Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CHD7_0009500

Sequence Length

1280 nt

GC Content

0.4336

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Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-338.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -362.5

Frequency: 0.0000

Diversity: 258.1

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.((((((..(((.((((((.((........((((......))))..((..((.((((..........((((((...(((((((.(((((((......(((((((((((((((((((((.....)))))))))..........((((((((.(((.....))).((((((((((........((.((((.....((((.((.(((.((((.((.(((((((.....))))))...........).)).))))))))).)))).((((((((.((((((............))))))....)).))))))......))))...))..))))))))))))))))))((((((.((((......)))).....(((((...((((................))))..)))))((((((((((((((((......))).))))))))))))).....(((((....))))).))))))((((.(((((..(((((........))))).))))).))))((((...))))....))))))))))))...))))))).)))).....(((((((((.((.((((((((.(((((.(...(((..........)))...)..)))))...).))))))).)).))))).).)))))))))))).((((.(.(((((((((((((....((((....((((((....(((....)))...))))))....))))))))))).((((((.(.......).))))))...)))))).)))))...((((.(((....))).)))))))).))..))......)).)))))).)))))))))..))))...)((.(((.(((((((((((((((..(((((.(((((..((((..((.(((..(..(((...))).)..))).))..))))((((....))))(((((((((((((((((((..((((((((((((.(((((((.((((.((((......)))).))))..))).......)))).).)))))....(((.(((.(((.......)))...))).)))...((((((......))))))........))))))..))..))))))..........))))).))))))........(((....)))......))))))))))))))))..............))))))))).)))(((((((........).)))..)))..............((((((((((((.....)))))))..)))))..........))

Thermodynamic Ensemble Prediction

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