Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_CHD7_0012700

Sequence Length

317 nt

GC Content

0.4574

GCCAGUUUUGUUGCAUCUGGAAAUAGGACAGAUAUUUCCUUGGAUGAUCCAAAUUUCUGGCAAAAGUGGGCUAAGAAGGCUGAAUUGGAUAUUGAUGCCUUAAAUGGGAGGAACAACCUGGUUAUUGAUACUCCAAGAGUGAGAAAGCAGACCAGGCUCUACAGUGCAGUGAAGGAAGAUGAGCUGAUGGAGUUCUCAGACUUGGAAAGUGAUUCUGAAGAAAAGCCCUGUGCAAAGCCACGGCGUCCCCAGGAUAAGUCACAGGGCUAUGCAAGGAGUGAAUGUUUCAGGGUGGAGAAGAAUCUGCUUGUCUAUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-88.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -93.98

Frequency: 0.0001

Diversity: 78.58

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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