Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DENND4C_0023100

Sequence Length

1207 nt

GC Content

0.4134

GAAGAAACUAAUAGAGACUACAGCUUCCCAGCUGGCCUAGAAGACCAUAUUUUGGGGGAGAAUAUAUCGCCUAACACAAGUAUCUCAGGGUUGGUCCCCAGUGAACUUACCCAGAGCAACACAAGUCUUGGCAGUAGCAGCAGUAGUGGAGAUGUAGGAAAACUGCAUUAUCCAACAGGUGAAGUUCCAUUUCCAAGAGGCAUGAAAGGGCAAGACUUUGAAAAAUCAGAUCAUGGUUCUUCUCAAAAUACCAGCAUGUCUAGCAUCUAUCAGAAUUGUGCAAUGGAGGUUUUGAUGUCCAGUUGUUCACAGUGUAGAGCUUGUGGAGCUUUAGUUUAUGAUGAAGAAAUUAUGGCUGGAUGGACAGCAGAUGACUCAAAUUUGAAUACAGCUUGUCCAUUCUGUAAAAGCAACUUCUUGCCUCUUCUCAAUAUAGAAUUCAAAGAUUUGAGAGGUUCUGCAAGCUUUUUCCUGAAACCAAGUACCUCUGGUGACAGUUUACAAAGUGGAAGCAUUCCAUUGGCAAAUGAAUCCUUGGAGCACAAACCUGUAUCCAGUUUAGCAGAACCUGACUUGAUCAACUUUAUGGACUUCCCAAAACAUAACCAGAUCAUAACUGAAGAAACAGGCUCUGCAGUUGAACCAAGUGAUGAAAUAAAGAGAGCCAGUGGAGAUGUCCAAACUAUGAAAAUUUCAUCUGUGCCUAAUAGUUUAUCAAAGCGAAAUGUGUCUUUGACUCGAAGUCACAGUGUUGGAGGCCCAUUGCAGAAUAUUGACUUUACCCAGCGACCGUUUCAUGGCAUCUCAACAGUUAGUCUUCCAAAUAGUCUGCAGGAAGUUGUGGAUCCUUUAGGAAAAAGACCCAAUCCUCCCCCUGUUUCUGUGCCCUACUUGAGUCCUCUAGUACUCCGUAAAGAACUUGAAUCUUUGCUAGAAAAUGAAGGUGAUCAGGUGAUUCAUACAUCUUCUUUCAUCAAUCAACAUCCAAUCAUUUUCUGGAACCUCGUUUGGUAUUUCAGACGUUUGGACCUUCCUAGUAACUUGCCAGGACUUAUCCUCACAUCUGAACAUUGUAAUGAAGGUGUACAGCUUCCUCUGUCAUCUCUGUCCCAGGAUAGCAAACUUGUGUAUAUUCAGCUGUUAUGGGAUAAUAUCAACCUUCAUCAGGAACCAAGAGAACCUCUGUAUGUCUCAUGGAGGAAUUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-314.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -337.28

Frequency: 0.0000

Diversity: 302.24

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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