Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DENND4C_0025300

Sequence Length

625 nt

GC Content

0.4128

CUUUUUCCUGAAACCAAGUACCUCUGGUGACAGUUUACAAAGUGGAAGCAUUCCAUUGGCAAAUGAAUCCUUGGAGCACAAACCUGUAUCCAGUUUAGCAGAACCUGACUUGAUCAACUUUAUGGACUUCCCAAAACAUAACCAGAUCAUAACUGAAGAAACAGGCUCUGCAGUUGAACCAAGUGAUGAAAUAAAGAGAGCCAGUGGAGAUGUCCAAACUAUGAAAAUUUCAUCUGUGCCUAAUAGUUUAUCAAAGCGAAAUGUGUCUUUGACUCGAAGUCACAGUGUUGGAGGCCCAUUGCAGAAUAUUGACUUUACCCAGCGACCGUUUCAUGGCAUCUCAACAGUUAGUCUUCCAAAUAGUCUGCAGGAAGUUGUGGAUCCUUUAGGAAAAAGACCCAAUCCUCCCCCUGUUUCUGUGCCCUACUUGAGUCCUCUAGUACUCCGUAAAGAACUUGAAUCUUUGCUAGAAAAUGAAGGUGAUCAGGUGAUUCAUACAUCUUCUUUCAUCAAUCAACAUCCAAUCAUUUUCUGGAACCUCGUUUGGUAUUUCAGACGUUUGGACCUUCCUAGUAACUUGCCAGGACUUAUCCUCACAUCUGAACAUUGUAAUGAAGGUGUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-140.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -152.1

Frequency: 0.0000

Diversity: 151.96

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(......(((..((((........))))..))).......(((((((...))))))).((..((((((..((((.(((((...(((....)))....(((((.((((.(((((((....(((((............)))))...))))).......))...)))).))))).............((((((((......((....((((....))))..))......)))))))))))))))))..))))))....))....((((.(((((...))))).))))..)(((.(.((((((((((............((((.(((((..(((((..(((((...(((((...((((((((((..((((((((....))))))))..))).)))...))))............)))))...)))))......((((........)))).(((((((.......))))))).(((((((((.((((((..(((((...............))))).))))....))..)))))))))))))).))))).)))).((((((.((..(((...((((.(((...))).))))....)))..)).))))))...)))))))..))).).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((({{{(((,,((({.,......))))..}||,,,.,,.{{((({.{({((((((((((...,..((((((((..((,,,,.{((....))),},.(((((.((((.{{(((((....(((((............)))))...))))).......}}...)))).))))).,.})..))))).)))............)))))))))}}}})}}}.,}},||{|,,,})))}|,{{{{,.....{{{{....}}}}((((((.(((.(((....(((((((..{({(((,,..,,},,}})},.,,..)))))))...))).)))))))))..|||||...{{{{{...{{{{{{{{,,..((((((((....))))))))..))),)))},}))}}............}}}},.,,|||||,{.,..((((......}.)}}}.(((((((.......))))))){(((((((((.(((({{..(((((...............))))).}}}}...,)}..)))))))))),.((({{{{{.}}}..((((((.((..(((...((((.(({...})).))))....)))..)).))))))..,...})}),}))}))))))