCCCUCUUGAAACUAAAGGCUGAACAAGAGGCUCUGGAGAGUCAGAGACAAUUAGAAGAAACCCGAAACAAAGCAGCUCAGGUCCAUGCAGAAUCAUUACAGCAGGUGGUUCAAUCACAACGGGAAGUAACUGAAGUCCUGCAGGAAGCAACGUGUAAAAUAGCAGCUCAGCAGUCAGAAACUGCUCGCCUCACCACAGACGCAGCACGUCAAAUCUGUGAGAUGGCAGAGUUGACUAGAACUCAUAUCUCAGAUGCUGUCGUGGCUUCAGGAGCUCCCCUUGCAAUACUGUAUGACCACCAACGGCAGCACCUUCCAGACUUUGUGAAACAGCUGAGGACCAGAACUGAAACAGAUAGGAAAAGUCCAUCUGUUUCACUCUCUCAGAGUAAAGAAGGGACCCUUGACUCAAAGCAUCAGAAGUAUUCUGCUUCAUAUGAUAGUUAUUCUGAGUCUUCAGGAUACAAGAAUCAUGAUAGAAGAAGUAGCAGUGGUAGCAGCCGCCAAGAAAGUCCUUCAGUUCCAUCUUGUAAGGAAAAUGAGAAGAAACUUAAUGGUGAAAAGAUAGAGAGUUCCAUUGAUGAACAGGUUCAGACUGCUGCAGAUGAUUCUCUACGAAGUGAUAGUGUUCCAUCUCUUCCUGAUGAAAAAGACUCAACGUCUAUUGCAACAGAAUAUUCUCUGAAAUUUGAUGAAUCCAUGACAGAAGAUGAAAUAGAAGAACAAUCAUUUCGAUCAUUACUACCUUCAGAGAGUCACCGCAGAUUUAACAUGGAAAAGAGAAGAGGUCAUCAUGAUGACUCUGAUGAAGAAGCUUCUCCAGAAAAAACUACACUGUCUACUGCCAAGGAACUGAACAUGCCAUUCUCAGGAGGACAAGAUAGCUUUUCUAAAUUUACUAUGGAGAUGGUUCGACAGUAUAUGAAAGAGGAAGAAAUGAGGGCAGCUCACCAGUCUUCACUCCUGCGUCUCCGUGAAAAGGCCUUGAAGGAGAAGACUAAGGCUGAAUUGGCCUGGUUAGAGCAUCAAAAAAAACAUCUACGAGACAAAGGAGAGGAUGAUAAAAUGCCCCCGCUCCGGAAGAAACAGCGUGGUUUGCUUUUAAGGUUGCAGCAAGAAAAGGCAGAAAUAAAACGUCUUCAAGAAGCCAAUAAGGCAGCUCGGAAGGAAAGACAGCUGAUUCUUAAACAGCAGGAGGAGAUAGAAAAGAUCCGACAGACCACCAUAAAACUACAGGAGAAAUUGAAGUCUGCAGGGGAGAGUAAAUUGGACUCUCAUAGUGAUGAUGAUACAAAGGAUAAUAAGGCAACCAGUCCUGGUCCAACUGACUUGGAGACCCGCAGUCCUUCUCCCAUUUCAAUCUCCAGCAGUGAAACUAGCAGCAUUAUGCAGAAACUGAAGAAAAUGAGAAGCCGCAUGGAUGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-367.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -398.23
Frequency: 0.0000
Diversity: 392.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...........((((...........))))(((((((...............)))))))((((((....))))))............................))(...((((((((.(..(((((......(((((((.........(((.......)))...(((((((((((.((((((((.............((((((.....)))))).((.((......)).)).))))))......(.(((((((...(((((......))))).))))))).).((((((((..((((.((((((((.(((.(((((((((..((((((((.((((.(((((......(((((......((.(((((((((((((.((((((((((.(((....)))))))))))))........((((.(((........))).))))..(((((((((((((...))))))...)))).))).))))).))))))))(((......))).))......)))))......))).)).))))........(((((((((((((.((((((.......))))))..........((((....((((((.(((((((((.(.(((((((.......)))((((.(.(((((((((.(((((((((..(((((((((((((((((.((.((.((((.....)))).)).)).)))...((((((........)).))))....)).)).)))))........))))))))))))))...............)))))))))).)))).)))).))))))...((((((...((((((.((....)))))))).....))))))........))).).))))))...)))).)))))))).....((.......))))))).(((.......)))..........)))...)))))..))))))).)).))).)))......(.(((((........((((((..((((..(((((.((((.......((((.(.....(((((.((((.....)))))))))....).))))........)).)))))))..)))))))))).......))))).)))))).))))..)).((((..(((((((((...((....))....)))))))))......))))((((.((..(((.....)))..))..))))....)))))))).))))).....))))))(((...........)))....)))))))...........(((((..(((((((......(((((((....(((((((.((((....))))........(((((.............))))))))))))..(((((((....))).)))).)))))))))))))))))))..((((....((.(((......)))))..)))).....)))))....).))))))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...........((((.,.......,.))))(((((((...,........,..)))))))((((({....})))))............................))(...((((((((.(..(((((......(((((((,..,,.{{,.(((,{((..((((((((({((({,,.,,..,{({,....{{({{(({{((((((.....)))))).(({,,..((({(({(.....})},...|}}}}|,||,|}}.|||||,.,,,.}}}}),),},,,,,,}|)))}.).))))))))..)))})){||}{{{((((((..({(({||..{(((,((,{({{{,..{{(((|,|,....,((({(((((({{,.{(((((((((.(((....))))))))))))},{{{,.,|||||.,{{{{{{,...|||{,|||..,,{{{{{(((((,...))))))..|||||.}||,|||||,}}}}))))|||,.....}))}}}...,,,)}}}}.,..{{|||.,,.))))}..,,...{{{{(((((((((.((((,{..,....,}|||}.....,,,..((((,...((((((.,((((((({,(.{({,(((.......)))((((.(.(((((((((.(((((((((..((((({{(((,{,,(((.((..{.((((.....)))).},.)}.}}}...,,{{{{||.....,}|,|,,,.}}}.,,})}}))}},....,,.})))})))))))))...............)))))))))}.)))).,}}}.})))))...((((((...((((((.((....)))))))).....))))))........,)}.,.))))))..})))).)))))))),...,||.,,,,..})})}}},||....}}}}})}....,,,},.}))}}}))))),.))))))).}}.,}}.|||,,...,(,((({{.,,,,...{|||||.{((((..(((({,((({.......((((.{|....((((,{((((.....)))))))))....).)))}........}},)))))))..))))),||}}.......}})}}|||||}}..{(({{.{{{{{{{,(((((((((...{{,,..|}....}}}}))}},.........{((((.((..(((.....)))..))..))))}.....}.)))).}))))....))),}}.||{..,........)))..,.)))))))...........(((({..{((((((.....,(((((((....{(((((({((({....}}}}.},.....(((((.....,.......)))))})))))}..{||||{|....))),)))),)))))))))))))))))))..((((....((.(((......)))))..)))).....}))))....).))))))))....}
Back