Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0010200
Sequence Length
1788 nt
GC Content
0.3949
GUAUAUGGAGCUGCCAUUCAGUUUUAUGAACCUUACUCUCGGGAACUUCUAUCAGAGAAACAGCUUAUGCACCUGGGCUUGUUGACGCCUGUGGAGAGAAAAAUGGUCUCCAAAUCCAUCAAUACAAACAAAUGCAUUUGUUUACUCUCACACUGGCCUUUUUUUGAAGCUUUUAGGAAAUUUCUUAUGUUUAUCUACAAACUUUCUGUGUCUGGACCACAUCCUCUUCCCAUUGAAAAGCACAUUUCACAUUUUAUGCAAAACAUCCCUUUUCCUUCACCACAAAGACCGAGAAUCCUUGUCCAGCUGUCAGUCCAUGAUGCAUUAAUAUUAUCACAGCCAGUUUCUACACCUUUACCACUAAGUGGAGCCAACUUUAGCACCUUGCUAAUGAAUCUGGGUCCUGAGAAUUGUGCAACACUGCUGCUCUUUGUUUUACUUGAGAGUAAAAUUCUGCUGCAUUCUCUUAGGCCAGCUGUCUUGACUGGGGUAGCUGAAGCUGUUGUAGCUAUGAUCUUUCCAUUUCAGUGGCAAUGCCCAUAUAUUCCCCUUUGUCCUCUUUCACUGGCUGCAGUGCUUAGUGCACCUUUACCAUUUAUAGUUGGAGUUGACUCAAGGUAUUUUGAUCUUCAUGACCCACCACAAGAUGUUGUUUGCAUUGACUUGGAUACGAACAUGUUAUAUGUAUCAGAUGAAAAGAAGAACAUGAACUGGAAGCAACUUCCCAAAAAGCCGUGCAAAAAUCUACUUAGCACCUUAAAGAAAUUGUAUCCCCAGCUGUCUUCAGUUCACCAAAAAACUCAAGAAGGCUCAGCGAUUGACAUGACUCCAAUUGAAGCAGAUUUCUCCUGGCAAAAGAAGAUGACACAGCUUGAGAUGGAAAUUCAAGAGGCAUUUUUGCGCUUUAUGGCGUCUAUUUUAAAAGGAUAUAGAACAUAUCUCAGACCAAUCACAGAGGCUCCUUCAAAUAAAGCCACAGCUGCUGAUUCAUUGUUUGACCGACAGGGAUUUUUAAAAAGUCGAGAUCGUGCCUAUGCAAAAUUCUAUACCCUUUUAUCCAAAACACAGAUUUUUAUUCGUUUCAUUGAAGAAUGCAGUUUUGUAAGUGAUAAAGAUACUGGAUUAGCAUUUUUUGAUGACUGCAUAGAAAAGUUGUUUCCUGAUAAAGGCACAGAGAAAACAGAUAAGGUUGAUUUUGAUUCAGCAGAAGAUACCAGAUUGAUAGAACUAGAUGAUUCACAGAAAAGUGAGCAUACUGUAUUUAUAAUGCCGCCAGAGCCACCUCCUGAUGAUGGAAAGGACCUGUCACCAAAGUACAGUUACAAAUACUUUCCAAGACUGGACCUUAAGCUUUUUGACAGACCGCAGGAGUUGAAACUUUGUUUUAGUAGACACCCUACUGGGAAUAGCAUUACAAAGAGUCCACCUCUCAUGGCUAAGAGAACUAAACAGGAAAUAAAAACAGCUCAUAAAUUGGCGAAGAGAUGUUAUACAAAUCCACCACAGUGGGCCAAGUGUCUGUUUAGUCAUUGUUACAGUUUAUGGUUUAUUUGUCUUCCGGCCUAUGUUAGAGUUUCUCAUCCUAAAGUCAGAGCACUUCAGCAGGCAUAUGAUGUACUUAUUAAGAUGAGGAAAACAGAUGUGGAUCCCUUAGAUGAGGUGUGCUAUCGAGUAGUGAUGCAGCUUUGUGGACUUUGGGGUCAUCCUGUUUUAGCAGUGAGAGUCUUAUUUGAAAUGAAAACUGCUAGGAUAAAGCCUAAUGCUAUUACUUAUGGUUAUUAUAAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-423.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -458.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 513.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((((.....)))))))))).))((((.((((.(...(((.((((((.(((((((((((((((.((((..(((..((((((.((((((((....((((.........))))......(((((((....))))))).))))).))).(((.(((((..(((((((((((...(((((((...(((((((((((((.(((.(((((((((.....))).........(((((......)))))......((((((((((((.............((..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...(((..((((((((.............((((((((((((((((...((((((...))))))......)))(.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))((((((((((....)))))))))).(((((...))))).......)))))))).)))))(((.................))).........))))))))..))).)))))))).)......))).))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))..)))))))......)))))))))...)))...)))...)))))))...))))).))...))))))))...)))..))))))))((((((((((.......((..