Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DENND4C_0015800
Sequence Length
1517 nt
GC Content
0.4054
AUCAGAUGAAAAGAAGAACAUGAACUGGAAGCAACUUCCCAAAAAGCCGUGCAAAAAUCUACUUAGCACCUUAAAGAAAUUGUAUCCCCAGCUGUCUUCAGUUCACCAAAAAACUCAAGAAGGCUCAGCGAUUGACAUGACUCCAAUUGAAGCAGAUUUCUCCUGGCAAAAGAAGAUGACACAGCUUGAGAUGGAAAUUCAAGAGGCAUUUUUGCGCUUUAUGGCGUCUAUUUUAAAAGGAUAUAGAACAUAUCUCAGACCAAUCACAGAGGCUCCUUCAAAUAAAGCCACAGCUGCUGAUUCAUUGUUUGACCGACAGGGAUUUUUAAAAAGUCGAGAUCGUGCCUAUGCAAAAUUCUAUACCCUUUUAUCCAAAACACAGAUUUUUAUUCGUUUCAUUGAAGAAUGCAGUUUUGUAAGUGAUAAAGAUACUGGAUUAGCAUUUUUUGAUGACUGCAUAGAAAAGUUGUUUCCUGAUAAAGGCACAGAGAAAACAGAUAAGGUUGAUUUUGAUUCAGCAGAAGAUACCAGAUUGAUAGAACUAGAUGAUUCACAGAAAAGUGAGCAUACUGUAUUUAUAAUGCCGCCAGAGCCACCUCCUGAUGAUGGAAAGGACCUGUCACCAAAGUACAGUUACAAAUACUUUCCAAGACUGGACCUUAAGCUUUUUGACAGACCGCAGGAGUUGAAACUUUGUUUUAGUAGACACCCUACUGGGAAUAGCAUUACAAAGAGUCCACCUCUCAUGGCUAAGAGAACUAAACAGGAAAUAAAAACAGCUCAUAAAUUGGCGAAGAGAUGUUAUACAAAUCCACCACAGUGGGCCAAGUGUCUGUUUAGUCAUUGUUACAGUUUAUGGUUUAUUUGUCUUCCGGCCUAUGUUAGAGUUUCUCAUCCUAAAGUCAGAGCACUUCAGCAGGCAUAUGAUGUACUUAUUAAGAUGAGGAAAACAGAUGUGGAUCCCUUAGAUGAGGUGUGCUAUCGAGUAGUGAUGCAGCUUUGUGGACUUUGGGGUCAUCCUGUUUUAGCAGUGAGAGUCUUAUUUGAAAUGAAAACUGCUAGGAUAAAGCCUAAUGCUAUUACUUAUGGUUAUUAUAAUAAGGUAGUCUUGGAGAGCCCGUGGCCUAGCAGUACCCGCAGUGGUAUUUUCUUAUGGACGAAGGUACGGAAUGUGGUACGUGGCUUGGCACAGUUUAGGCAGCCGCUUAAAAAGACUGUGCAAAGGUCACAGGUCUCCUCAAUAUCAGCUCUUCAAAAUGUCACAGGUGGAAGUGAUGGGGACACGGUGAGCCACGGUAGUGUGGAUAGUUCUAAUGAUGCUAACAAUGGGGAGCACACAGUCUUCGUCAGAGAUUUAAUCAGGCUUGAGUCCAUUGAUAAUCACUCUAGCACAGGUGGUCAGUCUGACCAAGGAUACGGGUCUAAGGAUGAACUUAUAAAGGAUGAUGCAGAAAUUCAUGUGCCUGAAGAACAGGCAGCAAGAGAAUUGAUAACUAAAACAAAAAUGCAAACAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-384.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -414.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 368.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((................))).(((((((...)))))..........((((...((((....((((((((..(((..((((((((..((((.((((.((((........)))).)))).)))).((.(((((.((.(((((......((((.((((((((.((((....((((((........((((((((((...((((((((((....))).)))).)))..))))))))))..((((((.....)))))).....(((((.....((((...........))))....(((((((.(((.....)))((....))............((((((((((.((((........((((.....((((((((..(((((.(..(((((((.((..(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).)).)))))))..))))))...)))))))).....))))........))))))))))))))))))))).........))))).((((((((.....((((((.....(((.((.((((((..........((.(((..((..((.((((.(((((((...(((((((.(((...((((((((.......((((((((((((..(((((((((((((((......)).)))))))....((((((((((((((...(((....))).....((((.(((((((.....(((((((.(((((........(((((((.........(((.(((((((((((((.((......((((...(((((....)))))....))))........)).))))..))))))))))))(((((((.((((.((((..(((.((((((((.((......)).)))).)))).)))))))...(((((....)))))......)))).)))))))..((((((..(((((((((.(((.((((.....))))))))))))))...))..)))))).)))))))))))).))))))).))).)))).))))....))))))))))))))..(((((((((.....)))).)))))...))))))))))))))))))...(((.((.(((.(((((.(((.(.((((((((........)))))))).)..))))))))...))).)))))..(((((((....)))))))..))))))))...))).)))))))))).....................)))))))).))..))..)))))..)))))).))))).....)))))))))))))).((.((((..(....)..))))))..))))))))))))))...))))..)))))))))...)).))))).))..........((((((...)))))).)))))))).))))))).))..))......))))..))))..(((((.((((((((.....)))))).))...)))))...........................))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((,.............,{{|||.,,(((((...))))).........,((({...{{{{..,,,||{((({..,({..((((((((..{(((,((((.((((........)))).}))).)))}.{{.(((((.({,(((((......((((.(((((((,{((((....((((((........((((((((((...,{{{((((({....})},)))).})}..)))))))))}..((((((.....)))))).....{{{{{...,.((((...........)))).,..(((((((,((,.{,{{||,{,,,,,}}}|,,,,.....{((((((((({.((((,,......((((.....((((((((..(((((.,..(((((((.,(,.(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).,),)))))))..})))))...)))))))).....)))).....,,.))))}))))))))))))))))..,......}}}}}.((((((({....,((((((..,..(((.((.((((((........,,((.(((..{({{((,,((({((,(((,..((((((((.(((...((((((((.......((((((((((((..(((((({((((((((......,}})))))))....((((((((((((((...(((....))).....((((.(((({((.....(((((((.(((({,......,(((((((.........{((,({(((((((((((,((,{,...,.{{,..{((((....))))}....,}}},||,...,}}.})}}..))))})})))),,||||||,|||{.|||..|{||.||||{{{{,(({,{{,,{{,||||,||||,|}}}}||.,.{{{{{,.|,|||}}..,}}|)}}}.}||}}}},,{{{{||,.|{{|||{{{,|({.{({{.....))))))}))))))).,,)),,)))))}.)))))))))))).})))))),}},.}))).))))....))))))))))))))..{{{{(((((.....))))},})))...))))))))))))))))))...{{{(((.(((.((({({(((.{.((((((((........)))))))).}..))))))))...))).))),)..(((((((....)))))))..))))))))...))).)))))))).,}),.}}}}}}...........,,,,,)))}))..,)..))))).,)))))).)))))..,..)))))))))))))).{{.((((..(....)..))))},..))))))))))))))...))))..))))))))}...}}.})))).}},.......,,{(((({...}))))}.)))))))).)))}))}.}}..}},.....))}}..)))}..,,|||,||{(((((.....))))),,||...,,,}},................}},........,
Back