Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DENND2A_0001100

Sequence Length

548 nt

GC Content

0.5347

UUGGAAAGGUCUUUCAAGUUCAUGAGAGAAGCUGAGGACCAACUGAAGGCCAUUCCCCAGUUCUGUUUUCCCGAUGCCAAGGAUUGGGUUCCUGUCCAGCAGUUCACCAGUGAAACAUUCUCAUUUGUCUUAACUGGAGAAGAUGGGAGCAGAAGGUUCGGUUACUGCCGAAGACUGCUGCCUGGAGGCAAAGGGAAGCGCCUUCCUGAAGUUUACUGCAUUGUGAGCCGCCUGGGAUGCUUCAGCCUCUUUUCAAGGAUCUUGGAUGAGGUGGAAAAAAGACGAGGCAUCUCUCCUGCCCUGGUUCAGCCACUCAUGAGAAGUGUCAUGGAAGCCCCUUUCCCAGCCCUGGGCAAAACCAUCCUUGUCAAGAACUUCCUGCCAGGUUCAGGAACUGAGGUGAUCGAACUGUGCCGCCCGCUGGACUCCCGGCUCGAGCACGUGGACUUUGAGUCUCUCUUCUCCUCCCUCAGCGUCCGCCACCUGGUCUGUGUGUUUGCCUCCCUGCUUCUGGAGAGGAGGGUCAUCUUCAUUGCAGACAAGCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-187.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -194.52

Frequency: 0.0000

Diversity: 104.17

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((..((.(((((((......)))))))..)).....))))((((.((((....(((((((((...............)))))))))(((((.(((((((((((.(((((...(((........)))....))))).)))...((.(((((....((((((....))))))..))))).)).(((((((((.((((((((((....(..((((((......))))))..)..))).)))))).(((((..((((((...)))))).))))).......((((.((((((((((((((.((((((........((.(((.(((.(..((((..((((.............))))....)))))))).))).)).......))))))..)))))...))))))........((((((...(((((....))))).)).))))((((((.(((((...............))))).))))))..))).))))...).)))))))))))))...)))).))))))))).........((......))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((..((.(((((((......))))))}..)).....))))((((.((((....(((((((((,..........,...))))))))){((((.((((({(((((.(((((,{.(((........))).}}.))))).))}...((.(((((....((((((....))))))..))))).)).(((((((((.((((({(,,{{{{,{..((((((......))))))..|..)))}}))|||.(((((..((((((...)))))).))))).,,....{(((.((({(({(((((((.((((((...{....((.(((.(((.{..{{((..({{{........,....))))....)))))))).))).)}.....,,))))))..)))))...}})}}}........((((((...(((((....))))).)).))))((((((.(((((...............))))).)))))).,))).))}}...}.)))))))))}}))}.,}))).))))}))}}.........{{.,,...))))))