(((...(((.((.((((.(.((((((((((((((........))))...))))(((...((((((.........)))))).))).....(((.((......)).)))....)))))).).)))).)).))))))..)))))))))))).....)))))).....(((((((.(((((((......((((((.((((((((.((((...........))))....))).)))))....))))))((....))((((((.........)))))).(((....)))...))))))).)))))))..)))..).))).............(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).))))))....))))))))))))))))))...).))))...(((((((((((((.......))))).......(((..((((.((((((..((((((((.((...((((..(((..(((((((.....(((((....(((((((((((((...(((((((....(((.((.........)).)))....)))))))((((((((((.((((((...(((((.......(((.((.......(((((((((((.....)))))))....)))).......)).)))...((((........))))(((((((((........((((.(((.............))).))))((((...(((((....)))))....)))))))))))))...))))).)))))).))))))...))))...((.(((((((....(((((((((.(((.....(((.((.(((.........))).)).))).))).)))))))))....)))))))...))))))..)))))).)))..)).)))..)))))))...)))..))))))))))))))..)))))).))))..).))))))))))..((((.(((((.((((.((((((.....))).)))))))))))).))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((((((((((.....)))))))))).))((((.((((.,...(((.((((((.(((((((((((((((,{(((((((...((.(((.((((((((....((((.........))))......(((((({....})))))).))))).))).))).|||,...,}}|}||,|||}.....,||,..{({{....||},|,..(((((((.((((.....,{{{{{,.....(((({......|}||}...,,.((((((((((((.............{{..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...({{..((((((((.............(((((((((((({{({.,.((((((...}))))).|....}}|{.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..)))))))}(((((({(({....}))))))))).(((({...})))).......,))))))).))))).,,.,.......,........}}.........))))))))..))).)))))))).,......})}.))))))))).......)))))..))))).))))..))...........)))))}.,)))))).,,...|((((({{.{{{{{{...,,|.{{..,,))....,,,))}))}..,,(((({...))))}.,..|||,.((((,{,.......,,.)))),,,...,...}}}}}}}}..((((,((((.((((........)))).}))).)))}..,{{{{{{.......,,||}}|},{||.{...{{{.{{,.....)).))),,...,.)))}}})}))}}..,}})))}}),|,...,||{|{....))))),.....(((((((.(((((({..,,,,(({(((.{(((((((.((((...........))}}....))).))}}}...,)))))}{(....})((((({....,}}}}}}}}}|,{((....}},...})))))).)))))))})))..})})))}............(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).))))))...,)))))))))))))))))),..,.)))).....,,,..(((,,,{{{{{..,...)})))...}))..|||,,{{{{{{.,((((,((({(......||}}|||}.||||,|||||,,(((({.,,,((((((((((((,.,.{((((((,..{(((,{,....|||,,}}........))))}}|{{{{{||{{{.{{{{{{...{{{{||.{||,,||||,||,..{||{{({{({((({...,,|}}}}))),.||{{{,,||,,}|{,||||,||||,.|}|{{.,|,|,{{((((((({,..,...,,,{{({({{,,,,{{{,,..||,.|||,,,{|,..{((((....)))))....,)})))))))}))}.})))}},)))))),))))}}.,,))})},,{{.({{((((....(((((((((.({{{((,{,.({,{,,,,..,,}}...}}}}},,}}}.})}.)))))))))..,.})))))).,}}}}}))..)))))).))).,}}.})}}}))))))),,,}))}}}))))))))))}}}.{||||(((((((.....((......)}.......)))))))))))}.,,|,|||||||||.....})))),}))},..))))
Back