Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0007600
Sequence Length
683 nt
GC Content
0.4085
GUUUAAUUUUUAGAUAUCCAGAAGAGGACUAUGAGUCAUUUCCACUCUCAGAAUCAGAUGUACCUCUUUUCUGCCUUCCUAUGGGAGCUACUAUUGAGUGCUGGGAUCCUGAAACCAAAUAUCCACUUCCAGUUUUUUCAACUUUUGUCUUGACAGGUUCUUCAGCCAAAAAGGUAUAUGGAGCUGCCAUUCAGUUUUAUGAACCUUACUCUCGGGAACUUCUAUCAGAGAAACAGCUUAUGCACCUGGGCUUGUUGACGCCUGUGGAGAGAAAAAUGGUCUCCAAAUCCAUCAAUACAAACAAAUGCAUUUGUUUACUCUCACACUGGCCUUUUUUUGAAGCUUUUAGGAAAUUUCUUAUGUUUAUCUACAAACUUUCUGUGUCUGGACCACAUCCUCUUCCCAUUGAAAAGCACAUUUCACAUUUUAUGCAAAACAUCCCUUUUCCUUCACCACAAAGACCGAGAAUCCUUGUCCAGCUGUCAGUCCAUGAUGCAUUAAUAUUAUCACAGCCAGUUUCUACACCUUUACCACUAAGUGGAGCCAACUUUAGCACCUUGCUAAUGAAUCUGGGUCCUGAGAAUUGUGCAACACUGCUGCUCUUUGUUUUACUUGAGAGUAAAAUUCUGCUGCAUUCUCUUAGGCCAGCUGUCUUGACUGGGGUAGCUGAAGCUGUUGUAGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-149.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -164.32
Frequency: 0.0000
Diversity: 215.4
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...))))))...(((((((((((..(((.((.............)).)))...)).)))))..))))(((......)))((((((..(((((.(((((((...((............)).)))))))...)))))......((((((.((((((((.((.....(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))...)).))))))))...))).)))((((((((..((((((.((.........(((.((((((((....((((.........))))......(((((((....))))))).))))).))).)))((((....))))....(((((....))))).((((......))))....(((((((((((.(((............(((((......)))))........((...(((....(((((..((........))..)))))....)))...)))))..))))).))))))......(((..((((((((.(((.....((((((......))))))......((((((...)))))).))).)))((.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))).)))))..))))).)))).))..))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({....,||||,..,({(((((((((..{((,{{.........,.,,||.,}|,,.}}.}}))).})))),{{,,,...)))||{{{{..,{(({.(((((((...{(...............}))))))...}}}}}..,,{,{,{{{{,|((({{{{,||},...(((((.((((((((((.....)))))))))).))))).,|}},}))},,,)},.,,})},)|||(((({,{((({{({((({.,.,({,(((.((((((((....{(((.........))))......(((((({....})))))).))))).))).))),{{{....||||,...{((((,...,}}}},(({,....|,},,,...,{|{(,{{((({......,,,.......,((({.{....}}},,.......}}..,,,,,....|||||..,,........}|..|||,,..,,}))},}}},}}}}))))).),)))),..........{{{{{{(({(((.....,,,,,({,{...))))||.,....((((({...}))))).},..|}}|{.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..))))))))|||{||||{,,,}}}))))})),)))))))))))))))
Back